Gaucherova choroba – lyzozomálna porucha spôsobená mutáciami génu GBA. Identifikácia konkrétnej mutácie určuje typ ochorenia, slúži ako vodítko pri enzýmovej substitučnej terapii a poskytuje podklady pre skríning v rodine.
Sekvenovanie celého genómu identifikuje varianty génu GBA, ktoré spôsobujú akumuláciu v lyzozómoch – čo umožňuje enzýmovú substitučnú liečbu alebo liečbu zameranú na zníženie hladiny substrátu prispôsobenú vášmu genetickému podtypu.
Gaucherova choroba
Gaucherova choroba je autozomálna recesívna lyzozomálna porucha spôsobená mutáciami génu GBA, ktorý kóduje glukocerebrozidázu – enzým rozkladajúci glukocerebrozid na glukózu a ceramid. Varianty génu GBA s ubytovaním funkcie narušujú tento rozklad, čo vedie k hromadeniu glukocerebrozidu v makrofágoch a iných bunkách a k tvorbe charakteristických Gaucherových buniek preplnených lipidmi. Choroba sa prejavuje v troch klinických typoch: Typ 1 (neuropatický, ~95 % prípadov) sa vyznačuje hepatosplenomegáliou, anémiou, trombocytopéniou a progresívnym ochorením kostí; Typ 2 (akútny neuropatický, zriedkavý) je smrteľný vo veku 2–4 rokov; a Typ 3 (chronický neuropatický) vykazuje progresívny neurologický úpadok spolu s postihnutím orgánov.
Gaucherova choroba postihuje celosvetovo približne 1 z 40 000 až 1 z 60 000 ľudí, hoci jej prevalencia je výrazne vyššia v populácii aškenázskych Židov (približne 1 z 850). Bolo identifikovaných viac ako 400 variantov génu GBA. Štyri zakladateľské mutácie u aškenázskych Židov — N370S, 84GG, L444P a IVS2+1G>A — tvoria približne 96 % alel v tejto populácii. Genotyp predikuje závažnosť: Varianty typu 1 (ne-neuronopatické) si zvyčajne zachovávajú reziduálnu enzymatickú aktivitu (~10–30 %), zatiaľ čo varianty typu 2/3 (neuronopatické) znižujú aktivitu výraznejšie alebo produkujú nesprávne zložený enzým. Zaujímavé je, že heterozygotní nositelia GBA (približne 1–3 % všeobecnej populácie) majú 5–10-násobne zvýšené riziko Parkinsonovej choroby, čo odhaľuje neočakávanú súvislosť medzi lyzozomálnou dysfunkciou a neurodegeneráciou.
Potvrdená diagnóza patogénnej varianty génu GBA umožňuje enzýmovú substitučnú liečbu (imiglucerázou, velaglucerázou alfa) alebo liečbu zameranú na zníženie hladiny substrátu (eliglustatom pri type 1, miglustatom pri typoch 1 a 3) – obe sú schválené FDA a priamo pôsobia na molekulárne dôsledky straty funkcie génu GBA. Varianty typu 1 (neuropatické) zvyčajne dobre reagujú na liečbu, ktorá znižuje hepatosplenomegáliu, zlepšuje hematologické parametre a zastavuje progresiu ochorenia kostí. Pre typ 2 (akútny neuropatický) v súčasnosti neexistujú účinné liečby modifikujúce priebeh ochorenia. Typ 3 vykazuje variabilnú odpoveď na enzýmovú substitučnú liečbu. Účinnosť liečby koreluje s genotypom: N370S (miernejší) zvyčajne reaguje lepšie ako L444P (závažnejší). Genetická diagnostika umožňuje včasné začatie liečby, čím sa predchádza nezvratným komplikáciám postihujúcim orgány a kosti.
Genotyp GBA predikuje klinický typ a reakciu na liečbu – varianty typu 1 zvyčajne dobre reagujú na enzýmovú substitučnú liečbu alebo liečbu znížením hladiny substrátu, zatiaľ čo typ 2 zostáva neliečiteľný a typ 3 vykazuje premenlivú reakciu.
Testovanie GBA je z technického hľadiska náročné kvôli kontaminácii pseudogénmi. Existuje viac ako 400 variantov a štandardné sekvenovanie často prináša nejednoznačné výsledky.
Sekvenovanie GBA si vyžaduje špecializované techniky na odlíšenie skutočných variantov od artefaktov spôsobených pseudogénmi
Sekvenovanie génu GBA je technicky náročné, pretože gén GBA má na chromozóme 1 pseudogén (GBAP1), s ktorým zdieľa 96 % sekvenčnej identity. Pri štandardnom sekvenovaní s krátkymi čítaniami dochádza často k nesprávnemu zarovnaniu sekvencií GBA a GBAP1, čo vedie k nejednoznačným alebo nesprávnym výsledkom. Veľké delécie alebo komplexné prestavby nemusia byť detekované len sekvenovaním exómu. Bolo identifikovaných viac ako 400 variantov GBA, z ktorých mnohé sú špecifické pre určitú populáciu. Pre diagnostickú presnosť je nevyhnutné špecializované testovanie GBA s dôkladnou bioinformatickou anotáciou a možnosťou sekvenovania s dlhými čítaniami. Sekvenovanie celého genómu s vhodnými bioinformatickými kontrolami dokáže zachytiť varianty GBA a zároveň kontrolovať kontamináciu pseudogénom.
Výber liečby na základe genotypu výrazne zlepšuje výsledky
Potvrdená patogénna varianta génu GBA umožňuje liečbu enzýmovou substitúciou (imigluceráza, velagluceráza alfa) alebo liečbu znížením hladiny substrátu (eliglustat, miglustat) – lieky schválené FDA, ktoré priamo pôsobia na hromadenie glukocerebrozidu. Odpoveď na liečbu koreluje s genotypom: Varianty typu 1 (ne-neuronopatické) zvyčajne dobre reagujú, pričom dochádza k rýchlemu zníženiu hepatosplenomegálie a zlepšeniu hematologických a kostných parametrov. Menej závažné varianty (N370S) zvyčajne reagujú lepšie ako závažnejšie varianty (L444P). Včasné začatie liečby zabraňuje nevratným komplikáciám postihujúcim orgány a kosti. Heterozygotní nositelia GBA identifikovaní prostredníctvom kaskádového skríningu môžu mať prospech z intenzívnejšieho neurologického sledovania z hľadiska rizika Parkinsonovej choroby.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o Gaucherovu chorobu alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
