Gene
PTPRG
protein tyrosine phosphatase receptor type G
- HGNC 9671↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000144724↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 5793↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 3p14.2
- Coordenadas
- Cromossoma 3: 61 561 571–62 297 609 (GRCh38)
- Exões
- 30 exões ao longo de 736 kb
- Proteína
- 1445 aminoácidos
- Também conhecido como
- RPTPG
- Símbolos anteriores
- PTPG
- Transcrito MANE Select
- ENST00000474889.6NM_002841.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Nenhum relatório do Genome Test analisa PTPRG ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como PTPRG está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 9,4 kb dos 736 kb do gene; 4338 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de PTPRG
2Fácil
Dificuldade de sequenciação de PTPRG com leituras curtas, em 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de PTPRG se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.
O que acresce: a proporção dos exões de PTPRG em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com identidade de 90% ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 15%.4,1%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 10%.13%
- Cobertura da referênciaLacunas nas proximidades na montagem de referência, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Peso 10%.0%
Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de PTPRG nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhum, 100 quando todas as bases estão em regiões onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene PTPRG: protein tyrosine phosphatase receptor type G. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ptprg
Dante Labs. Gene PTPRG: protein tyrosine phosphatase receptor type G [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ptprg
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