Deficit G6PD – najčastejšia enzýmová porucha u ľudí, ktorá postihuje 500 miliónov ľudí a spôsobuje akútne hemolytické krízy v dôsledku užívania bežných liekov, vrátane antimalarík, antibiotík a chemoterapeutík.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje identifikovať kompletný genotyp G6PD – vrátane triedy aktivity špecifickej pre danú variantu, ktorá je potrebná na rozlíšenie triedy I (ťažká, chronická hemolýza) od triedy II–III (hemolýza vyvolaná spúšťačmi) a od triedy IV (normálna aktivita) – s cieľom zabezpečiť bezpečné predpisovanie oxidačných liekov.
Deficit G6PD
Deficit glukózo-6-fosfátdehydrogenázy (G6PD) je najčastejšou enzymopatiou u ľudí, ktorá postihuje odhadom 400 až 500 miliónov ľudí na celom svete. Gén pre G6PD je lokalizovaný na chromozóme X (Xq28) a ide o rýchlosť obmedzujúci enzým pentózofosfátového cyklu, ktorý produkuje NADPH – látku potrebnú na regeneráciu redukovaného glutatiónu a ochranu červených krviniek pred oxidačným poškodením. Červené krvinky s deficitom G6PD sú veľmi citlivé na oxidačný stres, čo vedie k akútnym hemolytickým epizódam, keď sú vyvolané oxidačnými liekmi, infekciou alebo konzumáciou bôbu (favizmus). Neonatálna hyperbilirubinémia je najzávažnejším následkom v novorodeneckom období.
Over 200 G6PD variants have been characterized, classified by WHO into functional activity classes: Class I (severely deficient, <10% activity, associated with chronic non-spherocytic hemolytic anemia); Class II (severely deficient, <10% activity, acute hemolysis on oxidant exposure); Class III (moderately deficient, 10-60% activity, hemolysis only with strong oxidant triggers); Class IV (normal activity, 60-150%); Class V (increased activity). The most common Class II variants are G6PD Mediterranean (c.563C>T, most common in Mediterranean, Middle Eastern, and Indian populations), G6PD A- (c.202G>A + c.376A>G, most common in African ancestry), and G6PD Canton (c.1376G>T, common in Southeast Asian populations). G6PD A- causes Class III disease; G6PD Mediterranean causes Class II disease with more severe hemolytic episodes.
Medzi klinicky významné liekové interakcie patria: primaquín a tafenoquín (profylaxia malárie – podľa FDA vyžadujú stav G6PD triedy B (normálny alebo mierne znížený)), rasburikáza (kontraindikovaná pri deficite G6PD – spôsobuje akútnu život ohrozujúcu hemolýzu), dapson, nitrofurantoín, metylénová modrá (dôležitá ako antidotum pri methemoglobinémii — nemožno použiť pri deficite G6PD) a viaceré chemoterapeutické látky (adriamycín, doxorubicín vo vysokých dávkach). Pre rasburikázu a G6PD existujú usmernenia CPIC úrovne A. FDA vyžaduje testovanie G6PD pred predpísaním tafenoquinu (KrintafelL) na liečbu malárie.
G6PD je viazaná na chromozóm X. Hemizygotní muži prejavujú úplný fenotyp G6PD svojho jediného alela. Heterozygotné ženy majú dva chromozómy X – jeden normálny a jeden s deficitom G6PD – a nerovnomerná inaktivácia chromozómu X u nich vytvára spektrum fenotypov od normálneho až po úplný deficit G6PD.
Testovanie enzýmovej aktivity meria aktivitu G6PD, nie však konkrétnu variantu ani triedu aktivity podľa WHO. Na určenie triedy aktivity, predikciu závažnosti hemolýzy a stanovenie odporúčaní týkajúcich sa vyhýbania sa liekom sú potrebné údaje o variantoch získané sekvenovaním celého genómu.
Testovanie enzýmovej aktivity vedie u žien a počas hemolytických epizód k falošne normálnym výsledkom
Testovanie aktivity enzýmu G6PD – štandardný test G6PD vykonávaný priamo v zdravotníckom zariadení – má v klinickej praxi dve hlavné obmedzenia. Po prvé, u heterozygotných žien, u ktorých inaktivácia chromozómu X favorizuje normálny alel, je nameraná aktivita enzýmu v norme, hoci majú alel s deficitom G6PD, ktorý by mohol spôsobiť významnú hemolýzu, ak by sa inaktivácia chromozómu X počas ochorenia alebo liečby posunula. Po druhé, počas akútnej hemolytickej epizódy sú selektívne zničené červené krvinky s najzávažnejším deficitom G6PD — zvyšná populácia červených krviniek je obohatená o mladšie bunky s menším deficitom a nameraná enzýmová aktivita môže byť falošne zvýšená (falošná normalita). Molekulárne genotypovanie na základe sekvenovania celého genómu identifikuje špecifickú variantu G6PD bez ohľadu na nameranú enzýmovú aktivitu — čím poskytuje správnu klasifikáciu aj vtedy, keď testy enzýmov poskytujú zavádzajúce výsledky.
Konkrétna varianta G6PD určuje, ktoré lieky sú bezpečné – nie všetky formy deficitu G6PD sú rovnaké
G6PD A- (trieda III, bežný u osôb afrického pôvodu) spôsobuje stredne ťažký deficit enzýmu s hemolýzou vyvolanou iba silnými oxidačnými spúšťačmi, ako je vysoká dávka primaquinu – väčšina postihnutých jedincov znáša profylaktické dávky proti malárii pri starostlivom sledovaní. G6PD stredomorský typ (trieda II) spôsobuje ťažký deficit s hemolýzou už pri nižšom oxidačnom strese, vrátane terapeutických dávok liekov, ktoré by pacienti s G6PD A- znášali. Rasburikáza (používaná na liečbu syndrómu lýzy nádorov) je absolútne kontraindikovaná u všetkých pacientov s deficitom G6PD kvôli tvorbe peroxidu vodíka. Tieto klinické rozdiely špecifické pre jednotlivé varianty si vyžadujú molekulárne genotypizovanie – výsledok enzýmovej aktivity neidentifikuje, ktorý variant G6PD je prítomný ani do akej rizikovej kategórie pacient patrí.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o deficit G6PD alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
