Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

HMCN2

hemicentin 2

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9q34.11
Koordináták
9. kromoszóma: 130 265 760–130 434 123 (GRCh38)
Exonok
98 exon, összesen 168,4 kb
Fehérje
5079 aminosav
Más néven ismert
DKFZp434P0216, FLJ23816
MANE Select transzkriptum
ENST00000683500.2NM_001291815.2
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) HMCN2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A HMCN2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a HMCN2 helyét zárójel jelöli. A HMCN2 és környékén 10 gén a 9. kromoszómán, 129 849 942–130 849 941 között.9. kromoszóma9q34.11p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3130 Mb130,2 Mb130,4 Mb130,6 Mb130,8 MbUSP20: 129 834 698–129 881 842, előre szálUSP20FNBP1: 129 887 179–130 043 243, fordított szálFNBP1GPR107: 130 053 426–130 140 169, előre szálGPR107NCS1: 130 172 315–130 237 737, előre szálNCS1HMCN2: 130 265 760–130 434 123, előre szálHMCN2ASS1: 130 443 282–130 502 361, előre szálASS1FUBP3: 130 578 965–130 638 354, előre szálFUBP3PRDM12: 130 664 594–130 682 986, előre szálPRDM12EXOSC2: 130 693 721–130 707 608, előre szálEXOSC2ABL1: 130 713 043–130 887 675, előre szálABL1: 130 713 626–130 713 724, előre szálA HMCN2 ábrája: 98 exon a(z) 9. kromoszóma előre szálán1. exon: 130 265 760–130 266 137, 378 bázis2. exon: 130 284 603–130 284 673, 71 bázis3. exon: 130 285 158–130 285 316, 159 bázis4. exon: 130 286 188–130 286 310, 123 bázis5. exon: 130 294 855–130 295 026, 172 bázis6. exon: 130 295 666–130 295 772, 107 bázis7. exon: 130 296 674–130 296 794, 121 bázis8. exon: 130 299 025–130 299 288, 264 bázis9. exon: 130 302 857–130 303 001, 145 bázis10. exon: 130 303 487–130 303 608, 122 bázis11. exon: 130 304 730–130 305 002, 273 bázis12. exon: 130 306 129–130 306 270, 142 bázis13. exon: 130 306 811–130 306 938, 128 bázis14. exon: 130 307 453–130 307 566, 114 bázis15. exon: 130 309 912–130 310 061, 150 bázis16. exon: 130 319 495–130 319 695, 201 bázis17. exon: 130 320 356–130 320 451, 96 bázis18. exon: 130 320 776–130 320 903, 128 bázis19. exon: 130 321 787–130 321 931, 145 bázis20. exon: 130 325 595–130 325 707, 113 bázis21. exon: 130 325 811–130 325 970, 160 bázis22. exon: 130 327 310–130 327 475, 166 bázis23. exon: 130 337 894–130 338 021, 128 bázis24. exon: 130 341 111–130 341 365, 255 bázis25. exon: 130 342 350–130 342 436, 87 bázis26. exon: 130 347 166–130 347 360, 195 bázis27. exon: 130 348 545–130 348 675, 131 bázis28. exon: 130 348 984–130 349 131, 148 bázis29. exon: 130 349 537–130 349 663, 127 bázis30. exon: 130 351 423–130 351 577, 155 bázis31. exon: 130 352 927–130 353 205, 279 bázis32. exon: 130 354 763–130 355 044, 282 bázis33. exon: 130 355 746–130 355 854, 109 bázis34. exon: 130 356 088–130 356 257, 170 bázis35. exon: 130 357 834–130 357 988, 155 bázis36. exon: 130 358 390–130 358 486, 97 bázis37. exon: 130 359 319–130 359 414, 96 bázis38. exon: 130 360 428–130 360 604, 177 bázis39. exon: 130 362 008–130 362 165, 158 bázis40. exon: 130 362 867–130 362 990, 124 bázis41. exon: 130 364 714–130 364 889, 176 bázis42. exon: 130 365 631–130 365 727, 97 bázis43. exon: 130 365 876–130 