Cystinóza

Cystinóza – ak sa liečba cysteamínom začne už v ranom detstve, zachová sa funkcia obličiek po celé desaťročia; bez nej však u detí dochádza do veku 10 rokov k zlyhaniu obličiek v konečnom štádiu.

Sekvenovanie celého genómu identifikuje všetky patogénne varianty génu CTNS – vrátane bežnej 57-kb delécie, ktorá predstavuje 50 % alel v severnej Európe – a poskytuje tak molekulárnu diagnózu, na základe ktorej sa zahajuje život zachraňujúca liečba cysteamínom.

Certifikované podľa CLIA Akreditované v rámci SPP Laboratórium podľa normy ISO 15189 ACMG – dôverné HIPAA a GDPR Sekvenovaných viac ako 100 000genómov
O CYSTINÓZE

Cystinóza

Cystinóza je autozomálna recesívna lyzozomálna porucha akumulácie spôsobená patogénnymi variantmi v géne CTNS (cystinín, chromozóm 17p13.2), ktorý kóduje lyzozomálny transportér cystínu. Deficit CTNS spôsobuje hromadenie cystínu v lyzozómoch všetkých typov buniek, čo vedie k progresívnemu poškodeniu buniek. Existujú tri klinické formy: infantílna nefropatická cystinóza (najčastejšia, ~95 %, prejavujúca sa vo veku 6–12 mesiacov s renálnym Fanconiho syndrómom), juvenilná/adolescentná nefropatická cystinóza (miernejšia, neskorší nástup) a okulárna ne-nefropatická cystinóza (nástup v dospelosti, iba kryštály v rohovke). Incidencia je približne 1 na 100 000 – 200 000 narodených detí.

Infantílna nefropatická cystinóza sa prejavuje renálnym Fanconiho syndrómom – dysfunkciou proximálnych renálnych tubulov, ktorá spôsobuje polyúriu, polydipsiu, aminoacidúriu, fosfaturiu (vedúcu k rachitíde), glukózúriu a poruchu rastu. Bez liečby chronické ochorenie obličiek postupuje do terminálneho štádia zlyhania obličiek (ESRD) približne vo veku 10 rokov. Okrem obličiek sa cystín hromadí v rohovkách (charakteristické refraktívne kryštály pri vyšetrení štrbinovou lampou), štítnej žľaze (hypotyreóza), pankrease (diabetes), svaloch (myopatia) a CNS (progresívna encefalopatia). Transplantácia obličiek napraví zlyhanie obličiek, ale nezabráni hromadeniu cystínu v iných orgánoch.

Cysteamín (Cystagon, Procysbi) je špecifická liečba – látka, ktorá znižuje hladinu cystínu, preniká do lyzozómov a reaguje s cystínom za vzniku zlúčeniny, ktorá sa vylučuje prostredníctvom iného transportéra, čím obchádza defektný cystinozín. Liečba cysteamínom začatá v ranom veku (ideálne pred vznikom významného poškodenia obličiek vo veku 6–12 mesiacov) zachováva funkciu obličiek po celé desaťročia – medián veku pri terminálnom zlyhaní obličiek sa posunul z ~10 rokov (bez liečby) na ~20+ rokov (s liečbou) a mnohí liečení pacienti si zachovávajú pôvodnú funkciu obličiek až do veku 30 rokov a viac. Cysteamín sa musí užívať po celý život a vyžaduje prísne dodržiavanie liečebného režimu – prerušenie liečby umožňuje opätovnú akumuláciu cystínu.

Bežná 57-kb delécia génu CTNS predstavuje približne 50 % alel cystinózy v severoeurópskych populáciách. Táto delécia odstraňuje celý gén CTNS a zasahuje do susedného génu CARKL – bežné metódy založené výlučne na sekvenovaní ju nemusia bez analýzy počtu kópií zistiť.

PREČO SEKVENCIA CELÉHO GENÓMU

57-kb delécia génu CTNS – najčastejšia mutácia pri cystinóze – je štrukturálna varianta, ktorej detekcia si vyžaduje vyšetrenie na prítomnosť delécie. Metóda WGS umožňuje v rámci jedného testu identifikovať ako sekvenčné varianty, tak aj túto bežnú deléciu.

