Gene
CDH9
cadherin 9
- HGNC 1768↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000113100↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 1007↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 5p14.1
- Coordenadas
- Cromossoma 5: 26 880 597–27 038 586 (GRCh38)
- Exões
- 12 exões ao longo de 158 kb
- Proteína
- 789 aminoácidos
- Transcrito MANE Select
- ENST00000231021.9NM_016279.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
Esta página como dados
Acrescente .json ao endereço da página, ou peça application/json, para a ler como JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cdh9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise CDH9, e o resto do seu genoma, com um único teste.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas
Obter o meu Genome TestRelatórios com curadoria relevantes para este gene
Nenhum relatório do Genome Test analisa CDH9 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como CDH9 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 3,1 kb dos 158 kb do gene; 2370 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de CDH9
1Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar CDH9 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de CDH9 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.0%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.6,3%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene CDH9: cadherin 9. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/cdh9
Dante Labs. Gene CDH9: cadherin 9 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/cdh9
Um teste. Respostas para toda a vida.
A partir de 449 $Envio gratuito · Resultados em 6–8 semanas