Usherov syndróm – najčastejšia genetická príčina kombinovanej hluchoty a slepoty, pri ktorej identifikácia konkrétneho génu určuje časový priebeh straty zraku a oprávnenosť na účasť v klinických štúdiách génovej terapie, ktoré by mohli zachovať zostávajúci zrak.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje súčasné vyhodnotenie všetkých viac ako 10 génov zodpovedných za Usherov syndróm – vrátane génu USH2A, pri ktorom je potrebné zistiť hlboké intronové varianty, ktoré štandardné sekvenovanie exónov nezachytí – a poskytuje tak molekulárnu diagnózu, na základe ktorej sa určuje vhodnosť pre génovú terapiu.
Usherov syndróm
Usherov syndróm je najčastejšou genetickou príčinou kombinovanej straty sluchu a zraku (hluchoslepota) a predstavuje približne 50 % dedičných prípadov hluchoslepoty na celom svete. Ide o autozomálne recesívne ochorenie, ktoré sa delí na tri klinické typy: typ 1 (vrodená hlboká senzorineurálna strata sluchu, chýbajúca vestibulárna funkcia, retinitis pigmentosa s nástupom v predpubertálnom veku), typ 2 (vrodená stredne ťažká až ťažká strata sluchu, normálna vestibulárna funkcia, RP s nástupom v dospievaní) a typ 3 (progresívna strata sluchu, variabilný nástup RP). Usherov syndróm postihuje približne 1 z 6 000 – 10 000 ľudí.
Genetický základ zahŕňa najmenej 10 génov: USH1 je spôsobený mutáciami v génoch MYO7A (USH1B, najčastejší typ 1), CDH23 (USH1D), PCDH15 (USH1F), USH1C alebo USH1G. USH2 je spôsobený variantmi v génoch USH2A (najbežnejší gén Usherovho syndrómu, zodpovedajúci za približne 50 % všetkých prípadov Usherovho syndrómu), ADGRV1 (USH2C) alebo WHRN (USH2D). USH3 je spôsobený variantmi v géne CLRN1 (bežné vo fínskej a aškenázskej židovskej populácii). USH2A patrí medzi najväčšie gény v genóme (51 exónov pokrývajúcich ~800 kb genomovej DNA) a medzi patogénne varianty patria hlboké intronové varianty, ktoré vytvárajú aberantné miesta šplhania – varianty, ktoré štandardné panely sekvenovania exónov nezistia.
V súčasnosti prebiehajú klinické štúdie génovej terapie zamerané na Usherov syndróm – najmä na degeneráciu sietnice spôsobenú mutáciami génov USH1B (MYO7A) a USH2A. Cieľom subretinálneho a intravitreálneho podania génu na báze AAV je zachovať zostávajúcu funkciu fotoreceptorov u pacientov s retinitis pigmentosa v ranom štádiu. Podmienkou účasti v týchto štúdiách je molekulárne potvrdenie konkrétneho kauzálneho génu a variantu a zvyčajne sa vyžaduje dostatočná zostávajúca funkcia sietnice, aby bol terapeutický prínos merateľný. Včasná molekulárna diagnóza – skôr, ako dôjde k závažnej strate zraku – maximalizuje časový priestor na intervenciu génovou terapiou.
Varianty v hlbokých intrónoch génu USH2A (napríklad c.7595-2144A>G) vytvárajú abnormálne miesta šplhania, ktoré štandardné panely na sekvenovanie exónov nezachytia. Tieto varianty tvoria významnú časť „chýbajúcich“ alel génu USH2A u pacientov s klinickým syndrómom Usherovho typu 2, u ktorých bola identifikovaná iba jedna kódujúca varianta.
Patogénne varianty v hlbokých intrónoch génu USH2A nie sú zachytené pri sekvenovaní exónového panelu. Sekvenovanie celého genómu pokrýva celý 800-kb lokus génu USH2A a umožňuje detekovať intronové varianty šplhania, ktoré pomáhajú vyriešiť doteraz nevyriešené prípady Usherovho syndrómu typu 2.
Na to, aby bol pacient vhodný na génovú terapiu, je potrebná potvrdená molekulárna diagnóza – a včasná liečba zachováva zrak v väčšej miere
V súčasnosti prebieha viacero klinických štúdií zameraných na génovú terapiu degenerácie sietnice pri Usherovom syndróme, pričom konkrétne programy sa zameriavajú na gény MYO7A (USH1B), USH2A a ďalšie. Podmienkou účasti je molekulárne potvrdenie konkrétneho kauzálneho génu a väčšina štúdií vyžaduje dostatočnú reziduálnu funkciu fotoreceptorov na dosiahnutie merateľného terapeutického účinku. Keďže retinitis pigmentosa pri Usherovom syndróme je progresívna a nezvratná, každý rok oneskorenia molekulárnej diagnózy je rokom straty zraku, čo znižuje potenciálny prínos budúcej génovej terapie. Sekvenovanie celého genómu u detí so senzorineurálnou poruchou sluchu identifikuje genotypy Usherovho syndrómu ešte predtým, ako sa objavia symptómy postihnutia zraku – čo je optimálne časové okno pre intervenciu.
U každého dieťaťa s nevysvetliteľnou senzorineurálnou poruchou sluchu by sa malo posúdiť, či netrpí Usherovým syndrómom – a to ešte predtým, ako sa objavia príznaky retinopatie
Retinitis pigmentosa pri Usherovom syndróme typu 2 sa zvyčajne prejaví najskôr nočnou slepotou v dospievajúcom veku, pričom v nasledujúcich desaťročiach dochádza k postupnému zužovaniu zorného poľa. V čase, keď sa RP prejaví klinicky, už došlo k významnej strate fotoreceptorov. Identifikácia variantu génu USH2A alebo iných variantov génu Usher u dieťaťa s diagnózou senzorineurálnej poruchy sluchu – roky pred akýmikoľvek zrakovými príznakmi – umožňuje proaktívne oftalmologické sledovanie, včasné zaradenie do preventívnych štúdií a psychologickú prípravu na postupnú stratu zraku. Táto včasná identifikácia je možná len prostredníctvom molekulárneho testovania v čase diagnózy poruchy sluchu.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o Usherov syndróm alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
