Familiárna adenomatózna polypóza – stovky až tisíce kolorektálnych polypov spôsobených stratou funkcie génu APC, ktoré bez chirurgického zákroku takmer s istotou prerastú do rakoviny.
Sekvenovanie celého genómu zachytáva kompletnú sekvenciu génu APC – vrátane hlbokých intronových oblastí, rozsiahlych delécií a mozaikových variantov, ktoré štandardné panely na dedičné formy rakoviny systematicky nedokážu odhaliť.
Familiárna adenomatózna polypóza
Familiárna adenomatózna polypóza (FAP) je autozomálne dominantný dedičný syndróm kolorektálneho karcinómu spôsobený patogénnymi variantmi v tumor-supresorovom géne APC (adenomatous polyposis coli) na chromozóme 5q22.2. Klasická FAP sa vyznačuje vznikom stoviek až tisícov adenomatóznych polypov v celom hrubom čreve, ktoré sa zvyčajne objavujú v druhom desaťročí života. Bez chirurgického zákroku je kolorektálny karcinóm v piatom desaťročí prakticky nevyhnutný – celoživotné riziko kolorektálneho karcinómu sa pri neliečenej klasickej FAP blíži k 100 %. FAP predstavuje približne 0,5–1 % všetkých kolorektálnych karcinómov a odhaduje sa, že postihuje 1 z 5 000 až 1 z 10 000 jedincov.
Attenuovaná FAP (AFAP) je miernejšia fenotypová varianta spôsobená mutáciami v špecifických oblastiach génu APC (5'-koniec, exón 9 alebo 3'-koniec) a vyznačuje sa menším počtom polypov (10–100), neskorším nástupom polypózy, nižším, ale stále podstatne zvýšeným rizikom kolorektálneho karcinómu a variabilnejším prejavom. Korelácie medzi genotypom a fenotypom pri FAP sú dobre známe: variácie v kodónoch 1250–1464 (najmä v kodóne 1309) sú spojené s hustou polypózou a skorším výskytom kolorektálneho karcinómu; varianty v kodónoch 1310–1330 a 1445–1580 sú spojené s vyšším rizikom desmoidných nádorov; a varianty na 5'-konci sú spojené s AFAP. Mimokolónové prejavy — vrátane adenómov dvanástnika (100 % celoživotné riziko), rakoviny štítnej žľazy, hepatoblastómu (u detí), desmoidných nádorov, vrodenej hypertrofie pigmentového epitelu sietnice (CHRPE) a osteómov — sa líšia podľa umiestnenia varianty APC.
Približne 20 – 30 % prípadov klasickej FAP je spôsobených de novo variantmi génu APC bez rodinných anamnéz polypózy. Ďalších 7 – 10 % pacientov, ktorí spĺňajú klinické kritériá pre FAP, nemá žiadnu zistiteľnú variantu génu APC štandardným sekvenovaním – táto skupina môže vykazovať hlboké intronové varianty šplhania, rozsiahle genómové prestavby (delécie, duplikácie) alebo somatický mozaicizmus, ktoré štandardné testovanie génových panelov nedokáže odhaliť. Polypóza asociovaná s MUTYH (MAP), spôsobená biallelickými variantmi MUTYH, môže vyvolať fenotyp, ktorý je nerozoznateľný od atenuovanej FAP, a vyžaduje súbežné genotypovanie MUTYH u pacientov s APC-negatívnou polypózou.
Klasická FAP, atenuovaná FAP (AFAP) a polypóza asociovaná s génom MUTYH (MAP) vykazujú prekrývajúce sa klinické obrazy, ktoré majú odlišné genetické príčiny a chirurgické dôsledky. Umiestnenie variantu génu APC určuje riziko extrakolónových prejavov.
Štandardné panely na detekciu dedičného rakoviny analyzujú kódujúce exóny génu APC. Nezachytávajú však hlboké intronové varianty, rozsiahle prestavby a mozaikové mutácie – teda varianty, ktoré vysvetľujú negatívne výsledky panelov v rodinách s klinickými príznakmi.
Až u 30 % pacientov s klinicky diagnostikovanou FAP je výsledok testu na APC v rámci štandardných panelov negatívny
Štandardné panely na detekciu dedičného rakoviny sekvenujú kódujúcu oblasť génu APC a miesta šplhania. Nedokážu spoľahlivo detekovať rozsiahle genómové delécie alebo duplikácie zasahujúce viaceré exóny, hlboké intronové varianty, ktoré vytvárajú abnormálne miesta šplhania, ani somatický mozaicizmus – keď je varianta génu APC prítomná len v časti buniek. Štúdie zistili, že 7–10 % pacientov s klasickou FAP bez identifikovanej kódujúcej varianty APC nesie hlboké intronové alebo štrukturálne rearanžované varianty, ktoré je možné detekovať iba komplexnou genomickou analýzou. Ďalšia podskupina nesie somatické mozaikové mutácie APC, kde frakcie variantných alel v rozmedzí 10–20 % môžu byť pri štandardnej hĺbke sekvenovania panelov prehliadnuté. Sekvenovanie celého genómu s 30-násobným pokrytím a analýzou variácií počtu kópií všetky tieto problémy vyrieši.
Lokalizácia variantu APC určuje chirurgickú stratégiu a intenzitu sledovania
Chirurgická liečba kolorektálnych ochorení pri FAP nie je univerzálna. Pacienti s variantmi v kodónoch 1250–1464 a hustou polypózou zvyčajne vyžadujú rekonštrukčnú proktokolektómiu s ileálnou anastomózou. Pacienti s AFAP alebo riedkou polypózou môžu byť liečení segmentálnou kolektómiou s ileorektálnou anastomózou a endoskopickým sledovaním. Stratifikácia rizika desmoidov – kritická pre chirurgické plánovanie u pacientov s rizikom intraabdominálneho desmoidného nádoru – závisí od umiestnenia varianty APC v kodónoch 1310–1580. Žiadna z týchto genotypovo-fenotypových stratifikácií nie je možná bez kompletného genotypu APC, čo si vyžaduje sekvenovanie celého génu vrátane regulačných a intronových oblastí.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so združeniami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o familiárnu adenomatóznu polypózu alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme združenia v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych združení pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
