Riziko dedičného rakovinového ochorenia ATM – gén zodpovedný za opravu poškodenia DNA, ktorý je zaradený do zoznamu sekundárnych nálezov ACMG, zvyšuje riziko rakoviny prsníka, pankreasu a prostaty a priamo ovplyvňuje citlivosť na inhibítory PARP a chemoterapiu na báze platiny.
Sekvenovanie celého genómu zachytáva všetkých 66 exónov génu ATM súčasne – ide o jediný spôsob, ako spoľahlivo zistiť celé spektrum variantov génu ATM, vrátane rozsiahlych delécií a hlbokých intronových variantov, ktoré štandardné onkologické panely systematicky podhodnocujú.
Riziko dedičného rakovinového ochorenia u ATM
Gén ATM (ataxia-telangiectasia mutated) kóduje serín-treonínovú proteínkinázu, ktorá je hlavným regulátorom reakcie na zlomy dvojitej špirály DNA. Biallelické patogénne varianty ATM spôsobujú ataxiu-telangiektáziu (AT), zriedkavé závažné multisystémové ochorenie charakterizované cerebelárnou ataxiou, okulomotorickou apraxiou, imunodeficienciou, telangiektáziami a výrazne zvýšeným rizikom rakoviny – najmä lymfoidných malignít. Heterozygotné patogénne varianty ATM, prítomné u približne 0,5–1 % všeobecnej populácie, sú spojené s menej závažným, ale klinicky významným syndrómom predispozície na rakovinu, ktorý bol presne charakterizovaný až v posledných rokoch prostredníctvom rozsiahlych populačných genomických štúdií.
U heterozygotných nositeľov génu ATM sa odhaduje celoživotné riziko rakoviny prsníka na 20–25 % (v porovnaní s približne 12 % v priemere v populácii), pričom smernice NCCN odporúčajú u týchto osôb zvýšenú kontrolu rakoviny prsníka (ročné MRI prsníkov od 40. roku života). Nositelia génu ATM čelia tiež zvýšenému riziku rakoviny pankreasu (približne 5–7 % počas života v porovnaní s ~1,5 % v priemere v populácii), zvýšenému riziku rakoviny prostaty u mužov (najmä vysokého stupňa) a potenciálne zvýšenému riziku rakoviny hrubého čreva a vaječníkov. Gén ATM je teraz zaradený do zoznamu sekundárnych nálezov ACMG SF v3.2, čo odzrkadľuje konsenzus, že u identifikovaných nositeľov sú opodstatnené zmeny v klinickom manažmente.
ATM má priame dôsledky aj mimo stratifikácie rizika rakoviny – ide o teranostický biomarker. Nádory vznikajúce u pacientov s deficitom ATM môžu byť obzvlášť citlivé na liečivá, ktoré využívajú deficity v opravných dráhach DNA: inhibítory PARP, chemoterapiu na báze platiny a inhibítory kinázy ATM, ktoré sú v súčasnosti v klinických štúdiách. Stav ATM v zárodočnej línii teraz ovplyvňuje rozhodnutia o liečbe rakoviny — olaparib je schválený FDA na liečbu metastatického kastráciou rezistentného karcinómu prostaty u pacientov s patogénnymi variantmi ATM a klinické štúdie hodnotia kombinácie inhibítorov PARP na liečbu rakoviny pankreasu u nositeľov ATM. Táto dvojitá úloha — riadenie rizika dedičnej rakoviny a výber liečby — robí kompletné genotypovanie ATM čoraz naliehavejším.
ATM je gén pozostávajúci z 66 exónov, u ktorého bolo zdokumentovaných viac ako 3 000 variantov. Mnohé z týchto variantov ATM sú varianty s nejasným významom – na ich správnu interpretáciu je potrebné kompletné sekvenovanie génu v kontexte jeho funkcie.
Gén ATM má 66 exónov a tisíce variantov – v obmedzených paneloch sa zriedkavé patogénne alely často prehliadajú
Gén ATM patrí medzi najrozsiahlejšie gény predisponujúce k rakovine; má dĺžku 150 kilobáz a obsahuje 66 kódujúcich exónov. Bolo zdokumentovaných viac ako 3 000 variácií sekvencie génu ATM, z ktorých väčšina sú missense variácie s neistým významom. Trunkčné variácie (nonsense, posun čítacieho rámca, zásadné miesto šplhania) sa pri identifikácii jednoznačne klasifikujú ako patogénne. Veľké delécie ATM – detekovateľné iba analýzou variácií počtu kópií – tvoria významnú časť patogénnych variácií ATM v prípadoch familiárneho rakovinového ochorenia a nie sú spoľahlivo detekované štandardným panelovým sekvenovaním. Sekvenovanie celého genómu pokrýva všetkých 66 exónov so súčasnou analýzou variácií počtu kópií, čím sa vyrieši celé spektrum variácií ATM.
Stav génu ATM v zárodočných bunkách teraz určuje vhodnosť liečby inhibítormi PARP pri rakovine prostaty
FDA schválila lieky olaparib (Lynparza) a rucaparib (Rubraca) na liečbu metastázujúceho kastráciou rezistentného karcinómu prostaty u pacientov s patogénnymi variantmi génu ATM, a to popri variantoch génov BRCA1/2. Vďaka tomuto schváleniu sa testovanie germline génu ATM stáva pre pacientov s karcinómom prostaty priamym predpokladom na liečbu – pacient, u ktorého kompletná genetická analýza preukáže pozitívny výsledok na ATM, môže byť vhodným kandidátom na monoterapiu inhibítormi PARP namiesto chemoterapie. Klinické štúdie tiež hodnotia inhibítory PARP špecificky pri germinálnom ATM-pozitívnom karcinóme pankreasu (oblasť s veľmi málo schválenými možnosťami). Na presné určenie somatického vs. germinálneho stavu a posúdenie vhodnosti liečby je potrebné kompletné genotypovanie ATM – nie čiastočný panel, pri ktorom môžu chýbať zriedkavé trunkčné alebo štrukturálne varianty.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so združeniami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o riziko dedičného rakovinového ochorenia ATM alebo iné ochorenia, vzácne aj bežné. Podporujeme združenia v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych združení pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
