Gen
GYG2
glycogenin 2
- HGNC 4700↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000056998↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 8908↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- Xp22.33
- Coordenadas
- Cromosoma X: 2.828.930–2.882.818 (GRCh38)
- Exones
- 11 exones en 53,9 kb
- Proteína
- 470 aminoácidos
- También conocido como
- GN-2
- Transcrito MANE Select
- ENST00000398806.8NM_001079855.2
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Ningún informe de Genome Test lee aún GYG2. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.
Estructura de GYG2
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 3,2 kb de los 53,9 kb del gen; 1413 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de GYG2
4Fácil
Lo difícil que es secuenciar GYG2 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Casi todos los exones de GYG2 se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.
Lo que suma: la proporción de los exones de GYG2 en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Peso 35 %.1,3 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o más. Peso 30 %.10 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y que puede que no abarquen. Peso 15 %.1,1 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma deficiente. Peso 10 %.5,7 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia con la que las lecturas puedan alinearse. Peso 10 %.0 %
Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle, del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de los exones de GYG2 que se encuentran en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo por sí solo puede hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen GYG2: glycogenin 2. Consultado el 18 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/gyg2
Dante Labs. Gen GYG2: glycogenin 2 [Internet]. [citado 18 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/gyg2
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