Polycystická choroba obličiek – najčastejšie život ohrozujúce genetické ochorenie, ktoré postihuje 1 z 400 až 1 000 ľudí, pričom konkrétny genotyp PKD1 alebo PKD2 predpovedá časový priebeh zlyhania obličiek s presnosťou na desaťročia a určuje vhodnosť liečby tolvaptanom.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje úplné zmapovanie génu PKD1 – vrátane presného zmapovania jeho 6 pseudogénov, ktoré komplikujú štandardné sekvenovanie – a génu PKD2, čím poskytuje genotyp, ktorý predpovedá časový priebeh terminálneho zlyhania obličiek (ESRD) a reakciu na liečbu.
Polycystická choroba obličiek
Autosomálne dominantná polycystická choroba obličiek (ADPKD) je najčastejšie dedičné ochorenie obličiek a jedno z najčastejších život ohrozujúcich genetických ochorení, ktoré postihuje približne 1 z 400 až 1 000 ľudí – odhadom 12,5 milióna ľudí na celom svete. ADPKD je spôsobená patogénnymi variantmi v génoch PKD1 (~78 % prípadov, chromozóm 16p13.3) alebo PKD2 (~15 %, chromozóm 4q22.1), ktoré kódujú polycystín-1, resp. polycystín-2. Tieto proteíny tvoria komplex kanálov priepustných pre vápnik, ktorý sníma tok tekutiny v primárnych riasinkách renálnych epitelových buniek. Progresívny bilaterálny vývoj renálnych cýst vedie k masívnemu zväčšeniu obličiek a nakoniec k terminálnemu štádiu ochorenia obličiek.
ADPKD spôsobuje postupný bilaterálny rast renálnych cýst v priebehu desiatok rokov, čo vedie k bolesti v bedrovej oblasti, hematurii, hypertenzii, infekciám močových ciest a nefrolitiáze. Pečeňové cysty sa vyskytujú u približne 80 % pacientov a sú zvyčajne bezpríznakové, u niektorých žien však môžu spôsobiť masívnu hepatomegáliu. Intrakraniálne aneuryzmy sa vyskytujú u približne 8 % pacientov s ADPKD (oproti 2–3 % v bežnej populácii) – ich prasknutie spôsobuje subarachnoidálne krvácanie s vysokou mortalitou. Spojenými príznakmi sú prolaps mitrálnej chlopne, divertikuly hrubého čreva a inguinálne hernie. Priemerný vek pri ESRD je približne 54 rokov pri PKD1 a 74 rokov pri PKD2 – rozdiel 20 rokov, ktorý je úplne určený genotypom.
Tolvaptan (Jynarque), antagonista receptora vazopresínu V2, bol v roku 2018 schválený FDA na liečbu ADPKD u dospelých s rizikom rýchleho progresu ochorenia. Tolvaptan znižuje rýchlosť rastu celkového objemu obličiek a spomaľuje pokles eGFR, čím oddiaľuje nástup terminálneho zlyhania obličiek (ESRD). Indikácia schválená FDA sa zameriava konkrétne na rýchlo progredujúcu ADPKD – typicky na trunkčné varianty génu PKD1, ktoré spôsobujú najrýchlejší priebeh ochorenia. Klasifikácia Mayo na základe zobrazovacích vyšetrení (htTKV) v kombinácii s molekulárnym genotypom poskytuje najpresnejšiu stratifikáciu rizika pre rozhodnutia o liečbe tolvaptanom. Okrem toho sa u pacientov s ADPKD s rodinnou anamnézou aneuryzmy alebo subarachnoidálneho krvácania odporúča skríning intrakraniálnych aneuryziem (MRA mozgu).
Varianty génu PKD1 s skráteným kódom (s posunom čítacieho rámca, nonsensové, narúšajúce šplhanie) spôsobujú terminálne zlyhanie obličiek približne o 12 rokov skôr ako varianty génu PKD1 bez skrátenia kódu (missense). Konkrétny typ variantu umožňuje presnejšie stanoviť prognózu, než len na základe rozdielu medzi génmi PKD1 a PKD2.
Gén PKD1 má na tom istom chromozóme 6 vysoko homologických pseudogénov, ktoré sťažujú štandardné sekvenovanie. Sekvenovanie celého genómu s využitím dlhých čítacích dĺžok mapuje oblasť pseudogénov s cieľom identifikovať skutočné patogénne varianty génu PKD1.
Rozdiel medzi génmi PKD1 a PKD2 určuje 20-ročný rozdiel v nástupe terminálneho zlyhania obličiek – genotyp je najsilnejším prediktorom renálnej prognózy
Priemerný vek pri nástupe terminálneho zlyhania obličiek (ESRD) je približne 54 rokov v prípade patogénnych variantov génu PKD1 a približne 74 rokov v prípade patogénnych variantov génu PKD2 – čo z molekulárneho genotypu robí najsilnejší prediktor renálnej prognózy pri ADPKD, ktorý prevyšuje samotný počiatočný objem obličiek, vek alebo sklon krivky eGFR. Okrem toho, trunkujúce varianty PKD1 spôsobujú ESRD približne o 12 rokov skôr ako netrunkujúce varianty PKD1, čo prispieva k ďalšiemu spresneniu prognózy. Táto informácia priamo ovplyvňuje klinické rozhodovanie: načasovanie začatia liečby tolvaptanom, cieľové hodnoty krvného tlaku, diskusie o plánovaní rodiny a načasovanie transplantácie obličky od živého darcu – to všetko závisí od predpokladaného časového priebehu ESRD.
Na posúdenie vhodnosti liečby tolvaptanom je potrebné rýchle zhodnotenie progresie ochorenia – genotyp je kľúčovou zložkou modelu rizika
Indikácia lieku tolvaptan (Jynarque) schválená FDA je určená pre pacientov s ADPKD, u ktorých existuje riziko rýchleho progresu ochorenia. Skóre PROPKD, ktoré zohľadňuje molekulárny genotyp (trunkované mutácie PKD1 = najvyššie skóre) spolu s klinickými premennými (pohlavie, nástup hypertenzie, urologické príhody), predpovedá rýchly progres ochorenia s overenou presnosťou. Pacienti s nízkym skóre PROPKD (typicky varianty PKD2 alebo PKD1 bez skrátenia) nemusia byť kandidátmi na liečbu tolvaptanom – čím sa zabráni významným vedľajším účinkom lieku (polyúria, polydipsia, monitorovanie hepatotoxicity) u pacientov, u ktorých je nepravdepodobné, že by mali z liečby prospech. Sekvenovanie celého genómu poskytuje molekulárne údaje pre tento model stratifikácie rizika.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o polycystickú chorobu obličiek alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
