Genas
CDCA2
cell division cycle associated 2
- HGNC 14623↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000184661↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 157313↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 8p21.2
- Koordinatės
- Chromosoma 8: 25 459 233–25 507 911 (GRCh38)
- Eksonai
- 15 eksonų per 48,7 kb
- Baltymas
- 1 023 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- Repo-Man, PPP1R81
- MANE Select transkriptas
- ENST00000330560.8NM_152562.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cdca2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite CDCA2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito CDCA2 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas CDCA2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,5 kb iš 48,7 kb geno; 3 072 šių bazių koduoja baltymą.
CDCA2 sekvenavimas
1Lengva
Kaip sunku sekvenuoti CDCA2 trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Beveik visi CDCA2 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai atvaizduojami aiškiai.
Prie to prisideda kiekvienos sunkių sričių rūšies dalis tarp CDCA2 eksonų
- AtvaizduojamumasRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negalima vienareikšmiškai priskirti, todėl ten iškvietimas gali būti praleistas arba neteisingas. Svoris 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dubliakacijos: genomo kopijos kitur, pavyzdžiui, paralogai ir pseudogenai, kurių identiškumas 90 % ar didesnis. Svoris 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido seka, kuriais skaitiniai slysta ir kurių gali neaprėpti. Svoris 15 %.0,5 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %, bibliotekos paruošimo metu aprėpiami silpnai. Svoris 10 %.8,8 %
- Nuorodinės sekos aprėptisNetoliese esantys nuorodinės sekos surinkinio tarpai, kur skaitiniams nėra su kuo susilyginti. Svoris 10 %.0 %
Dante Labs balas, sukurtas remiantis mūsų pačių tyrimu, paremtu NIST Genome in a Bottle sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamas balasKiekviena juosta rodo, kokia CDCA2 eksonų bazių dalis yra tokioje sunkioje srityje. Balas sveria juos pagal tai, kiek kiekvienas kainuoja trumpųjų skaitinių iškvietimui: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai kiekviena bazė patenka į visas.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). CDCA2 genas: cell division cycle associated 2. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/cdca2
Dante Labs. CDCA2 genas: cell division cycle associated 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/cdca2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites