Gene
ERGIC2
ERGIC and golgi 2
- HGNC 30208↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000087502↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 51290↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 12p11.22
- Coordenadas
- Cromossoma 12: 29 337 352–29 381 172 (GRCh38)
- Exões
- 14 exões ao longo de 43,8 kb
- Proteína
- 377 aminoácidos
- Também conhecido como
- PTX1, Erv41
- Transcrito MANE Select
- ENST00000360150.9NM_016570.3
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Nenhum relatório do Genome Test analisa ERGIC2 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como ERGIC2 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 5 kb dos 43,8 kb do gene; 1134 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de ERGIC2
10Moderada
Quão difícil é sequenciar ERGIC2 com leituras curtas, em 100
0 · Easy100 · Hard
Some of ERGIC2's exons sit where short reads can miss or misplace a change.
What adds to it: the share of ERGIC2's exons in each kind of hard region
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nesses trechos pode estar em falta ou ser errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.24%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 15%.7%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 10%.17%
- Cobertura da referênciaLacunas próximas na montagem de referência, onde não existe sequência a que as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredCada barra é a proporção das bases exónicas de ERGIC2 nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem numa chamada com leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando cada base está em todas.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene ERGIC2: ERGIC and golgi 2. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ergic2
Dante Labs. Gene ERGIC2: ERGIC and golgi 2 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ergic2
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