Precitlivenosť na abakavir — HLA-B*57:01, varianta, vďaka ktorej je abakavir liekom na liečbu HIV pre väčšinu ľudí, avšak u 5 – 8 % Európanov, ktorí sú nositeľmi tejto varianty, môže vyvolať potenciálne život ohrozujúcu precitlivenostnú reakciu.
Sekvenovanie celého genómu umožňuje kompletné typizovanie HLA triedy I – vrátane alely HLA-B*57:01, ktorej skríning pred predpísaním abakaviru vyžaduje FDA – spolu so všetkými ostatnými alelami HLA relevantnými z farmakogenomického hľadiska.
Precitlivenosť na abakavir — HLA-B*57:01
Abakavir (Ziagen) je nukleozidový inhibítor reverznej transkriptázy (NRTI), ktorý sa používa ako kľúčová zložka kombinovanej antiretrovírusovej liečby infekcie HIV. Približne u 5 – 8 % pacientov, ktorým bol predpísaný abakavir bez predchádzajúceho skríningu na HLA-B*57:01, sa vyvinie potenciálne život ohrozujúca hypersenzitívna reakcia (HSR) charakterizovaná horúčkou, vyrážkou, gastrointestinálnymi príznakmi a malátnosťou, ktorá sa objaví v priebehu prvých 6 týždňov liečby. U pacientov, u ktorých sa vyvinie HSR a ktorí následne neúmyselne opäť začnú užívať abakavir – napríklad ak nebola diagnóza jasne zdokumentovaná – môže byť reakcia závažná a rýchlo smrteľná, sprevádzaná akútnou hypotenzou a zlyhaním viacerých orgánov.
Súvislosť medzi HLA-B*57:01 a precitlivenosťou na abakavir patrí medzi najsilnejšie farmakogenomické súvislosti v medicíne. Nositelia HLA-B*57:01, ktorí užívajú abakavir, majú približne 50–60 % riziko vývoja HSR, v porovnaní s približne 0–1 % u nenositeľov. Mechanizmus zahŕňa proteín HLA-B*57:01, ktorý prezentuje abakavir alebo jeho metabolity ako súčasť drážky viažucej peptidy na CD8+ T bunky, čo spúšťa polyklonálnu cytotoxickú reakciu T buniek. HLA-B*57:01 sa vyskytuje u približne 5–8 % jedincov európskeho pôvodu, 1–3 % jedincov afrického pôvodu a menej ako 1 % jedincov ázijského pôvodu, čo robí skríning obzvlášť dôležitým v populáciách s HIV európskeho pôvodu.
FDA v roku 2008 doplnila k abakaviru varovný text v rámčeku, ktorý vyžaduje skríning na HLA-B*57:01 pred začatím liečby abakavirom alebo v jej priebehu. Rovnako aj usmernenia WHO pre liečbu HIV odporúčajú skríning na HLA-B*57:01 pred použitím abakaviru. Zavedenie všeobecného skríningu pred liečbou znížilo výskyt imunologicky potvrdených hypersenzitívnych reakcií na abakavir približne o 50 %. Tento test je štandardnou súčasťou liečby HIV v Spojených štátoch, Európskej únii a čoraz viac aj v krajinách s nízkymi a strednými príjmami. HLA-B*57:01 je tiež spojený s poškodením pečene vyvolaným flucloxacilínom a rizikom hypersenzitivity na karbamazepín, čo robí kompletné typizovanie HLA – ako ho poskytuje sekvenovanie celého genómu – všeobecne cenným u pacientov so zložitými liekovými režimami.
Existujú komerčné testy zamerané výlučne na HLA-B*57:01, ktoré predstavujú štandardnú starostlivosť pred začatím liečby abakavirom. Sekvenovanie celého genómu prináša komplexné typizovanie HLA – v rámci jedného testu pokrýva okrem B*57:01 aj HLA-B*15:02, HLA-B*58:01 a ďalšie klinicky relevantné alely HLA.
Komplexné typizovanie HLA zahŕňa viacero alel spôsobujúcich život ohrozujúcu precitlivenosť na lieky v jednom výsledku
HLA-B*57:01 je len jednou z viacerých alel HLA, u ktorých bola zdokumentovaná súvislosť s precitlivenosťou na lieky. HLA-B*15:02 (karbamazepín – SJS/TEN u populácií juhovýchodnej Ázie), HLA-B*58:01 (alopurinol-SJS/TEN), HLA-B*57:01 (poškodenie pečene flucloxacilínom) a HLA-A*31:01 (precitlivenosť na karbamazepín u Európanov) sú všetky klinicky využiteľné alely s odlišným geografickým rozložením a asociáciami špecifickými pre lieky. Pacient, ktorý užíva viacero liekov, môže mať viacero relevantných farmakogenomických hľadísk týkajúcich sa HLA. Sekvenovanie celého genómu vykonáva kompletné typizovanie HLA triedy I a II s vysokým rozlíšením — poskytuje kompletný farmakogenomický profil HLA v jedinom teste namiesto objednávania samostatných testov na jednotlivé alely pre každý relevantný liek.
Stav HLA-B*57:01 je trvalý výsledok – ten istý genóm, ktorý predikuje riziko spojené s abakavirom, slúži aj ako podklad pre rozhodnutia o predpisovaní liekov počas celého života
Na rozdiel od mnohých výsledkov klinických laboratórnych vyšetrení, ktoré si vyžadujú pravidelné opakované testovanie, genotyp HLA je daný už pri narodení a nikdy sa nemení. Výsledok HLA-B*57:01 získaný raz – či už z cieleného testu alebo sekvenovania celého genómu – je platný po celý život. Kontraindikácia predpísania abakaviru platí bez ohľadu na štádium liečby HIV alebo komorbidity. U pacientov s HIV, ktorí môžu v priebehu mnohých rokov meniť liečebné režimy, zaručuje trvalé zaznamenanie genotypu HLA v zdravotnej dokumentácii, že sa pri každom budúcom rozhodnutí o liečbe vyhnú režimom obsahujúcim abakavir bez nutnosti opakovaného testovania.
Vaša kompletná DNA (nie len jej časť)
Tradičné genetické testovanie sa zameriava len na úzke skupiny génov, pričom vynecháva väčšinu vášho genómu. My sekvenujeme váš kompletný genóm – každý gén a každú oblasť medzi génmi.
Komplexné analýzy a odborné správy
Prehľadné a s odpoveďami, na základe ktorých môžete vy a váš lekár konať. Nie je to súbor, ktorý treba interpretovať – viac ako 200 klinických správ, usporiadaných podľa kategórií.
Vaša skúška získava každým rokom na hodnote
Vaša DNA sa nemení, ale vývoj v oblasti genomiky sa zrýchľuje. Každý mesiac sa objavujú nové súvislosti medzi variantmi a chorobami. Tieto zistenia overujeme a vaše správy automaticky aktualizujeme. Váš test tak každým rokom získava na hodnote.
Výsledky, ktoré lekári dosahujú pri najzložitejších prípadoch.
Štyridsať rokov neistoty. Jeden test.
Pacient strávil desaťročia v britskom zdravotníckom systéme bez diagnózy. Údaje zo systému Dante, ktoré prijali klinické tímy NHS v Queen Elizabeth University Hospital v Glasgowe, identifikovali Noonanov syndróm a variant génu RUNX1 spojený s leukémiou, ktorý dovtedy zostával nezistený. Po 40 rokoch konečne dostali odpoveď.
Celé prečítanie poskytuje ucelený obraz.
Pacient prišiel do Danteho kliniky, aby si dal vyšetriť periodickú paralýzu. Analýza celého genómu odhalila súbežný dedičný srdcový nález – Brugadov syndróm –, ktorý jeho lekár potvrdil pomocou EKG. Výsledok zároveň objasnil nevyriešenú anamnézu srdcových problémov u člena rodiny. Jeden test. Všetky odpovede v ňom.
