Gen
KRTAP25-1
keratin associated protein 25-1
- HGNC 34003↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000232263↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 100131902↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 21q22.11
- Coordenadas
- Cromosoma 21: 30.289.145–30.289.514 (GRCh38)
- Exones
- 1 exón en 0,4 kb
- Proteína
- 102 aminoácidos
- También conocido como
- KAP25.1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000416044.1NM_001128598.1
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Estructura de KRTAP25-1
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 0,4 kb de los 0,4 kb del gen; 309 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de KRTAP25-1
1Baja
Dificultad de secuenciar KRTAP25-1 con lecturas cortas, sobre 100Cada barra es la proporción de las bases de exones de KRTAP25-1 que se encuentran en ese tipo de región difícil. La puntuación las pondera según el coste de cada una para una llamada con lecturas cortas: 0 cuando ninguna base está en ninguna, 100 cuando todas las bases están en todas ellas.
- MapeabilidadTramos donde las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser incorrecta. Peso 35 %.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o superior. Peso 30 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y series de una sola base, en las que las lecturas se deslizan y pueden no abarcarlas. Peso 15 %.4,9 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, zonas que la preparación de biblioteca cubre escasamente. Peso 10 %.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos en el ensamblaje de referencia cercano, donde no hay secuencia a la que alinear las lecturas. Peso 10 %.0 %
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
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Dante Labs. (s. f.). Gen KRTAP25-1: keratin associated protein 25-1. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/krtap25-1
Dante Labs. Gen KRTAP25-1: keratin associated protein 25-1 [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/krtap25-1
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