METYLÁCIA A METABOLIZMUS VITAMÍNU B12

Metylácia a metabolizmus vitamínu B12 — varianty v génoch, ktoré regulujú metabolické dráhy kyseliny listovej a vitamínu B12, môžu spôsobiť únavu, kognitívne problémy a neurologické príznaky. Sekvenovanie celého genómu odhalí vzácne varianty, ktoré štandardné testy nezachytia.

Sekvenovanie celého genómu identifikuje vzácne patogénne varianty v metabolizme kyseliny listovej a vitamínu B12, ktoré spôsobujú závažné neurologické ochorenia, čím ich odlišuje od bežných variantov s diskutabilným klinickým významom.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O METYLÁCII A METABOLIZME VITAMÍNU B12

Metylácia a metabolizmus vitamínu B12

Metabolické dráhy folátu, metylácie a kobalamínu (B12) zohrávajú kľúčovú úlohu pri syntéze DNA, metylačných reakciách a energetickom metabolizme. Na týchto dráhach sa podieľa viacero génov, medzi ktoré patrí MTHFR, ktorý kóduje metylén-tetrahydrofolát reduktázu; MTR, kódujúci metionín syntázu; MTRR, kódujúci metionín syntázu reduktázu; a CBS, kódujúci cystationín β-syntázu. Genetické varianty v týchto génoch môžu narušiť túto dráhu, ale klinický význam závisí kriticky od typu variantu: zriedkavé biallelické varianty so stratou funkcie spôsobujú závažné ochorenia, zatiaľ čo bežné polymorfizmy majú obmedzenú preukázanú klinickú užitočnosť napriek širokému testovaniu.

Najčastejšie testovanou variantou je MTHFR C677T, polymorfizmus, ktorý sa vyskytuje u približne 10–15 % kaukazského obyvateľstva v homozygotnej forme (genotyp TT) a u približne 25 % hispánskej populácie, pričom jeho frekvencia sa u ostatných etník líši. Napriek jeho prevalencii usmernenia ACMG vydané v roku 2013 výslovne neodporúčajú rutinné genotypizovanie MTHFR pri trombofílii alebo opakovaných potratoch, pričom poukazujú na to, že meranie hladiny homocysteínu je z klinického hľadiska užitočnejšie ako samotný genotyp. Klinický vplyv bežných polymorfizmov MTHFR, MTR a MTRR na trombózu, kardiovaskulárne ochorenia a opakované potraty bol vo veľkej miere vyvrátený nedávnymi rozsiahlymi metaanalýzami.

In contrast, rare pathogenic variants in these genes cause distinct clinical entities with profound neurological consequences. Biallelic MTHFR deficiency causes severe homocysteinuria (plasma homocysteine often >100 μmol/L; normal <15 μmol/L), associated with developmental delay, seizures, thrombosis, and vision loss. CBS deficiency similarly produces markedly elevated homocysteine and neurological disease. Identification of rare biallelic variants enables specific treatment: high-dose folate and B12 supplementation, betaine therapy for certain forms, and dietary methionine restriction can prevent or slow neurological deterioration when diagnosed early.

Varianty génu MTHFR pokrývajú široké spektrum: od bežných polymorfizmov s minimálnym klinickým vplyvom až po zriedkavé biallelické mutácie so stratou funkcie, ktoré spôsobujú ťažkú homocystinúriu – test Genome Test zachytáva obidva typy, čím umožňuje správnu klinickú interpretáciu.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Štandardné testy skúmajú bežné polymorfizmy, ktorých užitočnosť je sporná. Hrozí, že prehliadnu vzácne patogénne varianty, ktoré spôsobujú závažné neurologické ochorenia.

Napriek obmedzeným klinickým dôkazom prevládajú v testovaní bežné varianty

Štandardné panely metabolizmu jedného uhlíka sa zameriavajú na bežné polymorfizmy, ako sú MTHFR C677T, MTR 2756A>G a MTRR 66A>G. Tieto varianty sa vyskytujú u významného percenta populácie, ich klinické dôsledky však zostávajú sporné. Rozsiahle metaanalýzy nedokázali preukázať silnú súvislosť medzi týmito bežnými variantmi a trombózou, kardiovaskulárnymi ochoreniami alebo opakovanými potratmi. ACMG vydala jasné usmernenia proti rutinnému testovaniu MTHFR pre tieto indikácie, napriek tomu je testovanie naďalej rozšírené. Sekvenovanie celého genómu zachytáva nielen bežné varianty, ale aj zriedkavé patogénne varianty, ktoré jednoznačne spôsobujú ochorenia – čo umožňuje lekárom rozlišovať medzi benígnymi polymorfizmami a mutáciami spôsobujúcimi ochorenia, ktoré si vyžadujú okamžitý zásah.

Zriedkavé mutácie si vyžadujú včasnú diagnostiku, ešte predtým, ako dôjde k poškodeniu nervového systému

Biallelické varianty s ubytovaním funkcie v génoch MTHFR, MTR, MTRR alebo CBS spôsobujú ťažkú homocystinúriu s hladinou homocysteínu v plazme presahujúcou 100 μmol/l, ktorá je zvyčajne sprevádzaná neurologickými príznakmi, medzi ktoré patria vývojová retardácia, záchvaty, strata zraku a trombóza. Včasná identifikácia týchto vzácnych variantov umožňuje zásah, ktorý môže zmeniť život: suplementácia vysokými dávkami folátu a vitamínu B12, terapia betainom a úprava stravovania môžu zabrániť alebo výrazne spomaliť neurologické zhoršenie. Štandardné testy, ktoré testujú len bežné polymorfizmy, tieto kritické vzácne varianty úplne prehliadajú. Genomický test poskytuje komplexnú detekciu všetkých variantov v tejto dráhe, čo umožňuje správne rozlíšenie medzi benígnymi polymorfizmami a mutáciami spôsobujúcimi ochorenie, ktoré si vyžadujú urgentnú liečbu.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – v oblasti metylácie a metabolizmu vitamínu B12, ako aj iných ochorení, či už ide o zriedkavé alebo bežné ochorenia. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs