Genă
CDKN2B-AS1
CDKN2B and CDKN2A antisense cis and trans regulatory RNA 1
- HGNC 34341↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000240498↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 100048912↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 9p21.3
- Coordonate
- Cromozomul 9: 21.994.791–22.120.713 (GRCh38)
- Exoni
- 19 de exoni pe 125,9 kb
- Denumiri alternative
- ANRIL, RP11-145E5.4, NCRNA00089, p15AS, CDKN2B-AS, PCAT12, 66CTG
- Simboluri anterioare
- CDKN2BAS
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000428597.7NR_003529.4
- Tip de locus
- ARN lung necodificator (lncRNA)
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cdkn2b-as1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți CDKN2B-AS1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă CDKN2B-AS1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei CDKN2B-AS1
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 3,5 kb din cei 125,9 kb ai genei.
Secvențierea CDKN2B-AS1
1Scăzut
Cât de greu este de secvențiat CDKN2B-AS1 cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale CDKN2B-AS1 aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.2,4 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.7,8 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena CDKN2B-AS1: CDKN2B and CDKN2A antisense cis and trans regulatory RNA 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/cdkn2b-as1
Dante Labs. Gena CDKN2B-AS1: CDKN2B and CDKN2A antisense cis and trans regulatory RNA 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/cdkn2b-as1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni