ZÁPALOVÉ CHOROBY ČREV

Zápalové ochorenia čriev – Crohnova choroba a ulcerózna kolitída súvisia s viac ako 200 génovými lokusmi ovplyvňujúcimi náchylnosť. Poznanie vášho genetického rizikového profilu pomáha pri výbere liečby a pri predpovedaní priebehu ochorenia.

Sekvenovanie celého genómu odhaľuje komplexný obraz genetickej náchylnosti k zápalovým ochoreniam čriev a identifikuje varianty génov NOD2 a IL23R, ktoré predikujú závažnosť ochorenia a terapeutickú odpoveď.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O ZÁPALOVÝCH CHOROBÁCH ČREV

Zápalové ochorenie čriev (Crohnova choroba)

Zápalové ochorenia čriev (IBD), medzi ktoré patrí Crohnova choroba (CD) a ulcerózna kolitída, sa vyznačujú chronickým zápalom čriev, ktorý vedie k bolestiam brucha, hnačke, krvi v stolici, úbytku hmotnosti a možným komplikáciám, ako sú striktúry, fistuly a kolorektálny karcinóm. Prevalencia Crohnovej choroby je v rozvinutých krajinách približne 1 z 1 000, pričom vyšší výskyt je u mladších pacientov (vrchol výskytu je vo veku 15–35 rokov). Genetický vplyv je podstatný: dedičnosť sa odhaduje na 50–80 % a v tejto oblasti bolo identifikovaných viac ako 200 GWAS lokusov spojených s IBD. Prvým identifikovaným génom náchylnosti na Crohnovu chorobu bol v roku 2001 NOD2/CARD15, čo bol prelomový objav, ktorý otvoril cestu k pochopeniu dysfunkcie vrodeného imunitného systému pri CD. NOD2 kóduje intracelulárny receptor rozpoznávajúci vzory, ktorý detekuje bakteriálny muramyl dipeptid (MDP), čím spúšťa NF-κB signálovanie a zápalovú reakciu. Tri bežné varianty NOD2 (R702W, G908R, 1007fs) predstavujú približne 15–20 % rizika pripisovaného populácii u pacientov s CD európskeho pôvodu.

Homozygotné alebo zložené heterozygotné varianty génu NOD2 zvyšujú riziko Crohnovej choroby približne 20- až 40-násobne v porovnaní s osobami, ktoré tieto varianty nemajú. Varianty génu NOD2 s ubytkami funkcie narúšajú detekciu molekúl MDP a oslabujú zápalové reakcie na baktérie, čím paradoxne zvyšujú riziko ochorenia v dôsledku zlyhania primeranej kontroly baktérií a dysbiotického rozšírenia patogénnej flóry. Tento kontraintuitívny mechanizmus – prečo by znížená imunitná odpoveď spôsobovala zápal? – je teraz chápaný v kontexte dysbiózy a dysfunkcie bariéry. IL23R kóduje receptor interleukínu-23, ktorý sa podieľa na diferenciácii línie Th17; protektívna varianta rs11209026 (R381Q) v skutočnosti znižuje polarizáciu Th17, čo naznačuje, že hyperaktivácia osi IL-23/Th17 riadi IBD. Tento objav viedol priamo k vývoju liečby: inhibítory dráhy IL-23 (ustekinumab, risankizumab, guselkumab) sú teraz schválené pre CD a UC a vyvolávajú dramatické klinické reakcie u podskupín pacientov.

Genotypizácia génu NOD2 poskytuje prognostické informácie o priebehu ochorenia: u homozygotných nositeľov génu NOD2 sa ochorenie zvyčajne prejavuje skôr, postihuje rozsiahlejšiu časť hrubého čreva a vykazuje vyššiu mieru komplikácií, vrátane striktúr a fistúl. U nositeľov protektívnych variantov génu IL23R sa predpokladá lepšia odpoveď na inhibítory IL-23, čo naznačuje, že farmakogenomické predikcie by v budúcnosti mohli slúžiť ako vodítko pri výbere liečby. Genetické poznatky o IBD v zásade ovplyvnili vývoj liekov, nie však zmenu individuálneho manažmentu pacientov; prelomový objav, že varianty IL23R majú ochranný účinok, viedol priamo k vývoju ustekinumabu, risankizumabu a guselkumabu – dnes schválených terapií, ktoré prinášajú úžitok širšej populácii pacientov s IBD. Pochopenie genetických základov IBD posúva klinický pohľad od vnímania tohto ochorenia primárne ako gastrointestinálneho ochorenia k uznaniu jeho hlbokých imunologických základov.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Genetické testovanie nie je štandardnou súčasťou diagnostiky IBD. Test Genome Test zachytáva všetkých viac ako 200 lokusov z GWAS, čím umožňuje komplexné genetické profilovanie rizika.

IBD zahŕňa viac ako 200 genetických lokusov, z ktorých každý má len malý individuálny vplyv

Genetický vplyv na IBD je rozložený na viac ako 200 lokusov identifikovaných v rámci GWAS, z ktorých každý má len malý individuálny vplyv. Štandardné genetické panely túto polygenickú štruktúru neskúmajú. Genotypizácia génu NOD2 sa niekedy vykonáva na účely prognostického posúdenia, nie je však bežnou súčasťou diagnostiky IBD, ktorá sa opiera o endoskopiu, histológiu a rádiológiu. Genetické testovanie nenahrádza klinickú diagnózu. Sekvenovanie celého genómu však poskytuje komplexné údaje o variantoch GWAS potrebné na budúci výpočet polygenického rizikového skóre, čo umožňuje individualizované genetické hodnotenie rizika, ktoré môže nakoniec usmerňovať intenzitu liečby, predpovedať závažnosť ochorenia a slúžiť ako podklad pre rodinné skríningové vyšetrenia.

Varianty génu NOD2 umožňujú predpovedať priebeh ochorenia a terapeutické možnosti

Genotypizácia génu NOD2 umožňuje identifikovať pacientov s vysokým rizikom, u ktorých sa očakáva skorý nástup rozsiahleho ochorenia sprevádzaného komplikáciami. Týmto pacientom prospieva agresívnejšia počiatočná liečba a dôkladnejšie sledovanie vývoja striktúr a fistúl. Genetické varianty génu IL23R umožňujú identifikovať pacientov, ktorí pravdepodobne zareagujú na inhibítory IL-23 – lieky ustekinumab, risankizumab a guselkumab sú v súčasnosti schválené na liečbu Crohnovej choroby a vyvolávajú výraznú odpoveď u geneticky náchylných podskupín pacientov. Komplexné genetické hodnotenie prostredníctvom testu genómu vytvára základ pre budúce klinické využitie: ako polygenické modely rizika dozrievajú a sú klinicky validované, pacienti s genetickými údajmi v záznamoch môžu profitovať z nových terapeutických odporúčaní založených na ich individuálnom genetickom profile.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje s pacientskými združeniami akejkoľvek veľkosti – či už ide o zápalové ochorenia čriev (Crohnova choroba) alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme združenia v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych pacientskych združení.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs