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Gene

SORCS1

sortilin related VPS10 domain containing receptor 1

Resumo

Localização citogenética
10q25.1
Coordenadas
Cromossoma 10: 106 573 663–107 164 706 (GRCh38)
Exões
26 exões ao longo de 591 kb
Proteína
1168 aminoácidos
Transcrito MANE Select
ENST00000263054.11NM_052918.5
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa SORCS1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como SORCS1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 10, com um parêntese onde se situa SORCS1. SORCS1 e 0 genes próximos no cromossoma 10, de 105 982 619 a 107 755 750.Cromossoma 1010q25.1p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3106 Mb106,5 Mb107 Mb107,5 MbSORCS1: 106 573 663–107 164 706, fita inversaSORCS1Diagrama de SORCS1: 26 exões na cadeia inversa do cromossoma 10Exão 26: 106 573 663–106 577 555, 3893 basesExão 25: 106 579 369–106 579 474, 106 basesExão 24: 106 597 351–106 597 450, 100 basesExão 23: 106 607 166–106 607 297, 132 basesExão 22: 106 611 911–106 612 023, 113 basesExão 21: 106 618 149–106 618 272, 124 basesExão 20: 106 620 428–106 620 561, 134 basesExão 19: 106 629 202–106 629 388, 187 basesExão 18: 106 652 382–106 652 553, 172 basesExão 17: 106 667 689–106 667 802, 114 basesExão 16: 106 671 237–106 671 367, 131 basesExão 15: 106 672 868–106 672 985, 118 basesExão 14: 106 675 049–106 675 156, 108 basesExão 13: 106 677 313–106 677 404, 92 basesExão 12: 106 679 256–106 679 332, 77 basesExão 11: 106 679 632–106 679 734, 103 basesExão 10: 106 688 192–106 688 338, 147 basesExão 9: 106 699 214–106 699 393, 180 basesExão 8: 106 706 545–106 706 634, 90 basesExão 7: 106 709 223–106 709 341, 119 basesExão 6: 106 730 050–106 730 114, 65 basesExão 5: 106 761 588–106 761 661, 74 basesExão 4: 106 776 534–106 776 692, 159 basesExão 3: 106 829 574–106 829 673, 100 basesExão 2: 106 956 513–106 956 580, 68 basesExão 1: 107 163 969–107 164 706, 738 bases26201015′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 7,4 kb dos 591 kb do gene; 3507 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de SORCS1

2Fácil

Dificuldade de sequenciação de SORCS1 com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de SORCS1 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de SORCS1 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Repetições2,9%
  • Conteúdo GC12%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene SORCS1: sortilin related VPS10 domain containing receptor 1. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/sorcs1

Vancouver

Dante Labs. Gene SORCS1: sortilin related VPS10 domain containing receptor 1 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/sorcs1

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