Sekvenovanie prebehlo v roku 2019. Údaje boli spracované v roku 2021.
Jennifer si dala sekvencovať genóm u spoločnosti Dante dva roky predtým, ako jej diagnostikovali rakovinu prsníka. Keď začala liečba, údaje z farmakogenomiky spoločnosti Dante ukázali, že predpísaná chemoterapia by u nej mohla spôsobiť závažné nežiaduce účinky. Jej lekár zvolil alternatívu – a ona začala s účinnou liečbou hneď od prvého dňa.
Každá otázka týkajúca sa genetiky si zaslúži vyčerpávajúcu odpoveď.
Či už dnes hľadáte odpovede, alebo sa staráte o svoje zdravie s ohľadom na budúcnosť, kompletné zmapovanie vášho celého genómu je tým správnym východiskovým bodom.
Máte to v rodine. Teraz sa môžete dozvedieť, či to máte v génoch.
Váš genóm obsahuje zdedené varianty spojené so zdravotnými problémami, ako sú srdcové ochorenia, rakovina a neurologické ochorenia. Všetky ich analyzujeme – s dostatočnou klinickou hĺbkou, aby sme výsledkom dodali zmysel.
Zistiť viac →Keď tradičné laboratórne testy ukazujú, že ste v poriadku. A vy viete, že to tak nie je.
Štandardné diagnostické testy hľadajú odpovede na vopred stanovené otázky. My sekvenujeme vašu kompletnú DNA — vrátane častí, na ktorých kontrolu nebol žiadny test navrhnutý. Ak sa odpoveď nachádza vo vašom genóme, pomôžeme vám ju nájsť.
Zistiť viac →Vaša diagnóza môže byť správna. Váš liečebný plán však môže byť neúplný.
Vaše gény určujú, ktoré liečby majú najväčšiu šancu na úspech – a ktoré nie. Poskytujeme vášmu lekárovi nástroje a informácie potrebné na vypracovanie vášho liečebného plánu.
Zistiť viac →Chceš to vedieť skôr, než ťa k tomu niečo donúti.
Niektorí ľudia nečakajú na diagnózu ani na zistenie rodinných anamnéz, aby začali konať. Sekvenovanie celého genómu vám poskytne kompletný genetický obraz už teraz – vďaka čomu môžete vy a váš lekár prijímať informované rozhodnutia skôr, než sa situácia stane naliehavou.
Zistiť viac →DNA test ste už absolvovali. Tu je to, čo vám neprezradil.
Väčšina spotrebiteľských DNA testov analyzuje menej ako 0,1 % vášho genómu. My analyzujeme celý genóm.
Zistiť viac →Výsledky na klinickej úrovni. Vyhľadávané jednotlivcami, dôveryhodné pre lekárov pri riešení tých najzložitejších prípadov.
Test Dante Genome pomohol špecialistom v jednej z britských nemocníc akútnej starostlivosti identifikovať Noonanov syndróm a zriedkavú genetickú variantu spojenú s leukémiou, ktorá doteraz zostávala nezistená. Tento výsledok zmenil spôsob liečby pacienta.
Akreditované a publikované v
Časté otázky týkajúce sa sekvenovania celého genómu.
Aký je rozdiel medzi sekvenovaním celého genómu a cieleným genetickým testom?
Cielené genetické testy – vrátane štandardných panelov na dedičné formy rakoviny – analyzujú vopred stanovený zoznam známych variácií v konkrétnej skupine génov. Sú navrhnuté tak, aby identifikovali to, čo už vopred vedia, že majú hľadať. Sekvenovanie celého genómu analyzuje celý váš genóm: všetkých 6 miliárd bázových párov, každý gén, každú oblasť medzi génmi. Štúdia Mayo Clinic uverejnená v časopise JAMA Oncology zistila, že štandardné testovacie usmernenia prehliadli viac ako polovicu pacientov s dedičnými mutáciami spôsobujúcimi rakovinu. Test genómu nemá pevný zoznam.
