GENETICKÉ RIZIKO DIABETU 1. TYPU

Genetické riziko cukrovky 1. typu — HLA haplotypy, ktoré zodpovedajú za polovicu celkovej genetickej náchylnosti na cukrovku 1. typu, umožňujú identifikovať deti s 10- až 20-násobne zvýšeným rizikom, ktoré sa teraz môžu zapojiť do preventívnych štúdií skôr, ako autoimunitný proces úplne zničí funkciu beta-buniek.

Sekvenovanie celého genómu poskytuje kompletnú typizáciu HLA-DR/DQ – hlavných genetických determinantov rizika T1D – spolu s variantmi polygenického rizikového skóre, čo umožňuje stratifikáciu ohrozených detí pre preventívne programy a skríning v ére teplizumabu.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O GENETICKOM RIZIKU DIABETU 1. TYPU

Cukrovka 1. typu – genetické riziko

Diabetes 1. typu (T1D) je autoimunitné ochorenie, pri ktorom dochádza k zničeniu beta-buniek pankreasu sprostredkovanému T-bunkami, čo má za následok absolútny deficit inzulínu. T1D má silnú, ale komplexnú genetickú štruktúru – dedičnosť je približne 80 %, ale penetrancia je neúplná, čo odzrkadľuje podstatné negénové (environmentálne a infekčné) modifikátory ochorenia. Gény HLA triedy II predstavujú približne 40–50 % celkového genetického rizika T1D. Kombinácie HLA haplotypov s najvyšším rizikom – najmä DR3-DQ2 (HLA-DRB1*03:01-DQA1*05:01-DQB1*02:01) a DR4-DQ8 (HLA-DRB1*04-DQA1*03:01-DQB1*03:02) — znamenajú výrazne zvýšené celoživotné riziko T1D, ak sa zdedia v kombinácii.

Deti, ktoré sú zloženými heterozygotmi DR3/DR4 (jeden haplotyp DR3-DQ2 a jeden haplotyp DR4-DQ8), majú celoživotné riziko vzniku T1D približne 5–10 % – v porovnaní s približne 0,4 % v bežnej populácii. Príbuzní prvého stupňa pacientov s T1D s genotypom DR3/DR4 majú ešte vyššie absolútne riziko, ktoré sa blíži k 15–25 % počas života. HLA-protektívne haplotypy – najmä HLA-DRB1*15:02 (DR15) v kombinácii s DQ6 – podstatne znižujú riziko T1D aj v prípade, že sa vyskytujú spolu s rizikovými alelami. Ďalšie lokusy mimo HLA (INS, PTPN22, CTLA4, IL2RA/CD25) prispievajú miernymi individuálnymi účinkami, ale podstatným kombinovaným polygenickým rizikom.

Schválenie lieku teplizumab (Tzield) americkou FDA v roku 2022 – monoklonálnej protilátky proti CD3, ktorá v štúdii TrialNet oddialila nástup T1D v priemere o viac ako 2 roky u jedincov s vysokým rizikom a viacerými autoprotilátkami – zásadným spôsobom zmenilo klinický význam genetickej stratifikácie rizika T1D. Jedinci s vysokým rizikom HLA môžu byť teraz sledovaní prostredníctvom skríningu autoantitiel ostrovčekov (identifikácia T1D v predsymptomatickom štádiu 1) a tí, ktorí majú 2 a viac autoantitiel, spĺňajú podmienky na liečbu teplizumabom – prvou liečbou modifikujúcou priebeh ochorenia, ktorá oddiali alebo potenciálne zabráni klinickému T1D. Vďaka tomu je genetická stratifikácia rizika u detí a súrodencov pacientov s T1D priamo využiteľná spôsobom, ktorý pred rokom 2022 nebol možný.

Monogénny diabetes (MODY) – spôsobený mutáciami v jedinom géne (GCK, HNF1A, HNF4A a ďalších génoch transkripčných faktorov beta-buniek) – môže pripomínať T1D s raným nástupom, vyžaduje však úplne odlišný prístup k liečbe. Rozlíšenie T1D od MODY si vyžaduje komplexné molekulárne vyšetrenie.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Typizácia HLA na účely stratifikácie rizika T1D si vyžaduje stanovenie alel triedy II s vysokým rozlíšením na úrovni 4 znakov. Sekvenovanie celého genómu umožňuje v rámci jedného testu získať kompletnú haplotypizáciu HLA-DR/DQ spolu s variantmi polygenického rizikového skóre a vyhodnotením génov MODY.

Identifikácia vysokorizikového HLA umožňuje prístup k profylaktickej liečbe teplizumabom – a sledovanie autoantitiel ešte pred vznikom príznakov

Kvalifikácia na liečbu teplizumabom si vyžaduje diagnózu T1D v predsymptomatickom štádiu 2 – prítomnosť dvoch alebo viacerých autoantitiel proti ostrovčekom a abnormálnu toleranciu glukózy. Identifikácia T1D v štádiu 2 si vyžaduje systematické sledovanie autoantitiel, ktoré je zamerané na osoby so známym zvýšeným genetickým rizikom. Bez stratifikácie rizika HLA sa toto monitorovanie vykonáva len u príbuzných prvého stupňa pacientov s T1D (ktorí prechádzajú skríningom TrialNet) — oveľa väčšia populácia geneticky ohrozených jedincov bez rodinných anamnéz T1D nie je systematicky identifikovaná. Typizácia HLA na základe sekvenovania celého genómu môže identifikovať týchto jedincov s vysokým rizikom a podnietiť skríning autoprotilátok a zaradenie do TrialNet.

Sekvenovanie celého genómu umožňuje súčasné vyhodnotenie génov MODY – čím sa odlíši T1D od liečiteľného monogénneho diabetu

Diabetes mladých dospelých (MODY) – spôsobený jednotlivými heterozygotnými variantmi v génoch GCK, HNF1A, HNF4A, HNF1B a ďalších – je často nesprávne diagnostikovaný ako diabetes 1. alebo 2. typu. MODY predstavuje približne 1–2 % všetkých diagnostikovaných prípadov cukrovky, ale môže tvoriť až 5–10 % prípadov cukrovky s raným nástupom. Klinické rozlíšenie je kľúčové: GCK-MODY zvyčajne nevyžaduje žiadnu liečbu; HNF1A a HNF4A-MODY sú mimoriadne citlivé na sulfonylurey a nemusia vyžadovať inzulín. Sekvenovanie celého genómu hodnotí HLA haplotypy pre riziko T1D spolu s kompletným sekvenovaním génového panelu MODY — kombinácia, ktorá vyrieši diagnostickú nejednoznačnosť pri atypických prejavoch cukrovky s nástupom v mladom veku.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – v oblasti cukrovky 1. typu, genetického rizika a ďalších ochorení, či už ide o vzácne alebo bežné ochorenia. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs