Farmakogenomika – varianty génov CYP450 a ďalších génov zodpovedných za metabolizmus liekov určujú, ako vaše telo spracováva lieky. Poznanie vášho farmakogenomického profilu pomáha lekárovi hneď od začiatku vybrať správny liek a správnu dávku.
Sekvenovanie celého genómu určí váš fenotyp metabolizmu CYP450, čo lekárom umožní vybrať a dávkovať lieky, ktoré budú pri vašom jedinečnom genetickom zložení pôsobiť bezpečne a účinne.
Farmakogenomika — reakcia na lieky
Rodina enzýmov cytochrómu P450, ktoré metabolizujú lieky, je zodpovedná za metabolizáciu viac ako 75 % všetkých schválených liekov. Tri gény – CYP3A4, CYP2D6 a CYP2C19 – sú obzvlášť dôležité: CYP3A4 metabolizuje približne 50 % všetkých liekov na trhu, zatiaľ čo CYP2D6 a CYP2C19 spolu metabolizujú ďalších ~40 %. Tieto enzýmy katalyzujú oxidačné reakcie, ktoré aktivujú alebo deaktivujú lieky na vylučovanie. Genetická variabilita v týchto génoch vytvára štyri fenotypy metabolizátorov: slabí metabolizátori (PM) s veľmi nízkou enzymatickou aktivitou, strední metabolizátori (IM) so zníženou aktivitou, normálni/rýchli metabolizátori (NM/EM, divoký typ) a ultra-rýchli metabolizátori (UM) so zvýšenou enzymatickou aktivitou v dôsledku duplikácie génu alebo iných štrukturálnych variácií.
CYP2D6 má 962 identifikovaných variantov zaradených do databázy PharmGKB, pričom ide o komplexné štrukturálne variácie vrátane delécií génu (vedúcich k fenotypu PM), duplikácií a viacnásobných duplikácií (vedúcich k fenotypu UM) a hybridných génov (s premenlivou funkciou). CYP2C19 má 753 variantov, ktoré ovplyvňujú predovšetkým šplhanie, transláciu a substitúcie aminokyselín. CYP3A4 má 609 známych variantov. Varianty so stratou funkcie spôsobujú fenotypy s nízkou aktivitou; duplikácie génov spôsobujú ultra-rýchly metabolizmus. Fenotypy metabolizmu majú závažné klinické dôsledky: u jedincov so slabým metabolizmom sa pri štandardných dávkach môžu hromadiť toxické hladiny lieku, zatiaľ čo u jedincov s ultra-rýchlym metabolizmom môžu byť dosiahnuté subterapeutické koncentrácie.
Fenotyp metabolizátora určuje bezpečné a účinné dávkovanie liekov v desiatkach liekových tried. Kodeín, prekurzor aktivovaný enzýmom CYP2D6, nemá u slabých metabolizátorov žiadny analgetický účinok – títo pacienti nedokážu premeniť kodeín na jeho aktívny metabolit morfín. Tricyklické antidepresíva a antipsychotiká sa u slabých metabolizátorov CYP2D6 hromadia do toxických hladín. Pacienti so slabou metabolizáciou CYP2C19 nedokážu adekvátne aktivovať klopidogrel (Plavix), čo znižuje jeho protidoštičkový účinok a zvyšuje riziko trombózy stentu. Konzorcium pre implementáciu klinickej farmakogenetiky (CPIC) uverejňuje recenzované odporúčania týkajúce sa dávkovania pre viac ako 300 párov liekov a génov, ktoré pomáhajú zdravotníckym pracovníkom pri optimalizácii výberu a dávkovania liekov.
Štandardné panely testujú 10 až 30 „hviezdicových alel“ na jeden gén. Nezachytávajú nové a vzácne varianty, najmä v nedostatočne zastúpených populáciách.
Štandardné panely nezachytávajú vzácne varianty a štrukturálne variácie
Štandardné farmakogenomické panely testujú len 10 až 30 „hviezdnych alel“ (haplotypov) na jeden gén – vopred definované kombinácie bežných variantov. Tento prístup zachytáva najbežnejšie varianty vo väčšine populácií, ale prehliada nové alebo vzácne varianty, najmä v nedostatočne zastúpených populáciách. CYP2D6 predstavuje osobitnú výzvu: variácie v počte kópií (CNV – delécie a duplikácie) nie je možné spoľahlivo detekovať len pomocou štandardného sekvenovania; sú potrebné špecializované metódy detekcie počtu kópií. Pacient môže byť nositeľom vzácnych nových variantov, ktoré nie sú zastúpené v štandardnom paneli, čo vedie k nesprávnej predikcii fenotypu metabolizmu. Sekvenovanie celého genómu s analýzou počtu kópií poskytuje komplexnú detekciu variantov, čo umožňuje výpočet fenotypu na základe všetkých detekovaných variantov, a nie len na základe vopred definovaných haplotypov.
Vaše dávky liekov musia zodpovedať vášmu genetickému metabolickému profilu
Fenotyp pomalého metabolizéra CYP2D6: kodeín neposkytuje úľavu od bolesti; tramadol je neúčinný; niektoré antipsychotiká a antidepresíva sa hromadia do toxických hladín, čo si vyžaduje zníženie dávky. Pacienti so slabým metabolizmom CYP2C19: aktivácia klopidogrelu (Plavix) je narušená, čo znižuje protidoštičkový účinok a zvyšuje riziko trombózy stentu po PCI; uprednostňujú sa alternatívne inhibítory P2Y12 (prasugrel, tikagrelor). U ultra-rýchlych metabolizérov CYP3A4 môžu byť potrebné vyššie dávky mnohých substrátov. Výsledky fenotypu zdokumentované v zdravotnej dokumentácii a integrované do elektronických zdravotných záznamov slúžia ako vodítko pre budúce predpisovanie liekov, čím sa predchádza chybám v dávkovaní, ktoré spôsobujú zlyhanie liečby alebo život ohrozujúcu toxicitu.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – v oblasti farmakogenomiky – reakcie na lieky a iných ochorení, či už ide o vzácne alebo bežné ochorenia. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
