Friedreichova ataxia – najčastejšia dedičná ataxia, pre ktorú bola po desaťročiach podporného liečenia konečne schválená prvá liečba FDA, pričom rozsah expanzie určuje priebeh ochorenia a dĺžka opakujúcich sa sekvencií slúži ako vodítko pri rozhodovaní o liečbe.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje presne určiť dĺžku expanzie GAA-opakovaní v oboch alelách génu FXN – odhaľuje prípady zloženej heterozygotnosti (expanzia GAA + bodová varianta), ktoré štandardné testy založené na PCR nikdy nezistia, a poskytuje referenčnú dĺžku expanzie, ktorá slúži ako podklad pre stanovenie prognózy.
Friedreichova ataxia
Friedreichova ataxia (FRDA) je najčastejšou dedičnou ataxiou u osôb európskeho pôvodu, postihuje približne 1 z 50 000 ľudí, pričom frekvencia nositeľstva je približne 1 z 100. Je spôsobená autozomálnou recesívnou stratou funkcie frataxínu (kódovaného génom FXN na chromozóme 9q21.11), mitochondriálneho proteínu podieľajúceho sa na tvorbe železo-sírových klastrov. Deficit frataxínu vedie k akumulácii železa v mitochondriách, oxidačnému stresu a progresívnej neurodegenerácii. FRDA sa vyznačuje progresívnou cerebelárnou a senzorickou ataxiou, kardiomyopatiou (prítomnou v >90 % prípadov a hlavnou príčinou úmrtia), diabetes mellitus (vyvíjajúcim sa u približne 10–20 %) a deformitami kostry (skolióza, pes cavus).
Molekulárna príčina FRDA je nezvyčajná: približne 96–98 % patogénnych alel predstavujú expanzie trinukleotidovej sekvencie GAA v introne 1 génu FXN. Normálne alely obsahujú 5–33 opakovaní GAA; alely s úplnou expanziou obsahujú 66 až viac ako 1 000 opakovaní, pričom premutačné alely v rozmedzí 34–65 predstavujú riziko nestability, ale pri tomto počte opakovaní ešte nespôsobujú ochorenie. Dĺžka expanzie významne koreluje s klinickým fenotypom: väčšie expanzie v kratšej alele korelujú s skorším nástupom ochorenia a závažnejšou kardiomyopatiou. Približne 2–4 % prípadov FRDA sú zložené heterozygotné – jedna alela s expanziou GAA a jedna konvenčná patogénna bodová mutácia (missense, nonsense, miesto šplhania) na druhej alele. Tieto zložené heterozygotné prípady úplne unikajú testom založeným na PCR, ktoré detekujú iba dĺžku expanzie GAA.
V februári 2023 schválila FDA prvú liečbu ovplyvňujúcu priebeh ochorenia pre FRDA: omaveloxolón (Skyclarys), aktivátor Nrf2, ktorý zlepšuje funkciu mitochondrií a znižuje oxidačný stres. Toto schválenie predstavuje historický míľnik po desaťročiach, počas ktorých bola liečba čisto symptomatická. Vďaka dostupnosti schválenej liečby sa včasná diagnostika a presná molekulárna charakterizácia – vrátane stanovenia veľkosti expanzie a detekcie zloženého heterozygotného stavu – stáva priamo terapeutickou pri určovaní vhodnosti liečby a monitorovaní reakcie na liečbu.
2–4 % prípadov FRDA predstavujú zložené heterozygotné prípady: jedna expanzia GAA + jedna bodová mutácia na druhej alele. Štandardné testy GAA-PCR v týchto prípadoch vykazujú kratšiu alelu ako „normálnu“, čo vedie k falošne negatívnemu výsledku, v dôsledku čoho zostávajú pacienti nediagnostikovaní.
Štandardné testovanie expanzie GAA pomocou PCR odhalí homozygotnú expanziu – čo je najčastejší prípad –, avšak nezachytí zloženú heterozygotnú formu FRDA (expanzia + bodová mutácia). Sekvenovanie celého genómu identifikuje oba mechanizmy súčasne.
Komplexná heterozygotná forma FRDA nie je zistiteľná štandardnou PCR, čo má za následok, že u 2–4 % pacientov zostáva diagnóza nestanovená
Testovanie GAA-opakovaní pomocou PCR – štandardný diagnostický test prvej línie pri FRDA – meria veľkosť GAA-opakovaní na oboch alelách. U pacientov s kombinovanou heterozygotnosťou (jedna alela s expanziou + jedna alela s bodovou mutáciou) štandardný PCR test zistí expanziu na jednej alele, ale na druhej alele vykazuje normálny počet opakovaní. To vedie k výsledku, ktorý zdanlivo ukazuje heterozygotnú expanziu GAA — často interpretovanú ako „nositeľstvo“ namiesto „postihnutia“ — a vedie k nesprávnej alebo oneskorenej diagnóze. Sekvenovanie génu FXN sa musí vykonať pri všetkých zdanlivých výsledkoch „heterozygotnej expanzie“, aby sa vylúčila zložená heterozygotnosť. Sekvenovanie celého genómu vykonáva meranie expanzie opakovaní aj kompletné sekvenovanie génu FXN v jednej analýze.
Presné stanovenie rozsahu expanzie GAA určuje prognózu a slúži ako vodítko pri rozhodovaní o liečbe omaveloxolonom
Dĺžka GAA-opakovaní v kratšej (alela 1) expanzii je najsilnejším prediktorom veku nástupu FRDA – každých ďalších 100 GAA-opakovaní je spojených s približne o jeden rok skorším nástupom. Pacienti s kratšími alelami v rozmedzí 66–400 opakovaní majú sklon k neskoršiemu nástupu (v dospievaní až v dospelosti) s pomalším neurologickým progresom, ale môžu mať aj tak výraznú kardiomyopatiu. Pacienti s expanziami alely 1 nad 700 opakovaní majú sklon k skoršiemu nástupu a závažnejšiemu priebehu ochorenia. Tieto informácie o veľkosti expanzie slúžia ako vodítko pri prognostickom poradenstve, intenzite kardiologického sledovania a – s nedávno schváleným omaveloxolonom – pri diskusii o pomere prínosov a rizík začatia liečby v rôznych štádiách ochorenia.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o Friedreichovu ataxiu alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
