Osteogenesis imperfecta – „choroba krehkých kostí“, ktorej závažnosť sa pohybuje od ojedinelých zlomenín až po perinatálnu úmrtnosť, pričom konkrétna varianta kolagénu typu I určuje prognózu, prístup k liečbe a riziko recidívy pri budúcich tehotenstvách.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje vyhodnotiť gény COL1A1, COL1A2 a všetkých viac ako 20 ďalších génov súvisiacich s osteogenesis imperfecta (OI) – čím poskytuje molekulárnu diagnózu, na základe ktorej sa určuje klasifikácia typu OI, prognóza závažnosti ochorenia a spôsob dedičnosti pre účely genetického poradenstva.
Osteogenesis imperfecta
Osteogenesis imperfecta (OI) je skupina dedičných porúch spojivového tkaniva, ktoré sú spôsobené predovšetkým patogénnymi variantmi v génoch COL1A1 (chromozóm 17q21.33) alebo COL1A2 (chromozóm 7q21.3), ktoré kódujú reťazce α1, resp. α2 kolagénu typu I. Kolagén typu I je najhojnejší štrukturálny proteín v kostiach, koži, šľachách a sklére. OI sa klasifikuje do typov I–V (Sillenceho klasifikácia) na základe klinickej závažnosti, s ďalšími molekulárnymi podtypmi (typy VI–XX) definovanými variantmi v nekolagénových génoch zapojených do spracovania kolagénu, mineralizácie kostí a funkcie osteoblastov. Celková prevalencia je približne 1 z 10 000 – 20 000.
OI typu I (mierny, kvantitatívny deficit kolagénu spôsobený nulovými alelami génu COL1A1) spôsobuje krehkosť kostí sprevádzanú modrými bielkami očí, takmer normálnou výškou a zlomeninami, ktorých počet po puberte klesá. Typ II (perinatálne letálny) spôsobuje viaceré zlomeniny v maternici, ťažké deformácie kostry a úmrtie v perinatálnom období. Typ III (progresívna deformácia) spôsobuje ťažkú krehkosť kostí, progresívnu deformáciu kostry, veľmi nízky vzrast a závislosť od invalidného vozíka. Typ IV (stredne ťažký) sa nachádza medzi typmi I a III. Špecifická varianta COL1A1/COL1A2 – najmä to, či spôsobuje kvantitatívny deficit (haploinsuficiencia, zvyčajne miernejšia) alebo štrukturálnu poruchu (substitúcia glycínu v trojitej špirále kolagénu, zvyčajne závažnejšia) – je hlavným determinantom závažnosti ochorenia.
Liečba zahŕňa cyklické intravenózne podávanie bisfosfonátov (pamidronát, zoledronát – štandardná liečba stredne ťažkej až ťažkej OI, zvyšujúca hustotu kostí a znižujúca počet zlomenín), ortopedickú starostlivosť vrátane intramedulárnej fixácie dlhých kostí, fyzioterapiu a vyšetrenie sluchu (u približne 50 % dospelých s OI dochádza k postupnej strate sluchu). Medzi novšie terapie vo vývoji patria protilátky proti sklerostínu (romosozumab), terapia proti RANKL (denosumab, ktorý preukázal prínos v pediatrických štúdiách OI) a prístupy génovej terapie zamerané na dominantne negatívne alely COL1A1/COL1A2.
Recesívna forma OI (typy VI–XX) je spôsobená mutáciami v génoch nekólagénových proteínov, medzi ktoré patria SERPINF1, CRTAP, P3H1, PPIB, BMP1, IFITM5 a ďalšie – tieto mutácie sa pri testovaní zameranom výlučne na gény COL1A1/COL1A2 nezistia.
Gény COL1A1 a COL1A2 sú zodpovedné za približne 85–90 % prípadov osteogenesis imperfecta (OI), avšak viac ako 20 ďalších génov spôsobuje recesívne a atypické formy tejto choroby. Testovanie jedného génu nezachytí recesívnu formu OI. Sekvenovanie celého genómu poskytuje komplexný obraz molekulárnych mechanizmov.
Konkrétny typ kolagénovej mutácie – haploinsuficiencia verzus substitúcia glycínu – určuje prognózu závažnosti ochorenia
Nulové alely génu COL1A1 (varianty s posunom čítacieho rámca, nonsensové varianty a varianty miesta šplhania, ktoré vedú k vzniku predčasných stop-kodónov) spôsobujú kvantitatívny deficit kolagénu – typicky miernu formu OI typu I s modrými bielkami očí a zníženým rizikom zlomenín po puberte. Naopak, substitúcie glycínu v opakujúcom sa motíve Gly-X-Y trojitej špirály kolagénu (najmä v C-terminálnej oblasti reťazca α1) spôsobujú štrukturálne defekty kolagénu, ktoré vedú k stredne ťažkej až ťažkej OI (typy II–IV). Táto korelácia medzi genotypom a závažnosťou umožňuje prognostické poradenstvo v čase molekulárnej diagnózy — informácie, ktoré nie sú k dispozícii len na základe klinického posúdenia u novorodenca alebo plodu s prenatálnou zlomeninou.
Prenatálne zlomeniny zistené na ultrazvuku môžu byť typu II (smrteľné) alebo typu III (s možnosťou prežitia) – molekulárna diagnostika ich rozlišuje
Prenatálny ultrazvuk môže v druhom trimestri odhaliť viaceré zlomeniny, skrátené končatiny alebo hypopláziu hrudníka. Kľúčovou klinickou otázkou je, či ide o OI typu II (perinatálne letálny, typicky spôsobený de novo dominantnými glycínovými substitúciami v génoch COL1A1/COL1A2) alebo OI typu III (závažný, ale s možnosťou prežitia, tiež spôsobený štrukturálnymi defektmi kolagénu). Toto rozlíšenie má zásadný vplyv na poradenstvo v oblasti liečby. Molekulárna diagnostika na základe amniocentézy alebo CVS môže identifikovať konkrétnu variantu a – na základe publikovaných údajov o genotype a fenotype – poskytnúť na dôkazoch založenú predpoveď závažnosti, ktorú samotný ultrazvuk nedokáže poskytnúť.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o osteogenesis imperfecta alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
