Cystická fibróza – v niektorých populáciách dosahuje frekvencia nositeľov génu CFTR až 1 z 25 osôb. Komplexné vyšetrenie na varianty génu CFTR pred plánovaním rodiny odhalí nositeľstvo, ktoré štandardné skríningové testy môžu prehliadnuť.
Sekvenovanie celého genómu identifikuje všetky známe varianty génu CFTR, čo umožňuje skríning nositeľov, plánovanie rodičovstva a prístup k presnej liečbe modulátormi CFTR.
Cystická fibróza
Cystická fibróza (CF) je autozomálne recesívne multisystémové ochorenie postihujúce pľúca, pankreas, pečeň, reprodukčný trakt a potné žľazy. Prevalencia je približne 1 z 2 500 – 3 500 v kaukazskej populácii; frekvencia nositeľov je približne 1 z 25 Kaukazcov. Ochorenie je spôsobené biallelickými patogénnymi variantmi v géne CFTR, ktorý kóduje regulátor transmembránovej vodivosti pri cystickej fibróze, chloridový kanál kritický pre správnu rovnováhu tekutín a elektrolytov v epitelových tkanivách. Bolo identifikovaných viac ako 2 000 variantov génu CFTR. F508del (delécia fenylalanínu 508) je zďaleka najčastejšia, predstavuje približne 70 % alel CF na celom svete a vyskytuje sa u približne 90 % pacientov s CF (buď heterozygotných, alebo homozygotných). Klinicky sa CF prejavuje progresívnym ochorením pľúc (opakované infekcie, bronchiektázia), pankreatickou nedostatočnosťou (malabsorpcia, cukrovka) a stratou soli. Medián dĺžky života sa predĺžil z detského veku v 80. rokoch na približne 50 rokov v súčasnosti, a to predovšetkým vďaka agresívnej liečbe pľúcnych ochorení a čoraz viac vďaka terapiám modulátorov CFTR, ktoré premenili CF z fatálneho detského ochorenia na zvládnuteľné chronické ochorenie.
Gén CFTR kóduje chloridový kanál s dĺžkou 1 480 aminokyselín, regulovaný cAMP, ktorý sa nachádza na apikálnych membránach epitelových buniek. Varianty sa klasifikujú podľa mechanizmu: trieda I (nonsense, posun čítacieho rámca, kanonické miesto šplhania) nevytvára žiadny proteín; trieda II (defekty spracovania vrátane F508del) spôsobuje nesprávne zloženie a degradáciu v endoplazmatickom retikule; trieda III (defektné otváranie kanála) narúša otváranie; trieda IV (znížená vodivosť) umožňuje čiastočný tok chloridov; trieda V (znížené množstvo) produkuje nízke hladiny funkčného proteínu. F508del je varianta triedy II, ktorá spôsobuje nesprávne zloženie a predčasnú degradáciu. Proteín CFTR je absolútne kľúčový pre sekréciu chloridov; strata funkcie vedie k dehydratovaným, viskóznym sekrétom v dýchacích cestách a vývodoch, čo spôsobuje obštrukciu, infekciu a zápal. V súčasnosti sú schválené tri lieky modulujúce CFTR, ktoré zmenili výsledky liečby: ivakaftor aktivuje mutácie brány; lumakaftor/ivakaftor koriguje nesprávne zloženiu F508del; elexakaftor/tezakaftor/ivakaftor sa vzťahuje na približne 90 % pacientov s CF.
Genotypizácia génu CFTR je kľúčová pre diagnostiku cystickej fibrózy a čoraz viac aj pre výber liečby. Ivakaftor (Kalydeco) aktivuje špecifické mutácie ovplyvňujúce gating (G551D, G1244E a ďalšie) a prináša úľavu približne 4–6 % pacientov s cystickou fibrózou. Lumacaftor/ivacaftor (Orkambi) je určený pre homozygotných pacientov s mutáciou F508del – približne 15 % pacientov s CF – a prináša zlepšenie FEV1 o približne 6 bodov. Elexacaftor/tezacaftor/ivacaftor (Trikafta), schválený pre pacientov s CF s aspoň jednou kópiou mutácie F508del, rozširuje oprávnenosť na približne 90 % pacientov s CF; Trikafta prináša zlepšenie FEV1 približne o 10 bodov a dramaticky zmenila situáciu v oblasti CF – zdá sa, že od schválenia klesá úmrtnosť. Genotyp CFTR priamo určuje, ku ktorému modulátoru (modulátorom) má pacient prístup, čo robí genetické testovanie nevyhnutným pre usmerňovanie liečby a umožňuje individuálny výber liečby.
Štandardné testy na cystickú fibrózu (CF) skríningujú 23–32 bežných variantov. Nezachytávajú vzácne mutácie a vykazujú nízku citlivosť u populácií s neeurópskym pôvodom.
Štandardné panely nezachytávajú vzácne varianty génu CFTR a obsahujú medzery v rodokmeni
Štandardné skríningové panely na nositeľstvo CF testujú 23–32 bežných variantov (napríklad rozšírený panel ACMG-23). Táto stratégia zachytáva približne 88 % nositeľov v kaukazskej populácii, avšak len približne 64 % v hispánskej, približne 49 % v afroamerickej a približne 30 % v ázijskej populácii – ide o významnú medzeru v rovnosti v oblasti zdravia. Rozšírené panely obsahujúce viac ako 100 variantov zlepšujú detekciu, ale stále prehliadajú vzácne varianty. Súčasné štandardné panely neposudzujú modifikátorové gény (ako napríklad TGFB1, MBL2), ktoré ovplyvňujú závažnosť ochorenia. Sekvenovanie celého genómu zachytáva všetky varianty CFTR vrátane nových, čím poskytuje definitívne posúdenie statusu nositeľa pre všetky populácie a umožňuje komplexné hodnotenie genetického rizika.
Genotyp CFTR určuje prístup k liečbe modulátormi, ktorá môže zmeniť život
V súčasnosti sú schválené tri lieky pôsobiace ako modulátory CFTR: ivakaftor pre špecifické mutácie ovplyvňujúce gating (G551D, G1244E atď.), lumakaftor/ivakaftor pre homozygotov s mutáciou F508del a elexakaftor/tezakaftor/ivakaftor pre pacientov s aspoň jednou kópiou mutácie F508del. Liečivo Trikafta je schválené pre približne 90 % pacientov s CF a od schválenia znížilo mortalitu, pričom prinieslo zlepšenie FEV1 o približne 10 bodov. Genotyp CFTR priamo určuje, ktorý modulátor je pre pacienta dostupný. Genotyp, ktorý je zdokumentovaný v zdravotnej dokumentácii a oznámený pacientovi, umožňuje informovanú diskusiu o možnostiach liečby, očakávaniach z liečby a prognóze – čím sa predchádza oneskorenému stanoveniu diagnózy a umožňuje včasnú intervenciu, ktorá môže zachovať funkciu pľúc a výrazne zlepšiť výsledky liečby.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so združeniami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o cystickú fibrózu alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme združenia v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych združení pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
