Syndróm predispozície na nádory BAP1 – nedávno identifikovaný dedičný syndróm rakoviny s vysokou penetranciou, pri ktorom jedna génová varianta predisponuje k štyrom rôznym typom rakoviny súčasne, z ktorých mnohé sú v bežnej populácii mimoriadne vzácne.
Sekvenovanie celého genómu identifikuje patogénne varianty génu BAP1 – uvedené v zozname ACMG SF v3.2 – pri syndróme, pri ktorom jediný genetický nález vedie k zavedeniu sledovania z hľadiska uveálneho melanómu, mezoteliómu, kožného melanómu a karcinómu obličkových buniek.
Syndróm predispozície k nádorom BAP1
Syndróm predispozície na nádory BAP1 (BAP1-TPDS) je autozomálne dominantný dedičný onkologický syndróm spôsobený patogénnymi variáciami v géne BAP1 (proteín asociovaný s BRCA1) na chromozóme 3p21.1. BAP1 je deubikvitiláza, ktorá sa podieľa na remodelácii chromatínu, reakcii na poškodenie DNA a regulácii bunkového cyklu. Patogénne varianty génu BAP1 v zárodočných bunkách boli systematicky charakterizované až od roku 2011 – tento syndróm je popísaný relatívne nedávno, čo znamená, že v mnohých postihnutých rodinách sa po generácie vyskytovalo viacero neobvyklých nádorov bez dedičného vysvetlenia. BAP1-TPDS je v súčasnosti uznávaný ako syndróm s vysokou penetranciou a predispozíciou na viacero nádorov.
Spektrum nádorov pri BAP1-TPDS je charakteristické – nositelia majú podstatne zvýšené riziko vzniku: uveálneho melanómu (očného melanómu postihujúceho cievnatku, dúhovku a ciliárne teleso; >50-násobok rizika v bežnej populácii), malígneho mezoteliómu pleury (vzácny typ rakoviny silne spojený s expozíciou azbestu, ktorý sa v súčasnosti vyskytuje aj u nositeľov BAP1 s minimálnou alebo žiadnou anamnézou expozície azbestu), kožného melanómu (viacnásobné primárne melanómy, často s charakteristickými melanocytovými atypickými intradermálnymi nádormi s mutáciou BAP1 — lézie typu „BAPoma“) a karcinómu obličkových buniek (najmä podtypy s jasnými bunkami a chromofóbne). Každý z týchto typov rakoviny je sám osebe nezvyčajný; ich spoločný výskyt v jednej rodine je epidemiologickým signálom, ktorý identifikoval BAP1-TPDS.
Klinické dôsledky molekulárnej diagnózy BAP1 sú bezprostredné a týkajú sa viacerých špecializácií. Pri stanovení diagnózy sa začnú vykonávať ročné oftalmologické vyšetrenia vrátane fundoskopického vyšetrenia (sledovanie uveálneho melanómu), ročné dermatologické vyšetrenia s dermatoskopiou (sledovanie kožného melanómu a BAPómu), zobrazovacie vyšetrenia obličiek od tretej do štvrtej dekády (sledovanie RCC), zváženie ročného zobrazovacieho vyšetrenia hrudníka (sledovanie mezoteliómu u exponovaných nositeľov) a kaskádové testovanie všetkých príbuzných prvého stupňa. Dôležité je, že mezotelióm asociovaný s BAP1 sa uznáva ako odlišná klinická entita od mezoteliómu vyvolaného azbestom — pacienti s mezoteliómom BAP1 sú zvyčajne mladší, majú dlhšie prežívanie po stanovení diagnózy a môžu mať odlišné profily odpovede na chemoterapiu.
Gén BAP1 bol ako gén zodpovedný za dedičný rakovinový syndróm identifikovaný až po roku 2011 a nie je zahrnutý v mnohých starších paneloch na skríning dedičných rakovinových syndrómov. Rodiny s uveálnym melanómom, mezoteliómom alebo neobvyklým výskytom rakoviny v rodine môžu mať mutáciu BAP1-TPDS, pričom nikdy neboli riadne vyšetrené.
BAP1 chýba v starších paneloch na dedičné formy rakoviny – rodiny s neobvyklou anamnézou rakoviny neboli nikdy testované
Systematická charakterizácia génu BAP1-TPDS sa začala až v roku 2011. Mnohé rodiny s patogénnymi variantmi BAP1 absolvovali v predchádzajúcom desaťročí genetické vyšetrenia na dedičné formy rakoviny, ktoré nezahŕňali gén BAP1. Jedinci s rodinnou anamnézou zahŕňajúcou uveálny melanóm, mezotelióm alebo nezvyčajné zhlukovanie melanómu a rakoviny obličiek – hlavné spektrum nádorov spojených s BAP1 – mohli získať negatívne výsledky z testov vykonaných pred rokom 2011 alebo z testov, ktoré nikdy nezahrnuli gén BAP1 do svojho zoznamu génov. Sekvenovanie celého genómu vyhodnocuje celý genóm a identifikuje patogénne varianty BAP1 bez ohľadu na to, kedy bolo sekvenovanie vykonané, bez obmedzenia vopred definovaného zoznamu génov.
Potvrdený výsledok testu BAP1 spustí štyri simultánne protokoly sledovania rakoviny
Na rozdiel od dedičných onkologických syndrómov, pri ktorých jeden gén predurčuje predovšetkým k jednému typu rakoviny, BAP1-TPDS si vyžaduje koordináciu sledovania štyroch rôznych typov rakoviny – melanómu uveálneho traktu (oftalmológia), kožného melanómu (dermatológia), karcinómu obličkových buniek (urológia/radiológia) a mezoteliómu (pneumológia/onkológia). Táto koordinácia viacerých špecializácií začína pri prvej molekulárnej diagnóze a pokračuje každoročne po celý život. Každá forma sledovania sa zameriava na rakovinu, ktorú štandardné populačné skríningy nezahŕňajú – žiadny existujúci všeobecný program skríningu rakoviny nezahŕňa uveálny melanóm a skríning mezoteliómu nie je štandardný u nediagnostikovaných nositeľov BAP1. Molekulárna diagnóza je predpokladom pre aktiváciu tejto siete sledovania viacerých orgánov.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o syndróm predispozície na nádory BAP1 alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