Čo dostanem, keď budú výsledky hotové?
Váš Dante Genome poskytuje viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, usporiadaných podľa klinických kategórií – dedičné rakovinové ochorenia, srdcové ochorenia, zriedkavé ochorenia, farmakogenomika, nositeľstvo génov a ďalšie. Správy sú doručené do vášho zabezpečeného Genome Manageru a sú formátované pre priame klinické použitie. Vaše genómové údaje sú trvalo uchovávané a automaticky opätovne analyzované v súlade s pokrokom vo vede.
Čo sa stane, ak sa zistí klinicky významná varianta?
Ak sa zistí prítomnosť patogénnej alebo pravdepodobne patogénnej varianty, bude to vo vašej správe určenej pre lekára jasne označené spolu s klinickým kontextom, publikovanými dôkazmi a odporúčanými ďalšími krokmi. Odporúčame vám, aby ste akékoľvek klinicky významné zistenia konzultovali so svojím lekárom alebo genetickým poradcom, ktorí vám pomôžu pri rozhodovaní o sledovaní, znižovaní rizika alebo kaskádovom testovaní členov rodiny.
V čom sa to líši od spotrebiteľských testov DNA, ako sú 23andMe alebo AncestryDNA?
Spotrebiteľské DNA testy využívajú genotypizačné čipy, ktoré analyzujú menej ako 0,1 % vášho genómu – ide o malý vopred vybraný súbor bežných variácií. Sú optimalizované na určenie pôvodu a populačných charakteristík, nie na klinické genetické zistenia. Test Dante Genome sekvencuje 100 % vášho genómu s 30-násobným pokrytím, čo je rovnaký štandard používaný v klinickej diagnostike. Tieto dva testy nie sú porovnateľné z hľadiska rozsahu, metodiky ani klinickej využiteľnosti.
Za ako dlho sa dostavia výsledky a akým spôsobom sa poskytujú?
Vaša odberová súprava bude odoslaná do 48 hodín od objednávky. Akonáhle vaša vzorka dorazí do nášho laboratória s certifikáciou CLIA, sekvenovanie a analýza trvajú 6–8 týždňov. Výsledky sú bezpečne doručené do vášho Genome Manageru, kde máte prístup k svojim správam, môžete ich zdieľať so svojím lekárom a dostávať automatické aktualizácie, keď sa na základe vášho genómu potvrdia nové zistenia.
Spolupracujeme so združeniami na ochranu práv pacientov po celom svete.
Spoločnosť Dante Labs spolupracuje s pacientskými združeniami a organizáciami akejkoľvek veľkosti – v súvislosti s precitlivenosťou na abakavir – HLA-B*57:01 a ďalšími ochoreniami, či už ide o vzácne alebo bežné ochorenia. Podporujeme skupiny v akejkoľvek krajine, vrátane virtuálnych pacientskych združení a organizácií.
Môžeme vám poskytnúť správy na mieru, skupinové zľavy a balíčky prispôsobené potrebám vašich členov. Kontaktujte nás prostredníctvom formulára a my sa vám ozveme do dvoch pracovných dní.
- Individuálne genomické správy pre vašich členov
- Skupinové zľavy a balíčky na mieru
- Akákoľvek krajina – vrátane virtuálnych skupín
- Zahrnuté zriedkavé aj bežné ochorenia
Správa prijatá.
Ozveme sa vám do 2 pracovných dní. Ak chcete kontaktovať priamo: hello@dantelabs.com
Jeden test.
Odpovede na celý život.
Jedna súprava, doručená priamo k vám domov. Sekvenovanie celého vášho genómu podľa klinických štandardov používaných pri diagnostických rozhodnutiach. Viac ako 200 správ pripravených pre lekárov, doručených do vášho Genome Manageru za 6–8 týždňov – trvalých a aktualizovaných v súlade s pokrokom vedy.
Expedícia do 48 hodín · Výsledky za 6–8 týždňov