Cysteamín podávaný už v ranom detstve oddiaľuje terminálne zlyhanie obličiek o desiatky rokov – každý mesiac oneskorenia diagnózy znamená merateľnú stratu funkcie obličiek

Priestupný priebeh neliečenej cystinózy je neúprosný: terminálne zlyhanie obličiek (ESRD) sa objavuje približne vo veku 10 rokov. Začatie liečby cysteamínom pred dovŕšením 2 rokov posúva nástup ESRD na vek nad 20 rokov a pri optimálnej liečebnej spolupráci čoraz častejšie až do 30. rokov a neskôr. Každý mesiac oneskorenia diagnózy umožňuje pokračujúce hromadenie cystínu v renálnych tubulárnych bunkách, ktoré nie je možné úplne zvrátiť. Novorodenecké skríningové vyšetrenie na cystinózu ešte nie je všeobecné – u väčšiny pacientov sa diagnóza stanoví až po prejave symptómov Fanconiho syndrómu vo veku 6–12 mesiacov. Celogenómové sekvenovanie (WGS) vykonané z akéhokoľvek dôvodu v dojčenskom veku môže identifikovať varianty génu CTNS ešte pred nástupom symptómov, čo umožňuje začať podávať cysteamín ešte pred klinickým prejavom.

Transplantácia obličiek cystinózu NEVYLIEČI – na prevenciu hromadenia cystínu mimo obličiek je potrebné pokračovať v celoživotnom užívaní cysteamínu

Po transplantácii obličky nie je transplantovaná oblička postihnutá cystinózou (bunky darcu majú funkčný gén CTNS). Cystín sa však naďalej hromadí vo všetkých tkanivách mimo obličiek – v rohovkách, štítnej žľaze, pankrease, svaloch a mozgu. Bez pokračovania v liečbe cysteamínom po transplantácii dochádza k rozvoju progresívnych extrarenálnych komplikácií. Niektoré rodiny sa mylne domnievajú, že transplantácia je liečebná, a prerušia podávanie cysteamínu – s devastujúcimi dôsledkami pre dlhodobú funkciu orgánov mimo obličiek. Molekulárna diagnostika CTNS zabezpečuje, že rodina a všetci ošetrujúci lekári chápu systémovú povahu ochorenia.

ČO V SKUTOČNOSTI ZNAMENÁ SEKVENCIA CELÉHO VAŠEHO GENÓMU
01

Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)

Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.

02

Komplexné analýzy a odborné správy

Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.

03

Vaša skúška získava každým rokom na hodnote

Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.

VÝSLEDKY

Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.

Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.

Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.

Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.

Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.

Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.

Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.

Pozrite si výsledky →
KOMU POMÁHAME

Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.

Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.

Už bolo otestované

DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.

Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.

Zistiť viac

Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.

30-násobné pokrytie celého genómu
Viac ako 5 miliónov variantov identifikovaných na jeden test
Viac ako 200 prispôsobených klinických správ
99,98 % presnosť sekvencovania

Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.

Akreditované a publikované v

Dodatky k zákonu o zlepšení klinických laboratórií Kolegium amerických patológov Americká spoločnosť pre ľudskú genetiku Nature Medzinárodná spoločnosť pre bunkovú a génovú terapiu Časopis Gene
ČASTO KLADENÉ OTÁZKY

Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.

Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?

Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.

Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?

Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.

Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?

Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.

V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?

Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.

Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?

Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.

SKUPINY ZASTUPUJÚCE ZÁUJMY PACIENTOV

Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.

Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o cystinózu alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.

Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.

  • Individuálne genomické správy pre vašich členov
  • Skupinové zľavy a balíčky na mieru
  • Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
  • Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia

Jeden test.
Odpovede na celý život.

Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.

Doprava po celom svete zadarmo
Expedujeme do 48 hodín
Výsledky za 6–8 týždňov

Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov

Súprava na testovanie genómu od Dante Labs