Cowdenov syndróm – porucha funkcie génu PTEN, ktorá spôsobuje jedno z najvyšších celoživotných rizík vzniku rakoviny prsníka spomedzi všetkých dedičných syndrómov, spolu so zvýšeným rizikom rakoviny endometria, štítnej žľazy, hrubého čreva a obličiek.
Gén PTEN je uvedený v zozname ACMG SF v3.2, ktorý obsahuje gény, pri ktorých je potrebné hlásiť sekundárne nálezy v rámci klinického sekvenovania genómu. Sekvenovanie celého genómu umožňuje charakterizovať kompletný lokus PTEN – vrátane variácií v promótorovej oblasti a rozsiahlych delécií, ktoré štandardné panely na detekciu rakoviny bežne nezachytávajú.
Cowdenov syndróm — syndróm hamartómov a nádorov PTEN
Cowdenov syndróm (CS) – najčastejší zo syndrómov PTEN-hamartómových nádorov (PHTS) – je autozomálne dominantný syndróm predisponujúci k rakovine, spôsobený patogénnymi variáciami v géne PTEN (homológ fosfatázy a tensínu) na chromozóme 10q23.31. PTEN je tumor supresor, ktorý reguluje signálnu dráhu PI3K/AKT/mTOR; strata funkcie PTEN vedie k nekontrolovanej bunkovej proliferácii a tvorbe nádorov. Cowdenov syndróm sa vyznačuje mukokutánnymi léziami (trichilemmomy, papilomatózne papuly a akrálne keratózy), makrocefáliou, benígnymi hamartómami vo viacerých orgánoch a podstatne zvýšeným rizikom viacerých malígnych nádorov. Odhadovaná prevalencia je 1 z 200 000, hoci molekulárne diagnózy odhaľujú výrazne vyššiu frekvenciu.
Celoživotné riziko rakoviny u nositeľov patogénnych variantov génu PTEN patrí medzi najvyššie zdokumentované hodnoty spomedzi všetkých génov zodpovedných za dedičnú rakovinu: riziko rakoviny prsníka dosahuje 67–85 % (v porovnaní s približne 12 % v priemere v populácii); riziko rakoviny endometria sa pohybuje v rozmedzí 28–44 %; riziko rakoviny štítnej žľazy (predovšetkým folikulárnej) dosahuje 21–38 %; riziko kolorektálneho karcinómu je zvýšené (9–18 %); a riziko karcinómu obličkových buniek je približne 34 %. Muži, ktorí sú nositeľmi tohto génu, majú zvýšené riziko rakoviny prsníka a sú tiež vystavení zvýšenému riziku rakoviny štítnej žľazy a kolorektálneho karcinómu. Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndróm (BRR) a Proteusov syndróm (PS) predstavujú alelické poruchy PTEN s prekrývajúcimi sa, ale odlišnými klinickými príznakmi, ktoré sú všetky spôsobené patogénnymi variantmi génu PTEN.
Približne 25 % osôb spĺňajúcich klinické diagnostické kritériá pre Cowdenov syndróm nemá identifikovateľnú variantu kódujúcej sekvencie génu PTEN – táto skupina môže vykazovať varianty v promótorovej oblasti génu PTEN, hlboké intronové varianty, rozsiahle genómové prestavby alebo patogénne varianty v iných génoch spojených s PHTS (SDHB, SDHD, KLLN). Usmernenia NCCN odporúčajú komplexnú analýzu PTEN vrátane testovania delécií/duplikácií ako súčasť kompletného vyhodnotenia PHTS. Manažment potvrdených nositeľov PTEN zahŕňa ročné MRI prsníkov od veku 30 rokov, ročné mamogramy od veku 30–35 rokov, zváženie mastektómie na zníženie rizika, ročné odbery vzoriek endometria od veku 30–35 rokov a ročné ultrazvukové vyšetrenie štítnej žľazy.
Medzi nádorové syndrómy spojené s hamartómami PTEN patria Cowdenov syndróm, Bannayanov-Rileyov-Ruvalcabov syndróm, Proteusov syndróm a Proteusov-podobný syndróm – ide o alelické ochorenia s prekrývajúcimi sa, ale klinicky odlíšiteľnými prejavmi, ktoré sú všetky spôsobené patogénnymi variantmi génu PTEN.
Varianty promotora génu PTEN a rozsiahle genómové prestavby tvoria až 25 % prípadov PHTS – ide o varianty, ktoré štandardné panely na detekciu dedičného rakovinového rizika, ktoré sekvenujú iba kódujúce exóny génu PTEN, systematicky prehliadajú.
Varianty v oblasti promotora génu PTEN sú z väčšiny panelov na detekciu rakoviny vylúčené
U pacientov s Cowdenovým syndrómom, ktorí vykazujú negatívne výsledky pri štandardnom sekvenovaní exónov génu PTEN, boli identifikované patogénne varianty v oblasti promotora génu PTEN – najmä opakujúca sa varianta c.-1019_-1018dupTA. Tieto varianty znižujú transkripciu génu PTEN, čo vedie k funkčnej haploinsuficiencii bez zmeny kódujúcej sekvencie. Štandardné panely na rakovinu sekvenujú iba 9 kódujúcich exónov PTEN a kanonické miesta šplhania; nezahŕňajú oblasť promotora ani intergenové regulačné prvky. Sekvenovanie celého genómu číta kompletný lokus PTEN vrátane promotora, všetkých intrónov a 3' UTR — oblastí, kde sa nachádzajú regulačné patogénne varianty.
Riadenie rizika viacerých typov rakoviny si vyžaduje potvrdenie stavu génu PTEN v čo najskoršom veku
Riziko vzniku rakoviny súvisiace s génom PTEN patrí medzi najvyššie zo všetkých dedičných syndrómov a sledovanie musí začať už v tretej dekáde života – ešte predtým, ako je väčšina prípadov rakoviny prsníka a endometria v tejto populácii klinicky zistiteľná. NCCN odporúča každoročné MRI prsníkov a mamografiu od veku 30 rokov, pričom sledovanie endometria sa začína vo veku 30–35 rokov. Tento agresívny plán sledovania je odôvodnený údajmi o celoživotnom riziku, ale na jeho implementáciu je potrebná potvrdená patogénna varianta PTEN. Negatívny výsledok na neúplnom paneli – ktorý nehodnotil promotor PTEN ani štrukturálne prestavby – môže poskytovať falošnú istotu, ktorá o roky odkladá potrebné sledovanie.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Learn more →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – v súvislosti s Cowdenovým syndrómom – syndrómom PTEN hamartómov a ďalšími ochoreniami, či už ide o vzácne alebo bežné ochorenia. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
