Treceți la conținut
Folosiți fondurile HSA sau FSA
Secvențiați-vă genomul (se deschide într-un filă nouă)

Genă

TNFAIP1

TNF alpha induced protein 1

Rezumat

Localizare citogenetică
17q11.2
Coordonate
Cromozomul 17: 28.335.761–28.347.009 (GRCh38)
Exoni
7 de exoni pe 11,2 kb
Proteină
316 de aminoacizi
Denumiri alternative
B61, B12, MGC2317, BTBD34
Simboluri anterioare
EDP1
Transcriptul MANE Select
ENST00000226225.7NM_021137.5
Tip de locus
Care codifică proteine
  • Foarte ridicată
  • Ridicată
  • Scăzută
  • Foarte scăzută

Rapoarte curatoriate relevante pentru această genă

Niciun raport Genome Test nu citește încă TNFAIP1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.

Structura genei TNFAIP1

  • Secvență codificatoare
  • Regiune netranslată
  • Intron
  • Sensul transcripției
Cromozomul 17, cu o paranteză în locul unde se află TNFAIP1. TNFAIP1 și încă 30 de gene în apropiere, pe cromozomul 17, între 27.841.385 și 28.841.384.Cromozomul 1717q11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.328 Mb28,2 Mb28,4 Mb28,6 Mb28,8 Mb: 27.798.806–27.893.365, catena inversăLYRM9: 27.878.314–27.894.752, catena inversăLYRM9NLK: 28.041.709–28.196.381, catena directăNLKTMEM97: 28.319.097–28.332.671, catena directăTMEM97IFT20: 28.328.319–28.335.489, catena inversăIFT20TNFAIP1: 28.335.761–28.347.009, catena directăTNFAIP1POLDIP2: 28.343.133–28.357.623, catena inversăPOLDIP2VMA12: 28.357.636–28.363.683, catena directăSEBOX: 28.363.506–28.365.199, catena inversă: 28.364.288–28.368.012, catena inversăSARM1: 28.364.356–28.404.049, catena directăVTN: 28.366.414–28.373.091, catena inversăSLC46A1: 28.394.642–28.407.197, catena inversăRSKR: 28.455.752–28.614.210, catena inversăRSKRSLC13A2: 28.473.275–28.497.782, catena directăSLC13A2FOXN1: 28.506.243–28.538.900, catena directăFOXN1UNC119: 28.546.705–28.552.655, catena inversăUNC119PIGS: 28.553.383–28.571.794, catena inversăPIGSALDOC: 28.573.115–28.576.948, catena inversăALDOCSPAG5: 28.577.565–28.599.052, catena inversă: 28.580.012–28.614.185, catena inversăBLTP2: 28.614.440–28.645.454, catena inversăBLTP2SDF2: 28.648.346–28.662.189, catena inversăSDF2SUPT6H: 28.661.920–28.702.682, catena directăSUPT6HPROCA1: 28.703.196–28.712.313, catena inversăPROCA1RAB34: 28.713.545–28.719.594, catena inversăRAB34RPL23A: 28.719.940–28.724.365, catena directăRPL23ATLCD1: 28.723.435–28.727.935, catena inversăNEK8: 28.725.897–28.743.455, catena directăTRAF4: 28.743.978–28.772.894, catena directăFAM222B: 28.755.966–28.855.232, catena inversăFAM222BDiagrama genei TNFAIP1: 7 exoni pe catena directă a cromozomului 17Exon 1: 28.335.761–28.335.856, 96 de bazeExon 2: 28.339.408–28.339.726, 319 de bazeExon 3: 28.340.309–28.340.478, 170 de bazeExon 4: 28.341.237–28.341.326, 90 de bazeExon 5: 28.341.404–28.341.456, 53 de bazeExon 6: 28.342.247–28.342.442, 196 de bazeExon 7: 28.344.364–28.347.009, 2.646 de baze124675′3′

Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.

Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).

Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.

Exonii reprezintă 3,6 kb din cei 11,2 kb ai genei; 951 dintre aceste baze codifică proteina.

Secvenţiere TNFAIP1

0Uşor

Cât de dificil este de secvenţiat TNFAIP1 cu citiri scurte, din 100

Aproape toţi exonii genei TNFAIP1 se află în zone unde citirile scurte se aliniază curat.

Ce se adaugă: ponderea exonilor genei TNFAIP1 din fiecare tip de regiune dificilă

  • Mapabilitate0 %
  • Omologie0 %
  • Repetiţii0,6 %
  • Conţinut GC2,7 %
  • Acoperire de referinţă0 %

Un scor Dante Labs din cercetarea noastră proprie, construit pe hărţile Genome in a Bottle ale NIST pentru regiunile greu de secvenţiat.Cum se calculează scorul

Legături externe

De unde provin aceste date

  • HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
  • MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
  • Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.

Citează această pagină

APA

Dante Labs. (s.a.). Gena TNFAIP1: TNF alpha induced protein 1. Accesat 18 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/tnfaip1

Vancouver

Dante Labs. Gena TNFAIP1: TNF alpha induced protein 1 [Internet]. [citat 18 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/tnfaip1

Un test. Răspunsuri pentru o viață.

De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni

Comandați Genome Test-ul meu