변이
CDH1 E702X
NM_004360.5(CDH1):c.2104G>T (p.Glu702Ter)
- p.Glu702Ter
- p.E702*
- rs149127230
- ClinVar 분류
- 병원성
- 검토 상태
- 4개 중 3개 별전문가 패널 검토 완료
- 최종 평가일
- 2023년 8월 4일
- 전문가 패널
- Clingen Gastric Cancer Variant Curation Expert Panel
데이터 기준 ClinVar 릴리스 2026-10-12 · Dante Labs 데이터 릴리스 2026.10.16-c6eea6bf정보 최종 변경일: 2026년 10월 16일
기준 게놈GRCh38hg38
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요약
E702X 변이는 CDH1의 넌센스 변이입니다. 이 변이로 이른 종결 신호가 생겨, 유전자가 암호화하는 단백질이 짧게 잘릴 것으로 예측됩니다. ClinVar는 이 변이를 CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndrome에 대해 병원성으로 분류합니다 (전문가 패널 검토 완료).
ClinVar 분류
| 질환 | 분류 | 검토 상태 | 제출 건수 | 최종 평가일 |
|---|---|---|---|---|
| CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndromeClinVar VCV000463743 (새 탭에서 열림) | 병원성 | 4개 중 3개 별전문가 패널 검토 완료 | 1건 제출 | 2023년 8월 4일 |
ClinVar가 릴리스 2026-10-12에 기록한 분류입니다. 증거가 검토되면 ClinVar가 이 분류를 업데이트합니다.
CDH1에서의 위치
E702X은(는) CDH1의 MANE Select 전사체(NM_004360.5)에 있는 엑손 16개 중 13번째 엑손에 위치합니다.
분자 세부 정보
| 유전자 | CDH1 |
|---|---|
| 전사체 | NM_004360.5MANE Select |
| 코딩 DNA 변화 (HGVS c.) | c.2104G>T |
| 단백질 변화 (HGVS p.) | p.Glu702Terp.E702* |
| 예측되는 결과 | 넌센스(정지 코돈 생성)stop_gained (새 탭에서 열림) |
| 예측되는 영향 | 높음 |
| 위치 (GRCh38) | chr16:68823566 G>T |
| 위치 (GRCh37) | chr16:68857469 G>T |
| dbSNP ID | rs149127230 (새 탭에서 열림) |
| ClinVar 변이 ID | VCV000463743 (새 탭에서 열림) |
| ClinVar 대립유전자 ID | 466923 |
| ClinGen 대립유전자 등록소 ID | CA396467856 (새 탭에서 열림) |
| ClinVar 이름 | NM_004360.5(CDH1):c.2104G>T (p.Glu702Ter) |
다른 데이터베이스의 CDH1 E702X
이 변이를 분석하는 보고서 (1)
이 Genome Test 질환 보고서에서 분석하는 변이에는 E702X이(가) 포함됩니다.
| 보고서 | 질환 | 유전 방식 |
|---|---|---|
| Hereditary Diffuse Gastric Cancer | CDH1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndrome | 상염색체 우성 |
CDH1의 다른 변이
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- c.3G>A병원성4개 중 3개 별
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- c.48+1G>A병원성4개 중 3개 별
- c.49-2A>G병원성4개 중 3개 별
한계
이 페이지는 유전 변이에 관해 공개적으로 이용 가능한 정보를 설명합니다. 진단이 아니며, 귀하나 다른 누구라도 이 변이를 가지고 있는지 여부에 대해서는 아무것도 말해 주지 않습니다.
분류 정보는 ClinVar에서 가져오며, 새로운 근거가 검토되면서 변경될 수 있습니다. 여기에 표시된 분류는 오늘의 ClinVar 분류나 검사기관이 보고한 분류와 다를 수 있습니다.
짧은 리드(short read)를 이용한 전장 유전체 시퀀싱은 일부 변이를 놓치거나 잘못 호출할 수 있으며, 특히 반복되거나 매우 유사한 DNA 구간과 큰 삽입, 결실 또는 재배열에서 그럴 수 있습니다.
귀하의 결과나 가족의 결과에 있는 변이에 대해 궁금한 점이 있다면 유전 상담사나 주치의와 상담하시기 바랍니다.
출처 및 크레딧
- ClinVar 분류 (릴리스 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- 질환 용어: Mondo Disease Ontology (릴리스 2026-10-06), CC BY 4.0 라이선스에 따라 사용.
- 유전자 기호 및 명칭: HUGO Gene Nomenclature Committee (릴리스 2026-10-16).
- 대립유전자 식별자: ClinGen Allele Registry (릴리스 2026-10-16-c4908f54).
- 참조 SNP 식별자: dbSNP (릴리스 b157), National Center for Biotechnology Information.
- 유전자-질환 연관성: Gene Curation Coalition, GenCC (릴리스 2026-10-16).
- 어려운 영역: Genome in a Bottle Consortium (릴리스 v3.6).
- 전사체: MANE (릴리스 v1.5), NCBI 및 EMBL-EBI.
- 예측된 결과: mehari (릴리스 0.11.0), 전사체 모델은 cdot 제공.
- Dante Labs 데이터 릴리스 2026.10.16-c6eea6bf(2026년 10월 16일 기준)으로 작성됨.
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Dante Labs. (2026년 10월 16일). CDH1 E702X (c.2104G>T, rs149127230) (Version 2026.10.16-c6eea6bf). 2026년 10월 16일에 검색함, https://dantelabs.com/genes/cdh1/variants/e702x
Dante Labs. CDH1 E702X (c.2104G>T, rs149127230) [Internet]. Version 2026.10.16-c6eea6bf. 2026년 10월 16일 [인용일: 2026년 10월 16일]. 다음에서 이용 가능: https://dantelabs.com/genes/cdh1/variants/e702x
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