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Gen

SPATA22

spermatogenesis associated 22

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
17p13.2
Koordinaten
Chromosom 17: 3.440.019–3.471.819 (GRCh38)
Exons
9 Exons über 31,8 kb
Protein
363 Aminosäuren
Auch bekannt als
NYD-SP20
MANE-Select-Transkript
ENST00000572969.6NM_001170698.2
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SPATA22 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SPATA22

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 17, mit einer Klammer, an der SPATA22 liegt. SPATA22 und 29 Gene in der Nähe auf Chromosom 17, von 2.955.919 bis 3.955.918.Chromosom 1717p13.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.33 Mb3,2 Mb3,4 Mb3,6 Mb3,8 MbRAP1GAP2: 2.755.629–3.037.741, Plus-StrangRAP1GAP2OR1D5: 3.062.669–3.063.607, Minus-StrangOR1D5OR1D2: 3.088.484–3.104.422, Minus-StrangOR1D2OR1G1: 3.126.610–3.127.551, Minus-StrangOR1G1OR1P1: 3.153.890–3.154.882, Minus-StrangOR1P1OR1A2: 3.197.519–3.198.448, Plus-StrangOR1A2OR1A1: 3.207.539–3.218.896, Plus-StrangOR1A1OR3A2: 3.276.177–3.386.328, Minus-StrangOR3A2OR3A1: 3.291.017–3.298.360, Minus-StrangOR3A1OR1R1: 3.385.930–3.386.874, Plus-StrangOR1R1OR1E1: 3.397.104–3.398.410, Minus-StrangOR1E1OR3A3: 3.411.370–3.424.070, Plus-StrangOR3A3OR1E2: 3.432.870–3.433.841, Minus-StrangOR1E2SPATA22: 3.440.019–3.471.819, Minus-StrangSPATA22ASPA: 3.472.374–3.503.405, Plus-StrangASPATRPV3: 3.510.502–3.557.812, Minus-StrangTRPV3TRPV1: 3.565.444–3.609.880, Minus-StrangTRPV1: 3.585.149–3.636.249, Minus-StrangSHPK: 3.607.433–3.636.637, Minus-StrangSHPKCTNS: 3.636.446–3.663.103, Plus-StrangCTNSTAX1BP3: 3.659.751–3.668.679, Minus-StrangTAX1BP3P2RX5-TAX1BP3: 3.663.063–3.696.194, Minus-StrangEMC6: 3.668.794–3.672.835, Plus-StrangEMC6P2RX5: 3.669.763–3.696.398, Minus-StrangITGAE: 3.714.628–3.801.225, Minus-StrangITGAEHASPIN: 3.723.903–3.726.699, Plus-StrangHASPINNCBP3: 3.802.158–3.846.263, Minus-StrangNCBP3CAMKK1: 3.860.315–3.894.891, Minus-StrangCAMKK1P2RX1: 3.896.592–3.916.580, Minus-StrangP2RX1ATP2A3: 3.923.866–3.964.499, Minus-StrangATP2A3Diagramm von SPATA22: 9 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 17Exon 3: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 9: 3.440.019–3.440.338, 320 BasenExon 8: 3.443.174–3.443.271, 98 BasenExon 7: 3.446.472–3.446.601, 130 BasenExon 6: 3.448.807–3.449.149, 343 BasenExon 5: 3.462.483–3.462.578, 96 BasenExon 4: 3.462.707–3.462.767, 61 BasenExon 3: 3.467.426–3.467.554, 129 BasenExon 2: 3.469.283–3.469.398, 116 BasenExon 1: 3.471.682–3.471.819, 138 Basen9864215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,4 kb der 31,8 kb des Gens aus; 1.092 dieser Basen kodieren für das Protein.

So liest ein Gentest SPATA22

4

Positionen in SPATA22, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.

Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 31,8 kb von SPATA22, einschließlich der Introns, und nicht nur die 1,4 kb Exons.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
  • Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (o. J.). SPATA22-Gen: spermatogenesis associated 22. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/spata22

Vancouver

Dante Labs. SPATA22-Gen: spermatogenesis associated 22 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/spata22

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