365 995, 120 bázis44. exon: 130 368 276–130 368 437, 162 bázis45. exon: 130 369 570–130 369 851, 282 bázis46. exon: 130 370 964–130 371 131, 168 bázis47. exon: 130 372 294–130 372 407, 114 bázis48. exon: 130 373 038–130 373 124, 87 bázis49. exon: 130 374 502–130 374 693, 192 bázis50. exon: 130 375 563–130 375 736, 174 bázis51. exon: 130 375 876–130 375 989, 114 bázis52. exon: 130 376 516–130 376 658, 143 bázis53. exon: 130 377 649–130 377 799, 151 bázis54. exon: 130 379 249–130 379 467, 219 bázis55. exon: 130 382 184–130 382 297, 114 bázis56. exon: 130 382 679–130 382 866, 188 bázis57. exon: 130 383 504–130 383 600, 97 bázis58. exon: 130 384 373–130 384 534, 162 bázis59. exon: 130 384 685–130 384 798, 114 bázis60. exon: 130 385 560–130 385 762, 203 bázis61. exon: 130 386 443–130 386 524, 82 bázis62. exon: 130 388 409–130 388 540, 132 bázis63. exon: 130 390 977–130 391 120, 144 bázis64. exon: 130 391 204–130 391 363, 160 bázis65. exon: 130 391 450–130 391 574, 125 bázis66. exon: 130 391 935–130 392 118, 184 bázis67. exon: 130 393 212–130 393 309, 98 bázis68. exon: 130 393 742–130 394 008, 267 bázis69. exon: 130 394 385–130 394 575, 191 bázis70. exon: 130 395 027–130 395 108, 82 bázis71. exon: 130 395 211–130 395 347, 137 bázis72. exon: 130 395 924–130 396 065, 142 bázis73. exon: 130 396 169–130 396 313, 145 bázis74. exon: 130 397 528–130 397 655, 128 bázis75. exon: 130 398 551–130 398 707, 157 bázis76. exon: 130 399 511–130 399 632, 122 bázis77. exon: 130 400 783–130 400 947, 165 bázis78. exon: 130 402 789–130 402 896, 108 bázis79. exon: 130 403 194–130 403 328, 135 bázis80. exon: 130 403 741–130 403 875, 135 bázis81. exon: 130 404 869–130 405 059, 191 bázis82. exon: 130 405 955–130 406 168, 214 bázis83. exon: 130 407 571–130 407 705, 135 bázis84. exon: 130 408 743–130 408 933, 191 bázis85. exon: 130 410 571–130 410 652, 82 bázis86. exon: 130 418 772–130 419 041, 270 bázis87. exon: 130 422 577–130 422 726, 150 bázis88. exon: 130 424 776–130 424 913, 138 bázis89. exon: 130 425 009–130 425 130, 122 bázis90. exon: 130 425 687–130 425 924, 238 bázis91. exon: 130 427 313–130 427 375, 63 bázis92. exon: 130 427 497–130 427 619, 123 bázis93. exon: 130 428 358–130 428 489, 132 bázis94. exon: 130 429 557–130 429 685, 129 bázis95. exon: 130 430 284–130 430 604, 321 bázis96. exon: 130 431 367–130 431 486, 120 bázis97. exon: 130 432 429–130 432 555, 127 bázis98. exon: 130 433 348–130 434 123, 776 bázis1102030405060708090985′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 168,4 kb-jából 15,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 15 240 bázis kódolja a fehérjét.

HMCN2 szekvenálása

12Könnyű

Mennyire nehéz a HMCN2 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A HMCN2 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a HMCN2 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések1,1%
  • GC-tartalom59%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). HMCN2 gén: hemicentin 2. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hmcn2

Vancouver

Dante Labs. HMCN2 gén: hemicentin 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hmcn2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet