Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

TBX21

T-box transcription factor 21

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q21.32
Koordináták
17. kromoszóma: 47 733 236–47 746 122 (GRCh38)
Exonok
6 exon, összesen 12,9 kb
Fehérje
535 aminosav, 58,3 kDa
Más néven ismert
TBLYM, T-bet
MANE Select transzkriptum
ENST00000177694.2NM_013351.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) TBX21 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A TBX21 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a TBX21 helyét zárójel jelöli. A TBX21 és környékén 20 gén a 17. kromoszómán, 47 239 679–48 239 678 között.17. kromoszóma17q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.347,4 Mb47,6 Mb47,8 Mb48 Mb48,2 MbITGB3: 47 253 649–47 323 218, előre szálITGB3: 47 253 897–47 344 292, előre szálEFCAB13: 47 323 290–47 441 312, előre szálEFCAB13NPEPPS: 47 522 942–47 624 707, előre szálNPEPPSKPNB1: 47 649 476–47 685 505, előre szálKPNB1TBKBP1: 47 694 030–47 712 063, előre szálTBKBP1TBX21: 47 733 236–47 746 122, előre szálTBX21OSBPL7: 47 807 363–47 821 890, fordított szálOSBPL7MRPL10: 47 823 272–47 831 545, fordított szálMRPL10LRRC46: 47 831 634–47 837 719, előre szálLRRC46SCRN2: 47 837 683–47 842 125, fordított szálSCRN2SP6: 47 844 908–47 855 874, fordított szálSP2: 47 896 150–47 928 964, előre szálSP2PNPO: 47 941 506–47 964 354, előre szálPNPOPRR15L: 47 950 851–47 960 483, fordított szálPRR15LCDK5RAP3: 47 967 810–47 981 787, előre szálCDK5RAP3COPZ2: 48 026 142–48 038 030, fordított szálCOPZ2NFE2L1: 48 047 889–48 088 647, előre szálNFE2L1CBX1: 48 070 052–48 107 848, fordított szálCBX1SNX11: 48 103 357–48 128 226, előre szálSNX11SKAP1: 48 133 433–48 430 275, fordított szálSKAP1A TBX21 ábrája: 6 exon a(z) 17. kromoszóma előre szálán1. exon: 47 733 236–47 733 945, 710 bázis2. exon: 47 742 610–47 742 764, 155 bázis3. exon: 47 743 071–47 743 192, 122 bázis4. exon: 47 744 195–47 744 353, 159 bázis5. exon: 47 744 482–47 744 543, 62 bázis6. exon: 47 744 748–47 746 122, 1375 bázis1234565′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 12,9 kb-jából 2,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1608 bázis kódolja a fehérjét.

TBX21 szekvenálása

9Könnyű

Mennyire nehéz a TBX21 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A TBX21 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a TBX21 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,7%
  • GC-tartalom40%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

A(z) TBX21 génhez kapcsolódó tulajdonságok

Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) TBX21 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). TBX21 gén: T-box transcription factor 21. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/tbx21

Vancouver

Dante Labs. TBX21 gén: T-box transcription factor 21 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/tbx21

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet