Gene
KRTAP25-1
keratin associated protein 25-1
- HGNC 34003↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000232263↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 100131902↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 21q22.11
- Coordinate
- Cromosoma 21: 30.289.145–30.289.514 (GRCh38)
- Esoni
- 1 esone su 0,4 kb
- Proteina
- 102 amminoacidi
- Noto anche come
- KAP25.1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000416044.1NM_001128598.1
- Tipo di locus
- Codificanti per proteine
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Nessun report del Genome Test legge ancora KRTAP25-1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di KRTAP25-1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 0,4 kb dei 0,4 kb del gene; 309 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di KRTAP25-1
1Bassa
Quanto è difficile sequenziare KRTAP25-1 con letture corte, su 100Ogni barra indica la quota di basi degli esoni di KRTAP25-1 che si trovano in quel tipo di regione difficile. Il punteggio le pondera in base a quanto ciascuna pesa su una chiamata con letture corte: 0 quando nessuna base si trova in una regione di questo tipo, 100 quando ogni base si trova in tutte.
- MappabilitàTratti in cui le letture da 100 o 250 bp non possono essere collocate in modo univoco, quindi una chiamata in quelle zone potrebbe mancare o essere errata. Peso 35%.0%
- OmologiaDuplicazioni segmentali: copie altrove nel genoma, come paraloghi e pseudogeni, con identità del 90% o superiore. Peso 30%.0%
- RipetizioniRipetizioni in tandem e sequenze di una stessa base ripetuta, su cui le letture tendono a scivolare e che potrebbero non essere coperte per intero. Peso 15%.4,9%
- Contenuto di GCFinestre con meno del 25% o più del 65% di G e C, che la preparazione della libreria copre con difficoltà. Peso 10%.0%
- Copertura di riferimentoLacune nell'assemblaggio di riferimento vicine, dove non c'è una sequenza a cui le letture possano allinearsi. Peso 10%.0%
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene KRTAP25-1: keratin associated protein 25-1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/krtap25-1
Dante Labs. Gene KRTAP25-1: keratin associated protein 25-1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/krtap25-1
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