Peutz-Jeghersov syndróm – dedičný hamartómový syndróm spojený s kumulatívnym rizikom vzniku rakoviny presahujúcim 85 % v šiestich orgánových systémoch, pri ktorom je potrebné začať s preventívnymi vyšetreniami už v detstve.
Gén STK11 je uvedený v zozname sekundárnych nálezov ACMG SF v3.2. Sekvenovanie celého genómu umožňuje kompletnú charakterizáciu génu STK11, vrátane rozsiahlych genómových delécií, ktoré predstavujú približne 30 % prípadov PJS a ktoré štandardné sekvenčné panely nedokážu spoľahlivo detekovať.
Peutz-Jeghersov syndróm
Peutz-Jeghersov syndróm (PJS) je autozomálne dominantný dedičný syndróm charakterizovaný gastrointestinálnou polypózou a predispozíciou k rakovine, spôsobený patogénnymi variáciami v géne STK11 (serín/treonín kináza 11, známa aj ako LKB1) na chromozóme 19p13.3. Gén STK11 kóduje tumor supresorovú kinázu, ktorá aktivuje AMPK a reguluje bunkovú polaritu a energetický metabolizmus. PJS sa vyznačuje vývojom charakteristických hamartomatóznych polypov v celom gastrointestinálnom trakte (najvýraznejšie v tenkom čreve), výraznou mukokutánnou pigmentáciou (melanínové škvrny na perách, ústnej sliznici, prstoch a v perianálnej oblasti) a dramaticky zvýšeným rizikom rakoviny vo viacerých orgánoch. Prevalencia PJS je približne 1 z 50 000 – 200 000.
Kumulatívne celoživotné riziko vzniku rakoviny pri PJS je mimoriadne vysoké – odhaduje sa na viac ako 85 % do veku 70 rokov pre akýkoľvek typ rakoviny. Medzi individuálne celoživotné riziká vzniku rakoviny patria: rakoviny tráviaceho traktu (tenké črevo ~13 %, hrubé črevo a konečník ~40 %, žalúdok ~29 %), rakovinu pankreasu (~36 %), rakovinu prsníka (~54 % u žien), gynekologické nádory (adenokarcinóm krčka maternice ~10 %, maternice ~9 %, nádor vaječníkov s prstencovitými tubulami ~21 %) a rakovinu pľúc (~15 %). Sledovanie musí začať už v detstve a musí zahŕňať viacero orgánových systémov súčasne. Polypy tenkého čreva spôsobujú v detstve opakované intususcepcie, ktoré často vyžadujú urgentný chirurgický zákrok — tomu je možné predísť pravidelným sledovaním tenkého čreva a profylaktickou polypektómiou v prípade zistenia veľkých polypov.
Približne 94–96 % prípadov PJS spĺňajúcich diagnostické kritériá syndrómu má identifikovateľnú patogénnu variantu génu STK11. Veľké delécie alebo duplikácie zistiteľné pomocou MLPA alebo analýzy variácií počtu kópií predstavujú približne 30 % patogénnych variácií génu STK11 – tieto sa pri štandardných paneloch zameraných výlučne na sekvenovanie exónov nezachytia. Zostávajúcich ~4–6 % klinických prípadov PJS bez zistiteľných variantov STK11 môže predstavovať somatický mozaicizmus, hlboké intronové varianty alebo genetickú heterogenitu. STK11 je zaradený do zoznamu sekundárnych nálezov ACMG SF v3.2, čo odzrkadľuje dostupnosť účinných intervenčných opatrení, ktoré podstatne znižujú úmrtnosť na rakovinu u potvrdených nositeľov.
30 % patogénnych variantov génu STK11 tvoria rozsiahle delécie, ktoré štandardné sekvenčné panely nezachytia. Pri syndróme, pri ktorom je potrebné začať s onkologickým sledovaním už v detstve, má prehliadnutá diagnóza celoživotné následky.
Každá tretia varianta génu STK11 spôsobujúca PJS je delécia – štandardné sekvenčné panely ich nezachytia
Približne 30 % potvrdených patogénnych variantov génu STK11 tvoria rozsiahle genomové delécie zasahujúce jeden alebo viac exónov. Štandardné sekvenčné panely novej generácie, ktoré sekvenujú kódujúce exóny génu STK11, nedokážu spoľahlivo detekovať rozsiahle delécie bez špecializovanej analýzy variácií počtu kópií. U viacerých publikovaných rodín s PJS s kompletným klinickým fenotypom – mukokutánnou pigmentáciou, viacerými hamartomatóznymi polypmi a charakteristickou rodinnou anamnézou – sa zistili delécie STK11, ktoré predchádzali negatívnym výsledkom panelu o mesiace až roky. Pri syndróme, pri ktorom sa pediatrické sledovanie tenkého čreva začína vo veku 8 rokov (odporúčanie NCCN) a sledovanie pankreasu vo veku 35 rokov, má takéto oneskorenie diagnostiky priame dôsledky na prevenciu rakoviny.
Systém PJS sleduje súčasne šesť rôznych typov rakoviny – na spustenie kompletného protokolu stačí jediná definitívna diagnóza
Potvrdenie molekulárnej diagnózy STK11 spúšťa protokol sledovania viacerých orgánov, ktorý sa podstatne líši od štandardných odporúčaní pre skríning rakoviny. Usmernenia NCCN PJS odporúčajú: endoskopiu horného úseku tráviaceho traktu a kolonoskopiu od 8 do 10 rokov; endoskopiu tenkého čreva/kapsulovú endoskopiu od 8 do 10 rokov; ročné MRI prsníkov od 25 rokov s mamografiou od 30 rokov; ročné ultrazvukové vyšetrenie panvy alebo vyšetrenie endometria od 18 rokov; sledovanie pankreasu od 35 rokov (endoskopický ultrazvuk/MRI); a vyšetrenie semenníkov u mužov od narodenia (riziko SCTAT). Žiaden štandardný program skríningu rakoviny nezahŕňa všetky tieto vyšetrenia – potvrdená molekulárna diagnóza PJS je predpokladom na začatie komplexného protokolu, ktorý dáva sledovaniu zmysel.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o Peutz-Jeghersov syndróm alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
