Talasémia – najčastejšie monogénové ochorenie na svete, pri ktorom celkový genotyp globínu určuje, či je daná osoba bezpríznakovým nositeľom, trpí liečiteľným chronickým ochorením alebo má ochorenie vyžadujúce transfúzie.
Sekvenovanie celého genómu zachytáva kompletné génové klastre alfa-globínu (HBA1/HBA2) a beta-globínu (HBB), pričom identifikuje každú deléciu, bodovú mutáciu a kombináciu zložených heterozygotných mutácií – teda celú štruktúru, ktorú štandardné skríningy nositeľov nedokážu charakterizovať.
Talasémia
Syndrómy talasémie sú autozomálne recesívne hemoglobinopatie spôsobené zníženou alebo chýbajúcou produkciou alfa- alebo beta-globínových reťazcov, čo vedie k nerovnováhe v syntéze globínových reťazcov, neefektívnej erytropoéze a chronickej hemolytickej anémii. Talasémie sú celkovo najčastejšie poruchy spôsobené jedným génom na svete – odhaduje sa, že 270 miliónov ľudí je nositeľom variantu talasémie a ročne sa narodí približne 60 000 ťažko postihnutých detí. Frekvencia nositeľov talasémie je najvyššia v regiónoch, kde je malária endemická: v Stredozemí, subsaharskej Afrike, na Blízkom východe, v južnej a juhovýchodnej Ázii a v južnej Číne.
Alfa-talasémia je spôsobená deléciami alebo mutáciami génov HBA1 a HBA2 na chromozóme 16p13.3. Keďže existujú štyri kópie génov alfa-globínu (dva gény HBA1 a dva gény HBA2 na každom chromozóme 16), závažnosť alfa-talasémie závisí od počtu génov: jeden vynechaný gén (tichý nositeľ alfa-talasémie), dva vynechané gény (alfa-talasémický znak), tri vynechané gény (HbH choroba, stredne ťažká anémia), štyri vynechané gény (Hb Bartov hydrops fetalis, bez zásahu v maternici vždy smrteľný). Beta-talasémia je spôsobená bodovými mutáciami alebo malými inzerciami/deléciami v géne HBB. Ťažká beta-talasémia (Cooleyho anémia, beta⁰/beta⁰) si vyžaduje celoživotné transfúzie; stredne ťažká beta-talasémia má variabilnú závažnosť; beta-talasémia je asymptomatická.
Genetická štruktúra talasémie patrí medzi najzložitejšie zo všetkých Mendelových porúch. Bolo charakterizovaných viac ako 300 variantov beta-globínu a desiatky typov delécií alfa-globínu. Zložená heterozygotnosť – zdedenie rôznych variantov talasémie od každého z rodičov – vedie k fenotypom, ktoré nie je možné predvídať na základe žiadneho z variantov samostatne. Spoločné zdedenie alfa- a beta-talasémie mení závažnosť ochorenia: súbežná alfa-talasémia znižuje nerovnováhu globínových reťazcov pri beta-talasémii, čím paradoxne zlepšuje stav. Génová terapia (betibeglogene autotemcel, schválená v roku 2022) a editácia génov (exagamglogene autotemcel/exa-cel, schválená v roku 2023) ponúkajú liečebný potenciál pre pacientov závislých na transfúziách, čím definitívne genotypizovanie priamo umožňuje liečbu.
Alfa- a beta-talasémia súvisia s rôznymi génmi a spôsobmi dedičnosti. Kombinácie zložených heterozygotných variácií vedú k odlišným klinickým fenotypom, ktoré nie je možné predpovedať len na základe testovania jednotlivých variácií.
Štandardné skríningové testy na bežné regionálne varianty talasémie. Tieto testy nedokážu identifikovať genotyp s úplnou deléciou alfa-globínu, stavy zloženého heterozygotizmu ani modifikujúce lokusy, ktoré určujú klinickú závažnosť ochorenia a reprodukčné riziko.
Určenie počtu kópií génu alfa-globínu si vyžaduje rozlíšenie na úrovni genómu – pomocou panelov SNP to nie je možné zistiť
Alfa-talasémia je spôsobená prevažne rozsiahlymi deléciami, pri ktorých dochádza k odstráneniu jedného alebo oboch génov alfa-globínu z chromozómu. Určenie počtu zostávajúcich funkčných kópií génu alfa-globínu – hlavného faktora ovplyvňujúceho klinickú závažnosť – si vyžaduje mapovanie delécií s charakterizáciou bodov zlomu. Skríningové panely nositeľov založené na SNP nedokážu detekovať génové delécie. Dokonca ani cielené testovanie delécií (MLPA, Gap-PCR) nevyhodnocuje iba najbežnejšie typy regionálnych delécií a môže prehliadnuť vzácne alebo atypické delécie. Sekvenovanie celého genómu zmapuje všetky delécie alfa-globínu, určí presný počet kópií génu a charakterizuje zlomy – informácie potrebné na rozlíšenie znaku alfa-talasémie (konfigurácie delécií „cis“ vs. „trans“) a predikciu rizika hydropsu fetalis.
Na to, aby bol pacient vhodný na génovú terapiu, je potrebný definitívny genotyp – nie výsledok skríningu
Schválenie liekov betibeglogene autotemcel (Zynteglo, 2022) a exa-cel (Casgevy, 2023) na liečbu beta-talasémie závislej od transfúzií spôsobilo, že definitívne genotypizovanie génu HBB priamo umožňuje začatie liečby. Kritériá oprávnenosti na génovú terapiu špecifikujú genotyp beta-talasémie a v niektorých protokoloch vylučujú určité typy variantov. U pacientov, ktorí sú hodnotení na liečebnú génovú terapiu alebo úpravu génov, musí byť s istotou stanovený kompletný genotyp globínu – vrátane identifikácie akejkoľvek spoludedičnej alfa-talasémie, ktorá môže ovplyvniť odpoveď na liečbu. Sekvenovanie celého genómu poskytuje tento definitívny genotyp v jedinom komplexnom teste.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o talasémiu alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
