Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

KRTAP4-2

keratin associated protein 4-2

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q21.2
Koordináták
17. kromoszóma: 41 177 446–41 178 221 (GRCh38)
Exonok
1 exon, összesen 0,8 kb
Fehérje
136 aminosav
Más néven ismert
KAP4.2
MANE Select transzkriptum
ENST00000377726.3NM_033062.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) KRTAP4-2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A KRTAP4-2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a KRTAP4-2 helyét zárójel jelöli. A KRTAP4-2 és környékén 60 gén a 17. kromoszómán, 40 677 834–41 677 833 között.17. kromoszóma17q21.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.340,8 Mb41 Mb41,2 Mb41,4 Mb41,6 MbKRT24: 40 697 991–40 703 758, fordított szálKRT24KRT25: 40 748 021–40 755 331, fordított szálKRT25KRT26: 40 766 238–40 772 201, fordított szálKRT26KRT27: 40 776 808–40 782 550, fordított szálKRT27KRT28: 40 792 196–40 799 959, fordított szálKRT28KRT10: 40 817 784–40 822 614, fordított szálKRT10KRT12: 40 860 943–40 867 223, fordított szálKRT12KRT20: 40 872 785–40 885 249, fordított szálKRT20KRT23: 40 922 696–40 937 646, fordított szálKRT23KRT39: 40 958 392–40 966 948, fordított szálKRT40: 40 977 715–40 987 135, fordított szálKRTAP3-3: 40 993 430–40 994 164, fordított szálKRTAP3-2: 40 999 193–40 999 906, fordított szálKRTAP3-2KRTAP3-1: 41 008 521–41 019 324, fordított szálKRTAP3-1KRTAP1-5: 41 026 026–41 027 208, fordított szálKRTAP1-5KRTAP1-4: 41 029 351–41 030 195, fordított szálKRTAP1-3: 41 033 884–41 034 874, fordított szálKRTAP1-1: 41 040 541–41 041 450, fordított szálKRTAP2-1: 41 046 541–41 047 316, fordított szálKRTAP2-2: 41 054 498–41 055 230, fordított szálKRTAP2-3: 41 059 240–41 060 114, fordított szálKRTAP2-4: 41 065 116–41 065 879, fordított szálKRTAP4-7: 41 084 150–41 085 144, előre szálKRTAP4-7KRTAP4-8: 41 096 981–41 098 142, fordított szálKRTAP4-8KRTAP4-16: 41 101 502–41 102 209, fordított szálKRTAP4-9: 41 105 389–41 106 488, előre szálKRTAP4-9KRTAP4-11: 41 117 181–41 118 373, fordított szálKRTAP4-12: 41 123 091–41 124 182, fordított szálKRTAP4-6: 41 139 433–41 140 544, fordított szálKRTAP4-5: 41 148 924–41 149 825, fordított szálKRTAP4-4: 41 159 649–41 160 748, fordított szálKRTAP4-3: 41 167 231–41 168 221, fordított szálKRTAP4-3KRTAP4-2: 41 177 446–41 178 221, fordított szálKRTAP4-2KRTAP4-1: 41 184 100–41 184 911, fordított szálKRTAP4-1KRTAP9-1: 41 189 887–41 190 639, előre szálKRTAP9-1KRTAP9-2: 41 226 648–41 227 652, előre szálKRTAP9-3: 41 232 449–41 233 454, előre szálKRTAP9-8: 41 237 999–41 239 004, előre szálKRTAP9-4: 41 249 687–41 250 653, előre szálKRTAP9-4KRTAP9-9: 41 255 384–41 256 364, előre szálKRTAP9-6: 41 265 378–41 265 860, előre szálKRTAP9-6KRTAP9-7: 41 275 698–41 276 207, előre szálKRTAP9-7KRTAP29-1: 41 301 826–41 302 851, fordított szálKRTAP16-1: 41 307 700–41 309 309, fordított szálKRTAP17-1: 41 314 912–41 315 710, fordított szálKRT33A: 41 345 665–41 350 828, fordított szálKRT33AKRT33B: 41 363 498–41 369 813, fordított szálKRT33BKRT34: 41 377 669–41 382 306, fordított szálKRT34KRT31: 41 393 721–41 397 611, fordított szálKRT31KRT37: 41 420 547–41 424 585, fordított szálKRT37KRT38: 41 436 154–41 440 983, fordított szálKRT38KRT32: 41 459 513–41 467 386, fordított szálKRT32KRT35: 41 476 710–41 481 151, fordított szálKRT35KRT36: 41 486 136–41 492 546, fordított szálKRT36KRT13: 41 500 981–41 505 758, fordított szálKRT13KRT15: 41 513 745–41 522 529, fordított szálKRT15KRT19: 41 523 613–41 528 370, fordított szálKRT9: 41 565 836–41 572 059, fordított szálKRT9KRT14: 41 582 279–41 586 896, fordított szálKRT14KRT16: 41 609 778–41 615 899, fordított szálKRT16KRT17: 41 619 437–41 624 842, fordított szálKRT17A KRTAP4-2 ábrája: egy exon a(z) 17. kromoszóma fordított szálán1. exon: 41 177 446–41 178 221, 776 bázis15′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 0,8 kb-jából 0,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 411 bázis kódolja a fehérjét.

KRTAP4-2 szekvenálása

37Közepes

Mennyire nehéz a KRTAP4-2 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A KRTAP4-2 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok kihagyhatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ami tovább nehezíti: a KRTAP4-2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség18%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések44%
  • GC-tartalom55%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). KRTAP4-2 gén: keratin associated protein 4-2. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/krtap4-2

Vancouver

Dante Labs. KRTAP4-2 gén: keratin associated protein 4-2 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/krtap4-2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet