Sickle Cell Disease — zmena jedného nukleotidu v géne HBB, ktorá mení štruktúru červených krviniek, narúša mikrocirkuláciu a určuje celoživotnú klinickú starostlivosť.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje charakterizovať kompletný genotyp HBB – vrátane zložených heterozygotných kombinácií, lokusov ovplyvňujúcich závažnosť ochorenia a spolu zdedených variantov alfa-talasémie, ktoré štandardné skríningy nositeľov systematicky prehliadajú.
Sickle-cellová anémia
Sickle cell disease (SCD) je autozomálna recesívna hemoglobinopatia spôsobená substitúciou kyseliny glutámovej za valín v kodóne 6 génu beta-globínu (HBB p.Glu7Val; rs334). Táto varianta jedného nukleotidu spôsobuje polymerizáciu hemoglobínu S (HbS) v podmienkach bez kyslíka, čím deformuje erytrocyty do tuhého srpovitého tvaru. Tieto deformované bunky upchávajú malé krvné cievy, čo vyvoláva vazo-okluzívne krízy, hemolytickú anémiu a progresívne poškodenie orgánov takmer vo všetkých systémoch – vrátane sleziny, obličiek, pľúc, mozgu a kostry. Sickle cell disease postihuje ročne približne 300 000 novorodencov po celom svete, pričom najvyššia prevalencia je v subsaharskej Afrike, Indii a na Blízkom východe, hoci sa vyskytuje vo všetkých populáciách.
Genotypová štruktúra SCD je zložitejšia než klasický obraz HbSS. Ochorenie HbSC (HBB Glu7Val/Glu6Lys) a HbS-beta-talasémia (HbS/beta⁰ alebo HbS/beta⁺) vyvolávajú odlišné klinické fenotypy s rôznymi profilmi závažnosti a dôsledkami pre liečbu. Závažnosť je ďalej modulovaná hladinami fetálneho hemoglobínu (HbF) — ovplyvnenými variantmi v BCL11A, HBS1L-MYB a samotnom lokuse HBB — a spoludedičnou alfa-talasémiou (delécie HBA1/HBA2), ktorá znižuje polymerizáciu HbS a je spojená s miernejším priebehom ochorenia. Štandardné testovanie nositeľov dvoch alel identifikuje kľúčovú variantu Glu7Val, nie je však navrhnuté tak, aby zachytilo celú genotypovú komplexnosť, ktorá určuje priebeh ochorenia u jednotlivca.
Zistenie nositeľstva pred tehotenstvom alebo počas neho predstavuje hlavnú indikáciu genetického testovania v rodinách, v ktorých sa doteraz nevyskytol žiadny postihnutý člen. Štandardnými klinickými indikáciami sú kaskádové testovanie v rodinách so známymi nositeľmi a potvrdzujúce genotypizovanie u novorodencov s pozitívnym výsledkom skríningu. U postihnutých pacientov sa kompletná genotypizácia – vrátane lokusov modifikátorov HbF a súčasne zdedenej alfa-talasémie – čoraz viac uznáva ako dôležitá pre predpovedanie odpovede na hydroxyureu a stanovenie kritérií vhodnosti pre transplantáciu kostnej drene.
Talasémia typu HbSS, HbSC, HbS-beta⁰ a HbS-beta⁺ má každá odlišnú klinickú prognózu. Samotný genotyp HBB nedokáže predpovedať závažnosť ochorenia; súčasťou celkového obrazu sú modifikujúce lokusy a spolu zdedené varianty.
Štandardné testovanie nositeľov odhalí variantu Glu7Val. Necharakterizuje však celý genotyp, modifikujúce lokusy ani spolu zdedené varianty, ktoré určujú klinický priebeh.
Heterozygotný stav je rovnako dôležitý ako status nositeľa
Osoba, ktorá zdedí jednu alelu HbS a jednu alelu beta-talasémie, trpí anémiou srpkovitých buniek – nejde len o nositeľstvo srpkovitých buniek. Štandardné testy na nositeľstvo dvoch variantov sú navrhnuté tak, aby identifikovali substitúciu rs334 Glu7Val, nie sú však optimalizované na súčasnú charakterizáciu alel beta-talasémie v rámci celého génu HBB. Sekvenovanie celého genómu číta kompletnú kódujúcu a regulačnú sekvenciu HBB, identifikuje akúkoľvek spolu zdedenú variantu beta-talasémie vedľa alely Glu7Val – a určuje, či je riziko nositeľského páru pre HbSS, HbSC, HbS-beta talasémiu alebo HbS znak.
Lokusy modifikátorov HbF a spoločná dedičnosť alfa-talasémie nie sú v štandardných paneloch zistiteľné
Hladina fetálneho hemoglobínu je najvýznamnejším známym faktorom ovplyvňujúcim závažnosť srpkovitej anémie. Vysoká hladina HbF potláča polymerizáciu HbS, čím znižuje výskyt vazo-okluzívnych príhod a poškodenie cieľových orgánov. Hladiny HbF sú regulované bežnými variantmi v géne BCL11A (rs1427407), intergenovej oblasti HBS1L-MYB (rs28384513) a v lokuse HBB na mieste Xmn1. Spolu zdedená alfa-talasémia (delécie génov HBA1/HBA2) ďalej moduluje závažnosť ochorenia. Žiaden z týchto modifikátorových lokusov nie je zahrnutý v štandardných skríningoch nositeľov dvoch alel ani v paneloch hemoglobinopatií. Sekvenovanie celého genómu zachytáva všetky tieto lokusy súčasne s primárnym genotypom HBB.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje s pacientskými združeniami a organizáciami akejkoľvek veľkosti – či už ide o sickle cell disease alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme združenia a organizácie v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych pacientskych združení a organizácií.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
