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Gen

NPIPB12

nuclear pore complex interacting protein family member B12

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
16p11.2
Koordinaten
Chromosom 16: 29.483.534–29.506.408 (GRCh38)
Exons
8 Exons über 22,9 kb
Protein
928 Aminosäuren
MANE-Select-Transkript
ENST00000550665.6NM_001395931.1
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet NPIPB12 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von NPIPB12

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 16, mit einer Klammer, an der NPIPB12 liegt. NPIPB12 und 23 Gene in der Nähe auf Chromosom 16, von 28.994.971 bis 29.994.970.Chromosom 1616p11.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.329 Mb29,2 Mb29,4 Mb29,6 Mb29,8 MbNPIPB11: 29.381.310–29.406.711, Minus-StrangNPIPB11BOLA2-SMG1P6: 29.443.230–29.454.651, Minus-StrangBOLA2: 29.453.587–29.455.012, Minus-StrangBOLA2SLX1B: 29.454.501–29.458.223, Plus-StrangSLX1BSULT1A4: 29.458.993–29.464.979, Plus-StrangSULT1A4NPIPB12: 29.483.534–29.506.408, Minus-StrangNPIPB12SPN: 29.662.957–29.670.876, Plus-StrangSPNQPRT: 29.662.957–29.698.704, Plus-StrangQPRTC16orf54: 29.742.463–29.746.079, Minus-StrangC16orf54ZG16: 29.760.591–29.783.885, Plus-StrangZG16KIF22: 29.790.137–29.805.388, Plus-StrangKIF22MAZ: 29.805.637–29.811.176, Plus-StrangMAZPRRT2: 29.811.382–29.815.892, Plus-StrangPRRT2: 29.812.261–29.820.092, Plus-StrangPAGR1: 29.816.086–29.822.489, Plus-Strang: 29.817.239–29.830.627, Plus-StrangMVP: 29.820.394–29.848.039, Plus-StrangCDIPT: 29.857.474–29.863.414, Minus-StrangCDIPTSEZ6L2: 29.871.159–29.899.582, Minus-StrangSEZ6L2ASPHD1: 29.900.363–29.919.864, Plus-StrangASPHD1KCTD13: 29.903.877–29.926.236, Minus-StrangKCTD13TMEM219: 29.940.885–29.973.052, Plus-StrangTMEM219TAOK2: 29.973.675–29.992.262, Plus-StrangTAOK2HIRIP3: 29.992.314–29.996.126, Minus-StrangHIRIP3Diagramm von NPIPB12: 8 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 16Exon 8: 29.483.534–29.485.833, 2.300 BasenExon 7: 29.487.194–29.487.229, 36 BasenExon 6: 29.487.339–29.487.399, 61 BasenExon 5: 29.491.467–29.491.662, 196 BasenExon 4: 29.491.775–29.491.874, 100 BasenExon 3: 29.495.479–29.495.607, 129 BasenExon 2: 29.505.473–29.505.630, 158 BasenExon 1: 29.505.784–29.506.408, 625 Basen864215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 3,6 kb der 22,9 kb des Gens aus; 2.787 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von NPIPB12

74Schwer

Wie schwer sich NPIPB12 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Ein großer Teil von NPIPB12 liegt in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Dazu kommt der Anteil der Exons von NPIPB12 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability100 %
  • Homologie100 %
  • Wiederholungen58 %
  • GC-Gehalt0 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). NPIPB12-Gen: nuclear pore complex interacting protein family member B12. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/npipb12

Vancouver

Dante Labs. NPIPB12-Gen: nuclear pore complex interacting protein family member B12 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/npipb12

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