Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

MAP1S

microtubule associated protein 1S

Oversigt

Cytogenetisk placering
19p13.12
Koordinater
Kromosom 19: 17.719.480–17.734.513 (GRCh38)
Exoner
7 exoner fordelt over 15 kb
Protein
1.059 aminosyrer
Også kendt som
FLJ10669, MAP8
Tidligere symboler
C19orf5, VCY2IP1, BPY2IP1
MANE Select-transkript
ENST00000324096.9NM_018174.6
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser MAP1S endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er MAP1S opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 19, med en klamme ved MAP1S. MAP1S og 42 gener i nærheden på kromosom 19, fra 17.226.997 til 18.226.996.Kromosom 1919p13.12p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4317,4 Mb17,6 Mb17,8 Mb18 Mb18,2 MbOCEL1: 17.226.198–17.229.219, fremadrettet-strengOCEL1NR2F6: 17.229.207–17.245.953, omvendt-strengNR2F6: 17.235.940–17.255.448, omvendt-strengUSHBP1: 17.249.171–17.282.786, omvendt-strengBABAM1: 17.267.343–17.281.249, fremadrettet-streng: 17.267.418–17.282.966, fremadrettet-strengANKLE1: 17.281.645–17.287.649, fremadrettet-strengABHD8: 17.292.131–17.310.236, omvendt-strengABHD8MRPL34: 17.292.543–17.306.847, fremadrettet-strengDDA1: 17.309.518–17.323.315, fremadrettet-strengDDA1ANO8: 17.323.223–17.334.864, omvendt-strengANO8GTPBP3: 17.334.920–17.342.735, fremadrettet-strengGTPBP3PLVAP: 17.351.450–17.377.356, omvendt-strengPLVAPCCDC194: 17.387.196–17.394.201, omvendt-strengCCDC194BST2: 17.402.933–17.407.393, omvendt-strengBST2MVB12A: 17.405.722–17.436.364, fremadrettet-strengMVB12ATMEM221: 17.435.509–17.448.679, omvendt-strengTMEM221: 17.436.611–17.460.804, omvendt-strengNXNL1: 17.455.425–17.460.926, omvendt-strengNXNL1SLC27A1: 17.467.666–17.506.190, fremadrettet-strengSLC27A1PGLS: 17.511.607–17.521.288, fremadrettet-strengPGLSNIBAN3: 17.523.301–17.553.839, fremadrettet-strengNIBAN3COLGALT1: 17.555.590–17.583.162, fremadrettet-strengCOLGALT1UNC13A: 17.601.327–17.688.382, omvendt-strengUNC13AMAP1S: 17.719.480–17.734.513, fremadrettet-strengMAP1SFCHO1: 17.747.701–17.788.572, fremadrettet-strengFCHO1B3GNT3: 17.794.697–17.814.175, fremadrettet-strengB3GNT3INSL3: 17.816.512–17.821.574, omvendt-strengINSL3JAK3: 17.824.780–17.848.071, omvendt-strengJAK3RPL18A: 17.859.868–17.871.283, fremadrettet-strengRPL18ASLC5A5: 17.871.939–17.895.174, fremadrettet-strengSLC5A5CCDC124: 17.932.588–17.944.914, fremadrettet-strengCCDC124KCNN1: 17.947.484–18.000.085, fremadrettet-strengKCNN1ARRDC2: 18.001.126–18.015.694, fremadrettet-strengARRDC2IL12RB1: 18.058.995–18.098.944, omvendt-strengIL12RB1MAST3: 18.097.749–18.151.692, fremadrettet-strengMAST3PIK3R2: 18.153.155–18.170.541, fremadrettet-strengPIK3R2: 18.153.158–18.178.117, fremadrettet-strengIFI30: 18.173.150–18.178.122, fremadrettet-strengIFI30MPV17L2: 18.193.197–18.196.948, fremadrettet-strengMPV17L2RAB3A: 18.196.752–18.204.055, omvendt-strengPDE4C: 18.207.961–18.255.419, omvendt-strengPDE4C: 18.207.965–18.248.200, omvendt-strengPDE4CDiagram af MAP1S: 7 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 19Exon 1: 17.719.480–17.719.620, 141 baserExon 2: 17.720.936–17.721.037, 102 baserExon 3: 17.724.126–17.724.208, 83 baserExon 4: 17.725.049–17.725.189, 141 baserExon 5: 17.725.829–17.728.172, 2.344 baserExon 6: 17.733.193–17.733.428, 236 baserExon 7: 17.734.273–17.734.513, 241 baser12345675′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 3,3 kb af genets 15 kb; 3.180 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af MAP1S

9Let

Hvor svær MAP1S er at sekventere med korte reads, ud af 100

Næsten alle eksonerne i MAP1S ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.

Det, der lægger til: andelen af eksonerne i MAP1S i hver type svær region

  • Kortlægningsbarhed0 %
  • Homologi0 %
  • Gentagelser1,8 %
  • GC-indhold90 %
  • Referencedækning0 %

En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan beregnes scoren

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). MAP1S-genet: microtubule associated protein 1S. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/map1s

Vancouver

Dante Labs. MAP1S-genet: microtubule associated protein 1S [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/map1s

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test