Gen
CDKN2B-AS1
CDKN2B and CDKN2A antisense cis and trans regulatory RNA 1
- HGNC 34341↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000240498↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 100048912↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 9p21.3
- Koordinatlar
- Kromozom 9: 21.994.791–22.120.713 (GRCh38)
- Eksonlar
- 125,9 kb boyunca 19 ekson
- Diğer adları
- ANRIL, RP11-145E5.4, NCRNA00089, p15AS, CDKN2B-AS, PCAT12, 66CTG
- Önceki semboller
- CDKN2BAS
- MANE Select transkripti
- ENST00000428597.7NR_003529.4
- Lokus türü
- Uzun kodlamayan RNA (lncRNA)
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cdkn2b-as1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCDKN2B-AS1 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu CDKN2B-AS1 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
CDKN2B-AS1 geninin yapısı
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 125,9 kb uzunluğunun 3,5 kb'sini oluşturur.
CDKN2B-AS1 dizilemesi
1Kolay
CDKN2B-AS1 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
CDKN2B-AS1 geninin eksonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşlendiği yerlerde bulunuyor.
Buna ek olarak: CDKN2B-AS1 geninin eksonlarının her zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölümler; bu nedenle burada yapılan bir tespit eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi, genomun başka yerlerindeki %90 veya daha yüksek benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarArdışık tekrarlar ve tek bazlı diziler; okumalar bunların üzerinde kayabilir ve tamamını kapsayamayabilir. Ağırlık %15.%2,4
- GC içeriğiYüzde 25'in altında ya da yüzde 65'in üzerinde G ve C içeren pencereler; kütüphane hazırlığı bunları zayıf kapsar. Ağırlık %10.%7,8
- Referans kapsamıYakındaki referans dizisindeki boşluklar; okumaların hizalanabileceği bir dizi bulunmayan yerler. Ağırlık %10.%0
Dante Labs'in kendi araştırmasından elde edilen bir puan; NIST'in Genome in a Bottle haritaları, dizilemesi zor bölgeler üzerine kuruludur.Puanlama yöntemiHer çubuk, CDKN2B-AS1 geninin ekson bazlarının o zor bölge türünde bulunan payını gösterir. Herhangi bir tür tek başına bir geni zor hale getirebilir; her ek tür ise daha az katkı yapar: hiçbir baz herhangi birinde yoksa 0, her baz okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgedeyse 100.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). CDKN2B-AS1 geni: CDKN2B and CDKN2A antisense cis and trans regulatory RNA 1. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/cdkn2b-as1
Dante Labs. CDKN2B-AS1 geni: CDKN2B and CDKN2A antisense cis and trans regulatory RNA 1 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/cdkn2b-as1
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde