CHOROBY ZVYŠENÉHO UKLADANIA GLYKOGÉNU TYPU I

Glykogénová choroba typu I – pri ktorej konkrétny gén (G6PC alebo SLC37A4) určuje, či pacient čelí len metabolickým problémom, alebo sa u neho vyskytne aj neutropénia, opakované infekcie a zápalové ochorenie čriev, ktoré si vyžadujú dodatočnú cielenú liečbu.

Sekvenovanie celého genómu umožňuje odlíšiť GSD typu Ia (G6PC) od typu Ib (SLC37A4) – ide o zásadný rozdiel, pretože u pacientov s typom Ib sa vyskytuje neutropénia, ktorú je možné liečiť empagliflozínom, repurpózovaným inhibítorom SGLT2, ktorý zásadným spôsobom zmenil liečbu typu Ib.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O CHOROBE Z NADMERNÉHO UKLADANIA GLYKOGÉNU TYPU I

Glykogénová choroba typu I

Glykogénová choroba typu I (GSD-I, von Gierkeho choroba) je autozomálna recesívna porucha metabolizmu glukózy spôsobená deficitom buď glukózo-6-fosfatázy-α (typ Ia, gén G6PC, chromozóm 17q21.31, ~80 % prípadov) alebo glukózo-6-fosfát translokázy (typ Ib, gén SLC37A4, chromozóm 11q23.3, ~20 %). Oba podtypy bránia záverečnému kroku hepatálnej glykogenolýzy a glukoneogenézy — defosforylácii glukózo-6-fosfátu na voľnú glukózu — čo spôsobuje ťažkú hypoglykémiu nalačno, hepatomegáliu, hyperlipidémiu, hyperurikémiu a laktátovú acidózu. GSD-I postihuje približne 1 z 100 000 narodených detí.

GSD-I sa v dojčenskom veku prejavuje hepatomegáliou (masívnou akumuláciou glykogénu), ťažkou hypoglykémiou na lačno (s príznakmi do 3–4 hodín od začiatku pôstu), laktátovou acidózou, hyperlipidémiou (triglyceridy často > 1 000 mg/dl) a hyperurikémiou. Medzi dlhodobé komplikácie patria hepatálne adenómy (vyskytujúce sa u 50–75 % pacientov v dospelosti, s rizikom malígnej transformácie), dna, nefrolitiáza, progresívne ochorenie obličiek a osteoporóza. Diétna liečba – kontinuálny prísun glukózy prostredníctvom častých jedál, surového kukuričného škrobu (ktorý zabezpečuje postupné uvoľňovanie glukózy) a nočného gastrického infúzneho podávania – zabraňuje hypoglykémii a znižuje metabolické poruchy.

Kľúčovým fenotypovým rozdielom medzi typmi Ia a Ib je skutočnosť, že u pacientov s typom Ib dochádza k rozvoju neutropénie a dysfunkcie neutrofilov – čo spôsobuje opakované bakteriálne infekcie, vredy v ústnej dutine a ochorenie podobné zápalovému ochoreniu čriev (IBD) – a to okrem metabolického fenotypu, ktorý majú spoločný s typom Ia. Empagliflozín, inhibítor SGLT2, ktorý bol pôvodne určený na liečbu cukrovky, výrazne zlepšil príznaky neutropénie a IBD u GSD typu Ib tým, že znížil intracelulárnu akumuláciu glukózo-6-fosfátu v neutrofiloch. Táto génovo-špecifická terapia robí molekulárne genotypizovanie nevyhnutným: u pacientov s typom Ia sa neutropénia nevyvíja a empagliflozín im neprináša žiadny úžitok.

Empagliflozín – liek na cukrovku, ktorý bol preorientovaný na liečbu GSD typu Ib – priniesol zásadnú zmenu v liečbe neutropénie a kolitídy podobnej IBD, ktoré sa u pacientov s typom Ib vyskytujú. Táto liečba je indikovaná iba pre typ Ib (SLC37A4), nie pre typ Ia (G6PC).

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

Rozlíšenie medzi typom Ia a typom Ib určuje, či je potrebná liečba neutropénie a terapia empagliflozínom – ide o rozhodnutie o liečbe závislé od genotypu, ktoré štandardné metabolické vyšetrenie nedokáže vyriešiť.

Empagliflozín pri neutropénii typu Ib predstavuje prelom – je však indikovaný len v prípade potvrdeného genotypu SLC37A4

U pacientov s GSD typu Ib dochádza k hromadeniu 1,5-anhydroglukitol-6-fosfátu (1,5-AG6P) v neutrofiloch, čo spôsobuje dysfunkciu neutrofilov a neutropéniu. Empagliflozín blokovaním renálnej reabsorpcie glukózy znižuje hladiny 1,5-AG v krvi a obmedzuje hromadenie 1,5-AG6P v neutrofiloch, čím obnovuje počet a funkciu neutrofilov. Viacero sérií prípadov preukazuje výrazné zlepšenie v oblasti neutropénie, ulcerácie slizníc a symptómov zápalových ochorení čriev. Táto terapia je špecifická pre defekt translokázy SLC37A4; u pacientov s deficitom G6PC (typ Ia) nedochádza k akumulácii 1,5-AG6P a táto terapia im preto neprináša úžitok. Molekulárne genotypovanie identifikuje vhodných kandidátov.

Pečeňové adenómy sa vyskytujú u 50 – 75 % pacientov s GSD-I – sledovanie možnej malígnej transformácie si vyžaduje celoživotné zobrazovacie vyšetrenia

Hepatocelulárne adenómy (HCA) predstavujú závažnú dlhodobú komplikáciu GSD-I, ktorá sa u väčšiny pacientov vyvinie v dospelosti. Hoci väčšina HCA zostáva benígna, dochádza k malígnej transformácii na hepatocelulárny karcinóm (HCC), čo si vyžaduje pravidelné zobrazovacie vyšetrenia pečene (ultrazvuk, MRI) a sledovanie hladiny alfa-fetoproteínu. Potvrdená molekulárna diagnóza GSD-I zaručuje, že pacient bude zaradený do vhodného protokolu sledovania pečene. Okrem toho molekulárna diagnóza umožňuje testovanie nositeľstva u súrodencov a plánovanie reprodukcie u postihnutých dospelých.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o glykogenózu typu I alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs