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Gen

NPIPB12

nuclear pore complex interacting protein family member B12

Resumen

Localización citogenética
16p11.2
Coordenadas
Cromosoma 16: 29.483.534–29.506.408 (GRCh38)
Exones
8 exones en 22,9 kb
Proteína
928 aminoácidos
Transcrito MANE Select
ENST00000550665.6NM_001395931.1
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún NPIPB12. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de NPIPB12

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 16, con un corchete donde se ubica NPIPB12. NPIPB12 y 23 genes cercanos en el cromosoma 16, desde 28.994.971 hasta 29.994.970.Cromosoma 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329 Mb29,2 Mb29,4 Mb29,6 Mb29,8 MbNPIPB11: 29.381.310–29.406.711, hebra inversaNPIPB11BOLA2-SMG1P6: 29.443.230–29.454.651, hebra inversaBOLA2: 29.453.587–29.455.012, hebra inversaBOLA2SLX1B: 29.454.501–29.458.223, hebra directaSLX1BSULT1A4: 29.458.993–29.464.979, hebra directaSULT1A4NPIPB12: 29.483.534–29.506.408, hebra inversaNPIPB12SPN: 29.662.957–29.670.876, hebra directaSPNQPRT: 29.662.957–29.698.704, hebra directaQPRTC16orf54: 29.742.463–29.746.079, hebra inversaC16orf54ZG16: 29.760.591–29.783.885, hebra directaZG16KIF22: 29.790.137–29.805.388, hebra directaKIF22MAZ: 29.805.637–29.811.176, hebra directaMAZPRRT2: 29.811.382–29.815.892, hebra directaPRRT2: 29.812.261–29.820.092, hebra directaPAGR1: 29.816.086–29.822.489, hebra directa: 29.817.239–29.830.627, hebra directaMVP: 29.820.394–29.848.039, hebra directaCDIPT: 29.857.474–29.863.414, hebra inversaCDIPTSEZ6L2: 29.871.159–29.899.582, hebra inversaSEZ6L2ASPHD1: 29.900.363–29.919.864, hebra directaASPHD1KCTD13: 29.903.877–29.926.236, hebra inversaKCTD13TMEM219: 29.940.885–29.973.052, hebra directaTMEM219TAOK2: 29.973.675–29.992.262, hebra directaTAOK2HIRIP3: 29.992.314–29.996.126, hebra inversaHIRIP3Diagrama de NPIPB12: 8 exones en la hebra inversa del cromosoma 16Exón 8: 29.483.534–29.485.833, 2300 basesExón 7: 29.487.194–29.487.229, 36 basesExón 6: 29.487.339–29.487.399, 61 basesExón 5: 29.491.467–29.491.662, 196 basesExón 4: 29.491.775–29.491.874, 100 basesExón 3: 29.495.479–29.495.607, 129 basesExón 2: 29.505.473–29.505.630, 158 basesExón 1: 29.505.784–29.506.408, 625 bases864215′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 3,6 kb de los 22,9 kb del gen; 2787 de esas bases codifican la proteína.

Secuenciación de NPIPB12

100Difícil

Lo difícil que es secuenciar NPIPB12 con lecturas cortas, sobre 100

Gran parte de NPIPB12 se encuentra en zonas donde las lecturas cortas pueden pasar por alto o colocar mal un cambio.

Lo que suma: la proporción de los exones de NPIPB12 en cada tipo de región difícil

  • Mapeabilidad100 %
  • Homología100 %
  • Shared with chrY0 %
  • Cobertura de referencia0 %
  • Repeticiones58 %
  • Contenido GC0 %

Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle, del NIST.Cómo se puntúa

Enlaces externos

De dónde procede

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen NPIPB12: nuclear pore complex interacting protein family member B12. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/npipb12

Vancouver

Dante Labs. Gen NPIPB12: nuclear pore complex interacting protein family member B12 [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/npipb12

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