SPINOCEREBELÁRNA ATAXIA

Spinocerebelárna ataxia – viac ako 40 genetických podtypov progresívnej degenerácie mozočku, pri ktorých rýchlo napredujú klinické štúdie s antisense oligonukleotidmi a identifikácia molekulárneho podtypu určuje vhodnosť pre génovo-špecifické terapie.

Sekvenovanie celého genómu umožňuje v rámci jednej komplexnej analýzy vyhodnotiť všetkých viac ako 40 génov SCA – vrátane expanzií CAG-opakovaní (SCA1/2/3/6/7/17), expanzií nekódujúcich opakovaní (SCA8/10/36) a konvenčných mutácií (SCA5/11/13/14).

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O SPINOCEREBELÁRNEJ ATAXII

Spinocerebelárna ataxia

Spinocerebelárne ataxie (SCA) tvoria skupinu viac ako 40 autozomálne dominantných progresívnych degeneratívnych ochorení mozočku, ktoré sú označené číslami od SCA1 po SCA48+ v závislosti od identifikácie nových génov. Najčastejšie SCA na celom svete sú SCA3/Machado-Josephova choroba (expanzia CAG v géne ATXN3, ~21 % celosvetovo), SCA2 (expanzia CAG v géne ATXN2, ~15 %), SCA6 (expanzia CAG v géne CACNA1A, ~15 %), SCA1 (expanzia CAG v géne ATXN1, ~6 %) a SCA7 (expanzia CAG v géne ATXN7, ~5 %). Kombinovaná prevalencia SCA je približne 1–5 na 100 000, pričom sa líši v závislosti od populácie a geografickej polohy.

SCA sa prejavujú progresívnou cerebelárnou ataxiou (nestabilita chôdze, dyzartria, poruchy okulomotorických funkcií) s rôznymi ďalšími príznakmi v závislosti od konkrétneho podtypu: SCA1 a SCA2 zahŕňajú pyramidálne príznaky a periférnu neuropatiu; SCA3 zahŕňa dystóniu, oftalmoplegiu a parkinsonizmus; SCA6 je čistá cerebelárna ataxia s neskorým nástupom; SCA7 zahŕňa progresívnu degeneráciu sietnice (jediná SCA s makulárnou dystrofiou). Vek nástupu koreluje nepriamo s dĺžkou opakovaného rozšírenia (anticipácia — dlhšie opakovania spôsobujú skorší nástup v nasledujúcich generáciách, najmä prostredníctvom otcovského prenosu).

Liečby antisense oligonukleotidmi (ASO) zamerané na transkripty mRNA kódujúce polyglutamín prebiehajú v klinických štúdiách pre SCA1, SCA2 a SCA3 – tri najčastejšie formy SCA s polyglutamínom. Cieľom týchto prístupov založených na potlačení génu je znížiť produkciu toxického proteínu. Okrem toho sa skúmajú modulátory iónových kanálov a malé molekuly zamerané na následné dráhy degenerácie mozočku. Všetky štúdie vyžadujú na zaradenie potvrdený molekulárny podtyp SCA. Dôležitosť včasnej molekulárnej diagnostiky presahuje rámec súčasného zaradenia do štúdie: štúdie prirodzeného vývoja, ktoré stanovujú merania výsledkov pre budúce štúdie, tiež vyžadujú genotypizovaných účastníkov.

SCA7 je jediná forma SCA spojená s degeneráciou sietnice – u každého pacienta s progresívnou ataxiou a makulárnou dystrofiou by sa malo vykonať opakované testovanie na opakované sekvencie génu ATXN7. Sietnicové príznaky sa môžu objaviť skôr ako ataxia, čím napodobňujú izolovanú sietnicovú dystrofiu.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Viac ako 40 podtypov SCA nie je možné testovať postupne. Technológia detekcie opakovaných sekvencií teraz umožňuje prostredníctvom WGS identifikovať CAG-expanzie a nekódujúce opakované sekvencie, na čo sa v minulosti vyžadovali špecializované testy.

Terapie ASO pre SCA1/2/3 v klinických štúdiách – molekulárny podtyp určuje vhodnosť pre prístupy založené na génovo-špecifickom potláčaní

Antisense oligonukleotidy určené na potlačenie expresie mRNA génov ATXN1 (SCA1), ATXN2 (SCA2) alebo ATXN3 (SCA3) sú génovo špecifické – ASO pre SCA1 nelieči SCA3 a naopak. Zaradenie do klinickej štúdie vyžaduje potvrdenú molekulárnu diagnózu s dokumentovanou dĺžkou opakovaného rozšírenia. Bez molekulárneho subtypovania nemajú pacienti s klinicky nerozlíšiteľnou progresívnou cerebelárnou ataxiou prístup k génovo špecifickým štúdiám. WGS identifikuje špecifický subtyp SCA na základe jediného testu, čím sa ukončuje postupné testovanie jednotlivých génov, ktoré spomaľuje zaradenie do štúdie.

Predčasný nástup znamená, že u detí pacientov so SCA sa môžu objaviť príznaky už o desaťročia skôr – testovanie v predsymptomatickom štádiu umožňuje plánovanie a budúce zaradenie do klinických štúdií

Expanzie CAG-opakovaní pri SCA1/2/3/7 vykazujú anticipáciu – medzigeneračná nestabilita opakovaní (najmä pri prenose po otcovej línii) vedie k dlhším opakovaniam u potomkov, čo spôsobuje skorší nástup a závažnejší priebeh ochorenia. Rodič s nástupom SCA3 vo veku 45 rokov môže mať dieťa s nástupom vo veku 25 rokov. Presymptomatické testovanie identifikuje ohrozených členov rodiny pred nástupom príznakov, čo umožňuje zaradenie do preventívnych štúdií, plánovanie života a okamžitý prístup k klinickým štúdiám, keď sa príznaky objavia. Genetické poradenstvo pred presymptomatickým testovaním je nevyhnutné.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o spinocerebelárnu ataxiu alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs