Polypóza spojená s génom MUTYH

Polypóza spojená s génom MUTYH – autozomálne recesívny dedičný syndróm kolorektálneho karcinómu, ktorý pripomína miernejšiu formu FAP, avšak vyžaduje, aby obaja rodičia boli nositeľmi génu, čo znamená, že aj v rodinách bez „rodinnej anamnézy“ rakoviny sa môžu narodiť postihnuté deti.

Sekvenovanie celého genómu zachytáva celý gén MUTYH a identifikuje obe alely súčasne – ide o jediný spôsob, ako stanoviť biallelický genotyp, ktorý definuje MAP a odlišuje ju od APC-negatívnej atenuovanej FAP.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O MUTYH-ASOCIOVANEJ POLYPÓZE

Polypóza spojená s génom MUTYH

Polypóza asociovaná s génom MUTYH (MAP) je autozomálne recesívny dedičný syndróm predisponujúci k kolorektálnemu karcinómu, spôsobený biallelickými patogénnymi variantmi v géne MUTYH na chromozóme 1p34.1, ktorý kóduje DNA-glykozilázu MutY – enzým opravujúci poškodenia DNA exciziou báz, ktorý napravuje oxidačné poškodenia DNA. Na rozdiel od FAP a Lynchovho syndrómu sa MAP dedí recesívne: na plnú expresiu syndrómu musia byť inaktivované obe kópie génu MUTYH. MAP sa vyznačuje adenomatóznym polypózou (typicky 10–100 polypov, prípadne viac), rizikom kolorektálneho karcinómu blížiacim sa k 50–80 % do veku 70 rokov bez sledovania a nižším, ale zvýšeným rizikom duodenálnych adenómov a karcinómu, podobne ako pri atenuovanej FAP.

Dve bežné missense varianty génu MUTYH – c.536A>G (p.Tyr179Cys, predtým Y165C) a c.1187G>A (p.Gly396Asp, predtým G382D) – tvoria približne 80 % alel génu MAP u jedincov severoeurópskeho pôvodu. Tieto dve varianty sú v európskych populáciách tak rozšírené, že heterozygotnosť MUTYH (status nositeľa jednej alely) sa vyskytuje u približne 1–2 % populácie — čo má praktický význam pre poradenstvo v oblasti rizika rakoviny. Nositelia oboch alel (pacienti s MAP) sú najčastejšie zloženými heterozygotmi týchto dvoch bežných variantov. V neeurópskych populáciách však k MAP prispieva širšie a menej charakterizované spektrum variantov MUTYH, a pevné panely s dvoma variantmi majú podstatne zníženú citlivosť.

Autozomálne recesívne dedičstvo MAP má zásadné klinické dôsledky, ktoré sa líšia od dominantných dedičných onkologických syndrómov. Rodič s MAP je povinný heterozygot génu MUTYH, ktorý má v prípade partnerstva s ďalším nositeľom (prevalencia ~1–2 %) 25 % pravdepodobnosť, že sa narodí postihnuté dieťa. Mnohí pacienti s MAP nemajú v rodinnej anamnéze kolorektálny karcinóm, pretože ich rodičia sú nepostihnutí heterozygotní nositelia. To znamená, že MAP by sa malo zvážiť u každého pacienta s 10–100 kolorektálnymi adenómami, aj bez rodinnej anamnézy. Rozlíšenie MAP od APC-negatívnej atenuovanej FAP vyžaduje detekciu oboch alel MUTYH – úloha, ktorá si vyžaduje kompletné sekvenovanie génu MUTYH.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Dvojvariantné MUTYH panely nezachytávajú 20 % alel spojených s ochorením u Európanov a majú nedostatočné pokrytie v mimoeurópskych populáciách. Na stanovenie biallelického stavu je potrebné kompletné sekvenovanie génu – detekcia jedinej alely nikdy nestačí na diagnostiku MAP.

Prítomnosť jedinej varianty génu MUTYH vo výsledkoch panelového testu vám o riziku MAP takmer nič nehovorí

Štandardné panely na polypózu testujú dve bežné varianty génu MUTYH: p.Tyr179Cys a p.Gly396Asp. Správa identifikujúca jednu z týchto variantov označuje pacienta za heterozygotného nositeľa – osobu, ktorá nemá zvýšené riziko kolorektálneho karcinómu len na základe prítomnosti tejto varianty, pokiaľ nie je prítomná aj druhá alela génu MUTYH. Klinické opatrenia závisia výlučne od poznania oboch alel. Ak je pacient kompozitným heterozygotom pre bežnú variantu MUTYH a vzácnu variantu, ktorá nebola testovaná v obmedzenom paneli, má MAP a vyžaduje intenzívne sledovanie alebo profylaktickú kolektómiu. Sekvenovanie celého genómu identifikuje všetky varianty MUTYH v celom géne súčasne, čo umožňuje definitívne biallelické genotypizovanie v jedinom teste.

Pacienti s MAP mimo Európy sú nositeľmi vzácnych variantov génu MUTYH, ktoré panely na detekciu dvoch variantov systematicky prehliadajú

Varianty p.Tyr179Cys a p.Gly396Asp sú bežné u severoeurópanov, avšak v iných populáciách sa vyskytujú v oveľa menšej miere. MAP u pacientov juhoázijského, východoázijského, blízkovýchodného a afrického pôvodu je spôsobená širokou škálou zriedkavých variantov génu MUTYH, z ktorých mnohé sú špecifické pre danú populáciu. Pacient juhoázijského pôvodu s atenuovanou polypózou, ktorého test na panel dvoch variantov MUTYH je negatívny, môže mať MAP spôsobenú vzácnou alelou MUTYH, ktorá nie je zastúpená v paneli. Iba kompletné sekvenovanie génu MUTYH – ako ho poskytuje sekvenovanie celého genómu – má rovnakú citlivosť vo všetkých populačných skupinách.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o polypózu spojenú s génom MUTYH alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs