Gen
PAIP2B
poly(A) binding protein interacting protein 2B
- HGNC 29200↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000124374↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 400961↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 2p13.3
- Koordinater
- Kromosom 2: 71 182 738–71 227 103 (GRCh38)
- Eksoner
- 4 eksoner over 44,4 kb
- Protein
- 123 aminosyrer
- Også kjent som
- KIAA1155
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000244221.9NM_020459.1
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/paip2b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes PAIP2B og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser PAIP2B ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er PAIP2B bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 6,3 kb av genets 44,4 kb, og 372 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av PAIP2B
19Moderat
Hvor vanskelig PAIP2B er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Noen av eksonene til PAIP2B ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.
Det som bidrar: andelen av eksonene til PAIP2B i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en påvisning der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.19 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.40 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser kan glippe på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.3,8 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som bibliotekforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.0,9 %
- ReferansedekningHull i den nærliggende referanseassembleringen, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Vekt 10 %.0 %
En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbaser i PAIP2B i den typen vanskelig område. Én type kan i seg selv gjøre et gen vanskelig, og hver ekstra type bidrar mindre: 0 når ingen baser er i noen, 100 når alle baser ligger der leser ikke kan plasseres entydig.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). PAIP2B-genet: poly(A) binding protein interacting protein 2B. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/paip2b
Dante Labs. PAIP2B-genet: poly(A) binding protein interacting protein 2B [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/paip2b
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker