Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PCDHB16

protocadherin beta 16

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
5q31.3
Koordináták
5. kromoszóma: 141 182 387–141 186 226 (GRCh38)
Exonok
1 exon, összesen 3,8 kb
Fehérje
776 aminosav
Más néven ismert
PCDHB8a, PCDH3X, KIAA1621, PCDH-BETA16, ME1
MANE Select transzkriptum
ENST00000609684.3NM_020957.4
Lokusz típusa
Egyéb
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) PCDHB16 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A PCDHB16 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
5. kromoszóma, a PCDHB16 helyét zárójel jelöli. A PCDHB16 és környékén 63 gén a 5. kromoszómán, 140 684 307–141 684 306 között.5. kromoszóma5q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3140,8 Mb141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 MbHARS1: 140 673 035–140 691 537, fordított szálHARS1HARS2: 140 691 422–140 699 315, előre szálHARS2ZMAT2: 140 698 680–140 707 729, előre szálZMAT2PCDHA1: 140 786 136–141 012 351, előre szálPCDHA2: 140 794 845–141 012 351, előre szálPCDHA3: 140 801 018–141 012 351, előre szálPCDHA4: 140 807 037–141 012 347, előre szálPCDHA5: 140 821 599–141 012 347, előre szálPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, előre szálPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, előre szálPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, előre szálPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, előre szálPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, előre szálPCDHA11: 140 868 183–141 012 351, előre szálPCDHA12: 140 875 256–141 012 351, előre szálPCDHA12PCDHA13: 140 882 079–141 012 347, előre szálPCDHA13PCDHAC1: 140 926 299–141 012 351, előre szálPCDHAC1PCDHAC2: 140 966 466–141 012 351, előre szálPCDHAC2PCDHB1: 141 051 374–141 059 346, előre szálPCDHB1PCDHB2: 141 094 597–141 098 703, előre szálPCDHB2PCDHB3: 141 100 473–141 103 827, előre szálPCDHB3PCDHB4: 141 121 818–141 125 623, előre szálPCDHB4PCDHB5: 141 135 206–141 138 615, előre szálPCDHB6: 141 150 057–141 153 287, előre szálPCDHB7: 141 172 644–141 176 383, előre szálPCDHB8: 141 177 790–141 182 369, előre szálPCDHB8PCDHB16: 141 182 387–141 186 226, előre szálPCDHB16PCDHB9: 141 187 127–141 191 541, előre szálPCDHB9PCDHB10: 141 192 353–141 195 647, előre szálPCDHB10PCDHB11: 141 199 610–141 203 779, előre szálPCDHB12: 141 208 697–141 212 571, előre szálPCDHB13: 141 213 919–141 218 979, előre szálPCDHB14: 141 223 343–141 227 759, előre szál: 141 223 372–141 245 861, előre szálPCDHB15: 141 245 395–141 249 365, előre szálTAF7: 141 259 884–141 320 784, fordított szálTAF7SLC25A2: 141 302 635–141 304 049, fordított szálSLC25A2PCDHGA1: 141 330 495–141 512 977, előre szálPCDHGA1PCDHGA2: 141 338 754–141 512 977, előre szálPCDHGA2PCDHGA3: 141 343 819–141 512 977, előre szálPCDHGA3PCDHGB1: 141 350 083–141 512 977, előre szálPCDHGB1PCDHGA4: 141 355 004–141 512 977, előre szálPCDHGB2: 141 359 971–141 512 977, előre szálPCDHGA5: 141 364 162–141 512 977, előre szálPCDHGB3: 141 370 237–141 512 977, előre szálPCDHGA6: 141 373 878–141 512 977, előre szálPCDHGA7: 141 382 702–141 512 977, előre szálPCDHGB4: 141 387 698–141 512 977, előre szálPCDHGA8: 141 390 157–141 512 977, előre szálPCDHGB5: 141 397 942–141 512 977, előre szálPCDHGA9: 141 402 765–141 512 977, előre szálPCDHGB6: 141 407 989–141 512 977, előre szálPCDHGA10: 141 412 981–141 512 977, előre szálPCDHGB7: 141 417 642–141 512 977, előre szálPCDHGA11: 141 421 021–141 512 977, előre szálPCDHGA12: 141 430 507–141 512 977, előre szálPCDHGC3: 141 475 929–141 512 977, előre szálPCDHGC4: 141 484 997–141 512 977, előre szálPCDHGC5: 141 489 067–141 512 977, előre szálDIAPH1: 141 515 016–141 619 194, fordított szálHDAC3: 141 620 766–141 637 304, fordított szálHDAC3RELL2: 141 636 950–141 641 065, előre szálRELL2FCHSD1: 141 639 296–141 651 430, fordított szálFCHSD1ARAP3: 141 653 204–141 682 255, fordított szálARAP3A PCDHB16 ábrája: egy exon a(z) 5. kromoszóma előre szálán1. exon: 141 182 387–141 186 226, 3840 bázis15′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 3,8 kb-jából 3,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2331 bázis kódolja a fehérjét.

PCDHB16 szekvenálása

36Közepes

Mennyire nehéz a PCDHB16 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A PCDHB16 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a PCDHB16 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség16%
  • Homológia33%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések3,4%
  • GC-tartalom25%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PCDHB16 gén: protocadherin beta 16. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pcdhb16

Vancouver

Dante Labs. PCDHB16 gén: protocadherin beta 16 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pcdhb16

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet