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Gene

PCDHB16

protocadherin beta 16

Sintesi

Localizzazione citogenetica
5q31.3
Coordinate
Cromosoma 5: 141.182.387–141.186.226 (GRCh38)
Esoni
1 esone su 3,8 kb
Proteina
776 amminoacidi
Noto anche come
PCDHB8a, PCDH3X, KIAA1621, PCDH-BETA16, ME1
Trascritto MANE Select
ENST00000609684.3NM_020957.4
Tipo di locus
complex locus constituent
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora PCDHB16. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di PCDHB16

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 5, con una parentesi dove si trova PCDHB16. PCDHB16 e 63 geni nelle vicinanze sul cromosoma 5, da 140.684.307 a 141.684.306.Cromosoma 55q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3140,8 Mb141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 MbHARS1: 140.673.035–140.691.537, filamento inversoHARS1HARS2: 140.691.422–140.699.315, filamento direttoHARS2ZMAT2: 140.698.680–140.707.729, filamento direttoZMAT2PCDHA1: 140.786.136–141.012.351, filamento direttoPCDHA2: 140.794.845–141.012.351, filamento direttoPCDHA3: 140.801.018–141.012.351, filamento direttoPCDHA4: 140.807.037–141.012.347, filamento direttoPCDHA5: 140.821.599–141.012.347, filamento direttoPCDHA6: 140.827.958–141.012.351, filamento direttoPCDHA7: 140.834.231–141.012.351, filamento direttoPCDHA8: 140.841.185–141.012.351, filamento direttoPCDHA9: 140.847.772–141.012.351, filamento direttoPCDHA10: 140.855.883–141.012.351, filamento direttoPCDHA11: 140.868.183–141.012.351, filamento direttoPCDHA12: 140.875.256–141.012.351, filamento direttoPCDHA12PCDHA13: 140.882.079–141.012.347, filamento direttoPCDHA13PCDHAC1: 140.926.299–141.012.351, filamento direttoPCDHAC1PCDHAC2: 140.966.466–141.012.351, filamento direttoPCDHAC2PCDHB1: 141.051.374–141.059.346, filamento direttoPCDHB1PCDHB2: 141.094.597–141.098.703, filamento direttoPCDHB2PCDHB3: 141.100.473–141.103.827, filamento direttoPCDHB3PCDHB4: 141.121.818–141.125.623, filamento direttoPCDHB4PCDHB5: 141.135.206–141.138.615, filamento direttoPCDHB6: 141.150.057–141.153.287, filamento direttoPCDHB7: 141.172.644–141.176.383, filamento direttoPCDHB8: 141.177.790–141.182.369, filamento direttoPCDHB8PCDHB16: 141.182.387–141.186.226, filamento direttoPCDHB16PCDHB9: 141.187.127–141.191.541, filamento direttoPCDHB9PCDHB10: 141.192.353–141.195.647, filamento direttoPCDHB10PCDHB11: 141.199.610–141.203.779, filamento direttoPCDHB12: 141.208.697–141.212.571, filamento direttoPCDHB13: 141.213.919–141.218.979, filamento direttoPCDHB14: 141.223.343–141.227.759, filamento diretto: 141.223.372–141.245.861, filamento direttoPCDHB15: 141.245.395–141.249.365, filamento direttoTAF7: 141.259.884–141.320.784, filamento inversoTAF7SLC25A2: 141.302.635–141.304.049, filamento inversoSLC25A2PCDHGA1: 141.330.495–141.512.977, filamento direttoPCDHGA1PCDHGA2: 141.338.754–141.512.977, filamento direttoPCDHGA2PCDHGA3: 141.343.819–141.512.977, filamento direttoPCDHGA3PCDHGB1: 141.350.083–141.512.977, filamento direttoPCDHGB1PCDHGA4: 141.355.004–141.512.977, filamento direttoPCDHGB2: 141.359.971–141.512.977, filamento direttoPCDHGA5: 141.364.162–141.512.977, filamento direttoPCDHGB3: 141.370.237–141.512.977, filamento direttoPCDHGA6: 141.373.878–141.512.977, filamento direttoPCDHGA7: 141.382.702–141.512.977, filamento direttoPCDHGB4: 141.387.698–141.512.977, filamento direttoPCDHGA8: 141.390.157–141.512.977, filamento direttoPCDHGB5: 141.397.942–141.512.977, filamento direttoPCDHGA9: 141.402.765–141.512.977, filamento direttoPCDHGB6: 141.407.989–141.512.977, filamento direttoPCDHGA10: 141.412.981–141.512.977, filamento direttoPCDHGB7: 141.417.642–141.512.977, filamento direttoPCDHGA11: 141.421.021–141.512.977, filamento direttoPCDHGA12: 141.430.507–141.512.977, filamento direttoPCDHGC3: 141.475.929–141.512.977, filamento direttoPCDHGC4: 141.484.997–141.512.977, filamento direttoPCDHGC5: 141.489.067–141.512.977, filamento direttoDIAPH1: 141.515.016–141.619.194, filamento inversoHDAC3: 141.620.766–141.637.304, filamento inversoHDAC3RELL2: 141.636.950–141.641.065, filamento direttoRELL2FCHSD1: 141.639.296–141.651.430, filamento inversoFCHSD1ARAP3: 141.653.204–141.682.255, filamento inversoARAP3Diagramma di PCDHB16: un esone sul filamento diretto del cromosoma 5Esone 1: 141.182.387–141.186.226, 3840 basi15′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,8 kb dei 3,8 kb del gene; 2331 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene PCDHB16: protocadherin beta 16. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pcdhb16

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Dante Labs. Gene PCDHB16: protocadherin beta 16 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pcdhb16

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