Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

GIMAP5

GTPase, IMAP family member 5

Sammanfattning

Cytogenetisk position
7q36.1
Koordinater
Kromosom 7: 150 737 418–150 743 646 (GRCh38)
Exoner
3 exoner på 6,2 kb
Protein
307 aminosyror
Även känd som
HIMAP3, IAN5
Tidigare symboler
IAN4L1
MANE Select-transkript
ENST00000358647.5NM_018384.5
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser GIMAP5 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är GIMAP5 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
Kromosom 7, med en parentes där GIMAP5 finns. GIMAP5 och 35 gener i närheten på kromosom 7, från 150 240 532 till 151 240 531.Kromosom 77q36.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.3150,4 Mb150,6 Mb150,8 Mb151 Mb151,2 MbACTR3C: 150 243 916–150 323 926, bakåt-strängACTR3CLRRC61: 150 323 263–150 338 156, framåt-strängLRRC61RARRES2: 150 338 314–150 342 144, bakåt-strängRARRES2REPIN1: 150 368 067–150 374 045, framåt-strängREPIN1ZNF775: 150 368 790–150 398 634, framåt-strängZNF775: 150 400 702–150 412 470, framåt-strängGIMAP8: 150 450 624–150 479 395, framåt-strängGIMAP8GIMAP7: 150 514 852–150 521 073, framåt-strängGIMAP7GIMAP4: 150 567 242–150 574 512, framåt-strängGIMAP4GIMAP6: 150 625 375–150 632 651, bakåt-strängGIMAP6GIMAP2: 150 685 647–150 694 763, framåt-strängGIMAP2GIMAP1: 150 716 606–150 724 284, framåt-strängGIMAP1GIMAP1-GIMAP5: 150 716 668–150 743 646, framåt-strängGIMAP1-GIMAP5GIMAP5: 150 737 418–150 743 646, framåt-strängGIMAP5TMEM176B: 150 789 455–150 823 877, bakåt-strängTMEM176BTMEM176A: 150 799 598–150 805 122, framåt-strängTMEM176AAOC1: 150 824 627–150 872 465, framåt-strängAOC1KCNH2: 150 944 064–150 978 394, bakåt-strängKCNH2NOS3: 150 991 017–151 015 653, framåt-strängNOS3ATG9B: 151 012 209–151 024 499, bakåt-strängATG9BABCB8: 151 028 422–151 047 782, framåt-strängABCB8ASIC3: 151 048 292–151 052 756, framåt-strängASIC3CDK5: 151 051 517–151 057 952, bakåt-strängCDK5SLC4A2: 151 057 210–151 076 527, framåt-sträng: 151 061 928–151 061 978, framåt-strängFASTK: 151 076 585–151 080 881, bakåt-strängTMUB1: 151 081 082–151 083 533, bakåt-strängAGAP3: 151 085 831–151 144 450, framåt-strängAGAP3GBX1: 151 147 669–151 174 745, bakåt-strängGBX1ASB10: 151 175 684–151 187 832, bakåt-strängASB10DRC11L: 151 190 873–151 205 496, bakåt-strängDRC11LH2BK1: 151 207 416–151 210 488, bakåt-strängH2BK1ABCF2-H2BK1: 151 207 837–151 227 166, bakåt-strängABCF2: 151 211 484–151 227 264, bakåt-strängCHPF2: 151 232 483–151 240 979, framåt-strängSMARCD3: 151 238 764–151 277 896, bakåt-strängDiagram över GIMAP5: 3 exoner på framåt-strängen av kromosom 7Exon 3: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 150 737 418–150 737 708, 291 baserExon 2: 150 740 879–150 740 927, 49 baserExon 3: 150 742 183–150 743 646, 1 464 baser1235′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 1,8 kb av genens 6,2 kb, och 924 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av GIMAP5

1Lätt

Hur svår GIMAP5 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i GIMAP5 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som adderar: andelen av GIMAP5:s exoner i varje typ av svårt område

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner2,1 %
  • GC-innehåll0 %

En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängen

1

position i GIMAP5 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen

Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsekvensering täcker alla 6,2 kb av GIMAP5, inklusive introner, inte bara de 1,8 kb exoner.

ClinVar pathogenic variants (1)

The GIMAP5 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.

  • Patogen/sannolikt patogen 1
VariantConditionsClinVar-klassificeringGranskningsstatus
NM_018384.5(GIMAP5):c.611T>C (p.Leu204Pro) (opens in a new tab)portal hypertension, noncirrhotic, 2Patogen/sannolikt patogen2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter

Egenskaper kopplade till GIMAP5

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GIMAP5 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.19-9814e911.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). GIMAP5-genen: GTPase, IMAP family member 5. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gimap5

Vancouver

Dante Labs. GIMAP5-genen: GTPase, IMAP family member 5 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gimap5

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test