Gene
RFC5
replication factor C subunit 5
- HGNC 9973↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000111445↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 5985↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 12q24.23
- Coordenadas
- Cromossoma 12: 118 016 703–118 032 234 (GRCh38)
- Exões
- 11 exões ao longo de 15,5 kb
- Proteína
- 340 aminoácidos
- Também conhecido como
- RFC36
- Transcrito MANE Select
- ENST00000454402.7NM_007370.7
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Como RFC5 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 2,1 kb dos 15,5 kb do gene; 1023 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de RFC5
1Fácil
Quão difícil é sequenciar RFC5 com leituras curtas, em 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of RFC5's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of RFC5's exons in each kind of hard region
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nesses trechos pode estar em falta ou ser errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 15%.2,5%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 10%.9%
- Cobertura da referênciaLacunas próximas na montagem de referência, onde não existe sequência a que as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredCada barra é a proporção das bases exónicas de RFC5 nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem numa chamada com leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando cada base está em todas.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene RFC5: replication factor C subunit 5. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/rfc5
Dante Labs. Gene RFC5: replication factor C subunit 5 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/rfc5
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