Vrodené poruchy glykozilácie — viac ako 170 genetických podtypov postihujúcich všetky orgánové systémy, pri ktorých diagnostický proces trvá v priemere roky, pretože žiadny jednotlivý špecialista nedokáže posúdiť celkový obraz ochorenia.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje súčasné vyhodnotenie všetkých viac ako 170 génov CDG – čím sa ukončia niekoľkoročné diagnostické bludiská a poskytne sa konkrétna genetická diagnóza, ktorá spája zdanlivo nesúvisiace multisystémové príznaky.
Vrodené poruchy glykozilácie
Vrodené poruchy glykozylácie (CDG) tvoria rýchlo sa rozširujúcu skupinu viac ako 170 genetických ochorení spôsobených defektmi v glykozylačnom reťazci – enzymatickom procese, pri ktorom sa cukrové reťazce (glykány) viažu na proteíny a lipidy. Glykozylácia je nevyhnutná pre správne zloženie proteínov, bunkovú signalizáciu, fungovanie imunitného systému a vývoj orgánov. Poruchy takmer v ktoromkoľvek kroku glykozylačnej dráhy môžu spôsobiť multisystémové ochorenie. PMM2-CDG (predtým CDG-Ia), spôsobené patogénnymi variantmi v géne PMM2 (fosfomannomutáza 2), je najčastejším podtypom, ktorý predstavuje približne 70–80 % diagnostikovaných prípadov CDG.
CDG spôsobuje veľmi variabilné multisystémové ochorenie v závislosti od postihnutého génu: neurologické príznaky (mentálna retardácia, hypoplázia mozočku, epizódy podobné cievnej mozgovej príhode, záchvaty), poruchy funkcie pečene (zvýšené hladiny transamináz, enteropatia so stratou bielkovín, koagulopatia), kostné anomálie (vpáčené bradavky, abnormálne rozloženie tuku, kyfoskolióza), hematologické abnormality (koagulopatia spôsobená defektnou glykozyláciou zrážacích faktorov), oftalmologické nálezy (retinitis pigmentosa, šilhanie) a endokrinná dysfunkcia. Multisystémové postihnutie často vedie k fragmentovaným odborným vyšetreniam bez jednotnej diagnózy.
CDG sa čoraz viac považuje za skupinu ochorení s nedostatočnou diagnostikou – zvýšené povedomie a genomické testovanie viedli k exponenciálnemu nárastu počtu identifikovaných génov CDG a diagnostikovaných pacientov. Isoelektrická fokusácia transferínu (TIEF) je tradičný skríningový test na CDG s N-glykoziláciou, avšak u väčšiny podtypov CDG s O-glykoziláciou, GPI-kotvením a lipidovou glykoziláciou vykazuje normálne výsledky. Mnohé podtypy CDG sa v súčasnosti diagnostikujú iba prostredníctvom genomického sekvenovania. Medzi nové liečebné metódy patrí suplementácia manózy (pre MPI-CDG, jediný typ CDG s overenou diétnou liečbou), acetazolamid (pre epizódy podobné cievnej mozgovej príhode pri PMM2-CDG) a prístupy génovej terapie v predklinickom vývoji.
MPI-CDG je jediný podtyp CDG, pri ktorom je veľmi účinná diétna liečba – jednoduchá perorálna suplementácia manózou. Rozlíšenie MPI-CDG od PMM2-CDG si vyžaduje molekulárne genotypizovanie a má priamy vplyv na liečbu.
Viac ako 170 génov CDG nie je možné skríningovo zistiť pomocou jediného biochemického testu ani génového panelu. WGS je jediný test, ktorý posudzuje kompletnú genetickú mapu CDG – vrátane novo popísaných podtypov, ktoré zatiaľ nie sú zahrnuté v žiadnom klinickom paneli.
Priemerná dĺžka diagnostického odkladu pri CDG je 5–7 rokov – pomocou WGS je možné stanoviť diagnózu už za niekoľko týždňov
Pacienti s CDG zvyčajne navštevujú v priebehu rokov viacerých špecialistov – neurológov, hepatológov, hematológov, endokrinológov – skôr, než sa zistí spoločný defekt glykozylácie. Postihnutie viacerých systémov paradoxne spomaľuje stanovenie diagnózy, pretože žiadny jednotlivý špecialista nemá prehľad o celkovom stave. WGS vyhodnocuje všetkých viac ako 170 génov CDG z jedného vzorku krvi, čím potenciálne poskytuje v priebehu týždňov diagnózu, ktorú postupné vyšetrenia u špecialistov nedokázali stanoviť ani za roky. Ide presne o klinický scenár, v ktorom komplexná genomická analýza prekonáva tradičné prístupy diferenciálnej diagnostiky.
Každý rok sa objavujú nové gény CDG – iba WGS dokáže identifikovať gény, ktoré zatiaľ nie sú zahrnuté v žiadnom klinickom paneli
Počet známych génov CDG sa za posledné desaťročie viac než zdvojnásobil a každý rok sa opisujú nové podtypy. Klinické genové panely sú vždy retrospektívne – testujú gény známe v čase, keď bol panel navrhnutý, čo môže byť o 1–3 roky za súčasným objavom génov. WGS zachytáva kompletný genóm, čo umožňuje opätovnú analýzu, keď sú publikované nové gény CDG, bez nutnosti ďalšieho odberu krvi alebo sekvenovania. Približne 30 % predtým nevyriešených prípadov CDG je vyriešených prostredníctvom prístupov k objavovaniu génov založených na WGS.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so združeniami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o vrodené poruchy glykozilácie alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme združenia v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych združení pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov