Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

WFDC9

WAP four-disulfide core domain 9

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
20q13.12
Koordináták
20. kromoszóma: 45 607 939–45 631 284 (GRCh38)
Exonok
5 exon, összesen 23,3 kb
Fehérje
89 aminosav
Más néven ismert
WAP9, dJ688G8.2
MANE Select transzkriptum
ENST00000326000.2NM_147198.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) WFDC9 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A WFDC9 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
20. kromoszóma, a WFDC9 helyét zárójel jelöli. A WFDC9 és környékén 42 gén a 20. kromoszómán, 45 119 612–46 119 611 között.20. kromoszóma20q13.12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3345,2 Mb45,4 Mb45,6 Mb45,8 Mb46 MbWFDC12: 45 123 425–45 124 465, fordított szálWFDC12PI3: 45 174 901–45 176 544, előre szálPI3SEMG1: 45 206 973–45 210 605, előre szálSEMG1SEMG2: 45 221 373–45 224 462, előre szálSEMG2SLPI: 45 251 638–45 254 568, fordított szálSLPIMATN4: 45 293 445–45 312 469, fordított szálMATN4RBPJL: 45 306 840–45 317 824, előre szálRBPJLSDC4: 45 325 288–45 348 433, fordított szálSDC4SYS1: 45 359 977–45 376 798, előre szálSYS1SYS1-DBNDD2: 45 363 200–45 410 610, előre szálSYS1-DBNDD2TP53TG5: 45 371 804–45 407 889, fordított szálTP53TG5DBNDD2: 45 405 616–45 410 870, előre szálDBNDD2PIGT: 45 416 084–45 456 934, előre szálPIGTWFDC2: 45 469 166–45 481 533, előre szálWFDC2SPINT3: 45 512 461–45 515 622, fordított szálWFDC6: 45 533 091–45 539 496, fordított szálWFDC6EPPIN-WFDC6: 45 534 196–45 547 662, fordított szálEPPIN-WFDC6EPPIN: 45 540 626–45 547 786, fordított szálEPPINWFDC8: 45 551 153–45 579 326, fordított szálWFDC8WFDC9: 45 607 939–45 631 284, fordított szálWFDC9WFDC10A: 45 629 733–45 631 196, előre szálWFDC10AWFDC11: 45 648 563–45 670 270, fordított szálWFDC11WFDC10B: 45 684 651–45 705 019, fordított szálWFDC10BWFDC13: 45 702 038–45 708 817, előre szálWFDC13SPINT4: 45 722 347–45 725 830, előre szálSPINT4WFDC3: 45 747 944–45 791 932, fordított szálWFDC3DNTTIP1: 45 791 937–45 811 427, előre szálDNTTIP1UBE2C: 45 812 561–45 816 965, előre szálUBE2CTNNC2: 45 823 214–45 833 745, fordított szálTNNC2SNX21: 45 833 633–45 843 276, előre szálSNX21ACOT8: 45 841 709–45 857 435, fordított szálZSWIM3: 45 857 591–45 879 131, előre szálZSWIM1: 45 881 201–45 885 266, előre szálZSWIM1SPATA25: 45 886 491–45 887 626, fordított szálNEURL2: 45 888 002–45 891 220, fordított szálCTSA: 45 890 144–45 898 949, előre szálCTSAPLTP: 45 897 535–45 912 235, fordított szálPCIF1: 45 934 673–45 948 023, előre szálPCIF1ZNF335: 45 948 653–45 972 358, fordított szálZNF335MMP9: 46 008 869–46 016 561, előre szálMMP9SLC12A5: 46 021 675–46 060 150, előre szálSLC12A5NCOA5: 46 060 984–46 089 973, fordított szálNCOA5CD40: 46 118 240–46 130 378, előre szálCD40A WFDC9 ábrája: 5 exon a(z) 20. kromoszóma fordított szálán5. exon: 45 607 939–45 608 140, 202 bázis4. exon: 45 608 663–45 608 810, 148 bázis3. exon: 45 610 091–45 610 239, 149 bázis2. exon: 45 614 628–45 614 721, 94 bázis1. exon: 45 631 203–45 631 284, 82 bázis543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 23,3 kb-jából 0,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 270 bázis kódolja a fehérjét.

WFDC9 szekvenálása

0Könnyű

Mennyire nehéz a WFDC9 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A WFDC9 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen található, ahol a rövid olvasatok tisztán illeszthetők.

Ehhez hozzájárul: a WFDC9 exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom0%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). WFDC9 gén: WAP four-disulfide core domain 9. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/wfdc9

Vancouver

Dante Labs. WFDC9 gén: WAP four-disulfide core domain 9 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/wfdc9

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet