Deficit alfa-1-antitrypsínu – častá genetická príčina emfyzému s raným nástupom a ochorenia pečene, ktoré zostáva v priemere 7 rokov po objavení sa príznakov nediagnostikované.
Sekvenovanie celého genómu zachytáva celý gén SERPINA1, identifikuje všetky alely Pi – vrátane vzácnych kombinácií zloženého heterozygotného stavu – s cieľom stanoviť kompletný genotyp a predpovedať riziko pľúcnych a pečeňových ochorení.
Deficit alfa-1-antitrypsínu
Deficit alfa-1-antitrypsínu (AATD) je autozomálne kodominantné ochorenie spôsobené patogénnymi variantmi v géne SERPINA1, ktorý kóduje alfa-1-antitrypsín (AAT) – inhibítor serínovej proteázy produkovaný predovšetkým v hepatocytoch, ktorý chráni pľúcny parenchým pred deštrukciou sprostredkovanou neutrofilnou elastázou. Odhaduje sa, že AATD postihuje 1 z 2 500 jedincov európskeho pôvodu a približne 3,4 milióna ľudí na celom svete, čo z neho robí jedno z najčastejších závažných monogénnych ochorení – napriek tomu zostáva chronicky a závažne poddiagnostikované. Medián času od prvých respiračných symptómov po stanovenie diagnózy je 7–8 rokov, počas ktorých dochádza k akumulácii nezvratného poškodenia pľúc.
Alely génu SERPINA1 sa označujú podľa nomenklatúry Pi (inhibítor proteázy). Normálna alela je Pi*M. Klinicky najvýznamnejšie varianty sú Pi*Z (p.Glu342Lys; rs28929474) a Pi*S (p.Glu264Val; rs17580). Homozygoti Pi*ZZ – najviac postihnutý genotyp – majú sérové hladiny AAT približne 15 % normálu, a to v dôsledku zníženej sekrécie aj intrahepatálnej polymerizácie nesprávne zloženého proteínu Z. Zložené heterozygoti Pi*SZ majú hladiny AAT približne 40 % normálu a čelia zvýšenému, ale nižšiemu riziku pľúcneho ochorenia. Polymerizujúci proteín Z sa hromadí v hepatocytoch, čo u časti jedincov s genotypom Pi*ZZ spôsobuje progresívne ochorenie pečene (cirhóza, hepatocelulárny karcinóm) prostredníctvom špecifického toxického mechanizmu získania funkcie, ktorý je nezávislý od mechanizmu pľúcneho ochorenia.
Doplnková liečba intravenóznym inhibítorom alfa-1-proteinázy (Prolastin, Zemaira, Aralast) spomaľuje progresiu emfyzému u pacientov s Pi*ZZ s potvrdenou obštrukciou dýchacích ciest – ide o jedinú liečbu schválenú špecificky pre túto chorobu. Prínos pre prežívanie je najvýraznejší, ak sa liečba začne pred významným poškodením pľúc. Fajčenie dramaticky urýchľuje pľúcne ochorenie pri AATD; fajčiari s Pi*ZZ strácajú pľúcnu funkciu 3–4-krát rýchlejšie ako nefajčiari s AATD. Včasná diagnóza umožňuje poradenstvo v oblasti odvykania od fajčenia pred vznikom nezvratného poškodenia, vyhýbanie sa expozícii prachu a výparom v pracovnom prostredí a začatie augmentačnej terapie v optimálnom štádiu ochorenia.
Bolo popísaných viac ako 120 variantov génu SERPINA1. Vzácne alely (Pi*I, Pi*F, Pi*P, Pi*Null) spôsobujú celé spektrum fenotypov nedostatku AAT, od stredného nedostatku až po úplnú absenciu sekrétneho proteínu.
Pri štandardnom testovaní AATD sa skúmajú alely Z a S samostatne. Kompletné genotypizovanie génu SERPINA1 si vyžaduje zistenie úplnej alelovej štruktúry – vrátane vzácnych aliel, ktoré určujú, či pacient trpí AATD, alebo je len nositeľom jednej alely s deficitom.
Heterozygoti s kombináciou Pi*SZ sa pri binárnych testoch Z/S často prehliadajú
Skúšky na skríning AATD vykonávané priamo v zdravotníckom zariadení aj štandardné laboratórne testy sú optimalizované na detekciu alely Z (Pi*Z) a uvádzajú genotypy Pi*MZ alebo Pi*ZZ. Zložený heterozygotný genotyp Pi*SZ – ktorý so sebou nesie významné riziko pľúcneho ochorenia a vyskytuje sa približne u 1 z 625 ľudí európskeho pôvodu – si vyžaduje súčasnú charakterizáciu aliel Z aj S. Zriedkavé varianty SERPINA1, ktoré nie sú zahrnuté v obmedzených paneloch, produkujú hladiny AAT ekvivalentné Pi*MZ alebo Pi*ZZ u pacientov, ktorí sú pri skríningu iba na alelu Z testovaní ako „normálni“. Kompletné genotypovanie SERPINA1 prostredníctvom sekvenovania celého genómu identifikuje všetky alely súčasne, vrátane zriedkavých kombinácií zložených heterozygotov, ktoré sa pri binárnom testovaní javia ako normálne.
Rozlíšenie medzi Pi*MZ a Pi*ZZ určuje, či je pacient vhodný na augmentačnú liečbu
Odporúčania organizácií NICE, ERS a ATS odporúčajú augmentačnú liečbu AAT pre pacientov s genotypmi Pi*ZZ a Pi*null s potvrdeným obstrukčným pľúcnym ochorením – nie však pre nositeľov genotypu Pi*MZ. Klinické a finančné dôsledky tohto rozlíšenia genotypov sú významné: augmentačná liečba stojí približne 50 000 – 100 000 USD ročne. Presné genotypizovanie rozlišuje pacientov, ktorí spĺňajú podmienky na augmentačnú liečbu, od nositeľov, ktorí vyžadujú len sledovanie a poradenstvo ohľadom rizikových faktorov. Bez kompletnej genotypizácie SERPINA1 by pacient s genotypom Pi*SZ s veľmi nízkou nameranou hladinou AAT mohol byť nesprávne klasifikovaný ako Pi*MZ a mohlo by mu byť odmietnuté vhodné liečenie – alebo naopak, nositeľovi genotypu Pi*MZ s koexistujúcou CHOCHP by mohla byť predpísaná augmentačná liečba, ktorú usmernenia pre AATD nepodporujú.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje so záujmovými skupinami pacientov akejkoľvek veľkosti – či už ide o deficit alfa-1-antitrypsínu alebo iné ochorenia, či už zriedkavé, alebo bežné. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych záujmových skupín pacientov.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
